- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT06860295
"Immunorégulation dans l'athérosclérose: une étude de séquençage d'ARN à cellule unique"
L'immunorégulation architecturale dans la maladie athérosclérotique: une approche de séquençage d'ARN unique et de biologie spatiale
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Carlos Vicente Serrano, PhD
- Numéro de téléphone: +55 (11) 2151-5408
- E-mail: carlos.sjunior@einstein.br
Lieux d'étude
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SP
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São Paulo, SP, Brésil, 05652-900
- Hospital israelita Albert Einstein
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critères d'inclusion:
- Les patients diagnostiqués avec une cardiomyopathie ischémique due à une athérosclérose avancée, subissant une transplantation cardiaque;
- Les patients atteints d'une maladie coronarienne soumis à la chirurgie de greffe de pontage coronarien (CABG). "
- Âgé de 40 à 75 ans;
- Formulaire de consentement éclairé signé.
Critères d'exclusion:
- Les patients atteints de maladies inflammatoires ou auto-immunes systémiques;
- Antécédents de cancer au cours des 5 dernières années ou malignité active;
- Utilisation récente (au cours des 6 derniers mois) de la thérapie immunosuppressive.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Plaques coronaires du cœur explanté
Les artères sélectionnées seront disséquées et évaluées au microscope, et les échantillons seront fixés dans du formol, intégrés dans de la paraffine et colorés pour l'analyse histologique.
Le tissu sera dissocié enzymatiquement pour obtenir des cellules individuelles, qui seront ensuite filtrées et évaluées pour la viabilité cellulaire.
Les cellules subiront un séquençage d'ARN unique (SCRNASEQ) dans le but d'analyser environ 5 000 à 10 000 cellules par échantillon.
La taille de l'échantillon sera de 20 à 30 plaques, dans le but de capturer les principales populations cellulaires et d'effectuer une analyse robuste.
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Retraitement La normalisation des données, la réduction de la dimensionnalité et le clustering seront effectués à l'aide du package SEURAT (basé sur R). Les types de cellules seront identifiés sur la base de l'expression du gène du marqueur canonique. Identification de la sous-population cellulaire Les grappes seront annotées sur la base des signatures de types de cellules connues (par exemple, les cellules endothéliales, les cellules musculaires lisses, les macrophages, etc.). L'analyse de l'expression des gènes différentielle sera menée pour identifier les gènes associés à la maladie. Enrichissement de la voie et de la fonction L'analyse d'enrichissement des ensembles de gènes (GSEA) et les analyses de voies (par exemple, Kegg, Reactome) seront effectuées pour étudier les processus biologiques et les voies stimulant l'athérosclérose. Contrôle de qualité Les lectures de séquençage seront évaluées pour la qualité à l'aide de FastQC, et les lectures de faible qualité seront filtrées. Le logiciel Cell Ranger (génomique 10x) sera utilisé pour aligner les lectures sur le génome humain et quantifier l'expression des gènes au niveau unique. |
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Concentration de grappes de cellules spécifiques et de sous-populations de macrophages / linfocites: créez un atlas monocellulaire à haute résolution de plaques athérosclérotiques.
Délai: Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
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Déterminer la concentration de grappes cellulaires avec des sous-populations inflammatoires spécifiques déterminant pour créer un atlas unique à haute résolution des plaques athérosclérotiques, révélant des changements transcriptionnels spécifiques aux cellules associés à la maladie.
Les résultats pourraient identifier de nouvelles cibles thérapeutiques d'intervention dans l'athérosclérose et améliorer la compréhension de sa pathogenèse moléculaire.
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Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Concentration d'interleukines et de sous-types cellulaires par flux de citomètre à l'identification des signatures moléculaires dans l'athérosclérose
Délai: Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
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L'objectif secondaire est d'identifier les signatures moléculaires qui révèlent des prédispositions individuelles à des phénotypes spécifiques, tels que la sensibilité à l'athérosclérose, la réponse aux thérapies et à d'autres caractéristiques de santé, établissant les bases de la médecine de précision et des études de santé de la population en Brésil en déterminant des concentrations spécifiques de pro et anti-inflammatoires molécules et types de cellules.
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Grâce à l'achèvement de l'étude, en moyenne 1 an et demi.
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Publications et liens utiles
Publications générales
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