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"Immunorégulation dans l'athérosclérose: une étude de séquençage d'ARN à cellule unique"

9 juin 2025 mis à jour par: Carlos Vicente Serrano Junior, Hospital Israelita Albert Einstein

L'immunorégulation architecturale dans la maladie athérosclérotique: une approche de séquençage d'ARN unique et de biologie spatiale

L'athérosclérose est la principale cause d'événements cardiovasculaires aigus, tels que l'infarctus du myocarde et l'AVC, et est un facteur de risque important de mortalité cardiovasculaire. La compréhension détaillée des mécanismes immunitaires et des transformations cellulaires impliqués dans la pathogenèse de l'athérosclérose est encore limitée, et l'utilisation du séquençage d'ARN unique (SCRNASEQ) a révélé de nouvelles fonctions cellulaires et sous-populations associées à la progression de la maladie. Cette étude vise à identifier les sous-populations cellulaires, les voies moléculaires et les changements dans l'expression des gènes liés au développement de l'athérosclérose dans les artères coronaires humaines. En utilisant Scrnaseq, l'étude cherche à caractériser le paysage transcriptomique des cellules présentes dans les plaques athérosclérotiques et à identifier les signatures moléculaires qui révèlent des prédispositions individuelles à des phénotypes spécifiques, tels que la sensibilité à la maladie et la réponse aux thérapies. La recherche sera menée à l'hôpital israélien d'Albert Einstein de São Paulo et impliquera des échantillons des artères coronaires et des plaques athérosclérotiques des cœurs explantés des patients qui ont subi des transplantations cardiaques ainsi que du matériel écarté de la chirurgie du greffage du pontage coronarien (CABG). Avec une taille d'échantillon estimée de 20 à 30 plaques, les données obtenues permettra une analyse détaillée des mécanismes moléculaires impliqués dans l'athérosclérose, contribuant au développement de cibles thérapeutiques spécifiques.

Aperçu de l'étude

Statut

Pas encore de recrutement

Description détaillée

Il s'agit d'une étude d'observation prospective qui sera menée avec des échantillons d'artères coronaires et de plaques athérosclérotiques des cœurs explantés des patients atteints de cardiomyopathie ischémique qui ont subi des transplantations cardiaques ainsi que des matériaux jetés de la chirurgie du greffon de byllon coronarien. Les échantillons de plaque athérosclérotique seront récupérés des artères coronaires pendant la chirurgie de la greffe ou la procédure de CABG et transportées au laboratoire dans les 2 heures. Les artères sélectionnées seront disséquées et évaluées au microscope, et les échantillons seront fixés dans du formol, intégrés dans de la paraffine et colorés pour l'analyse histologique. Le tissu sera dissocié enzymatiquement pour obtenir des cellules individuelles, qui seront ensuite filtrées et évaluées pour la viabilité cellulaire. Les cellules subiront un séquençage d'ARN unique (SCRNASEQ) dans le but d'analyser environ 5 000 à 10 000 cellules par échantillon. La taille de l'échantillon sera de 20 à 30 plaques, dans le but de capturer les principales populations cellulaires et d'effectuer une analyse robuste.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

30

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

    • SP
      • São Paulo, SP, Brésil, 05652-900
        • Hospital israelita Albert Einstein

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Les patients diagnostiqués avec une cardiomyopathie ischémique due à une athérosclérose avancée, subissant une transplantation cardiaque.

La description

Critères d'inclusion:

  • Les patients diagnostiqués avec une cardiomyopathie ischémique due à une athérosclérose avancée, subissant une transplantation cardiaque;
  • Les patients atteints d'une maladie coronarienne soumis à la chirurgie de greffe de pontage coronarien (CABG). "
  • Âgé de 40 à 75 ans;
  • Formulaire de consentement éclairé signé.

Critères d'exclusion:

  • Les patients atteints de maladies inflammatoires ou auto-immunes systémiques;
  • Antécédents de cancer au cours des 5 dernières années ou malignité active;
  • Utilisation récente (au cours des 6 derniers mois) de la thérapie immunosuppressive.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Plaques coronaires du cœur explanté
Les artères sélectionnées seront disséquées et évaluées au microscope, et les échantillons seront fixés dans du formol, intégrés dans de la paraffine et colorés pour l'analyse histologique. Le tissu sera dissocié enzymatiquement pour obtenir des cellules individuelles, qui seront ensuite filtrées et évaluées pour la viabilité cellulaire. Les cellules subiront un séquençage d'ARN unique (SCRNASEQ) dans le but d'analyser environ 5 000 à 10 000 cellules par échantillon. La taille de l'échantillon sera de 20 à 30 plaques, dans le but de capturer les principales populations cellulaires et d'effectuer une analyse robuste.

Retraitement

La normalisation des données, la réduction de la dimensionnalité et le clustering seront effectués à l'aide du package SEURAT (basé sur R).

Les types de cellules seront identifiés sur la base de l'expression du gène du marqueur canonique. Identification de la sous-population cellulaire

Les grappes seront annotées sur la base des signatures de types de cellules connues (par exemple, les cellules endothéliales, les cellules musculaires lisses, les macrophages, etc.).

L'analyse de l'expression des gènes différentielle sera menée pour identifier les gènes associés à la maladie.

Enrichissement de la voie et de la fonction

L'analyse d'enrichissement des ensembles de gènes (GSEA) et les analyses de voies (par exemple, Kegg, Reactome) seront effectuées pour étudier les processus biologiques et les voies stimulant l'athérosclérose.

Contrôle de qualité

Les lectures de séquençage seront évaluées pour la qualité à l'aide de FastQC, et les lectures de faible qualité seront filtrées.

Le logiciel Cell Ranger (génomique 10x) sera utilisé pour aligner les lectures sur le génome humain et quantifier l'expression des gènes au niveau unique.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Concentration de grappes de cellules spécifiques et de sous-populations de macrophages / linfocites: créez un atlas monocellulaire à haute résolution de plaques athérosclérotiques.
Délai: Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
Déterminer la concentration de grappes cellulaires avec des sous-populations inflammatoires spécifiques déterminant pour créer un atlas unique à haute résolution des plaques athérosclérotiques, révélant des changements transcriptionnels spécifiques aux cellules associés à la maladie. Les résultats pourraient identifier de nouvelles cibles thérapeutiques d'intervention dans l'athérosclérose et améliorer la compréhension de sa pathogenèse moléculaire.
Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Concentration d'interleukines et de sous-types cellulaires par flux de citomètre à l'identification des signatures moléculaires dans l'athérosclérose
Délai: Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
L'objectif secondaire est d'identifier les signatures moléculaires qui révèlent des prédispositions individuelles à des phénotypes spécifiques, tels que la sensibilité à l'athérosclérose, la réponse aux thérapies et à d'autres caractéristiques de santé, établissant les bases de la médecine de précision et des études de santé de la population en Brésil en déterminant des concentrations spécifiques de pro et anti-inflammatoires molécules et types de cellules.
Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Estimé)

25 juin 2025

Achèvement primaire (Estimé)

25 octobre 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

25 avril 2027

Dates d'inscription aux études

Première soumission

24 février 2025

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

28 février 2025

Première publication (Réel)

6 mars 2025

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

10 juin 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

9 juin 2025

Dernière vérification

1 juin 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

OUI

Description du régime IPD

Les données SCRNA-SEQ et les scripts R utilisés dans l'analyse de cette étude seront disponibles auprès de l'auteur correspondant sur demande.

Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD

  • PROTOCOLE D'ÉTUDE
  • SÈVE
  • RSE

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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