Aplicación de la Metagenómica Clínica en el Diagnóstico de Ascitis

La infección del líquido ascítico es una complicación grave asociada a una alta morbimortalidad. Este líquido a menudo está colonizado por bacterias que pueden causar infección del peritoneo y posiblemente sepsis. Muchas bacterias del microbioma intestinal humano no se pueden cultivar con métodos estándar; por lo tanto, parece probable que muchas de las bacterias relevantes no se descubran en los diagnósticos de rutina, pero pueden ser relevantes para la patogénesis. Los enfoques independientes del cultivo, como NGS (Next generation Sequencing), en principio han hecho posible estudiar o probar la colonización microbiana compleja. Debido a que NGS es una tecnología relativamente nueva, los protocolos de diagnóstico microbiológico deben personalizarse y refinarse aún más para integrarse con el flujo de trabajo de diagnóstico estándar, si es necesario. Para el diagnóstico microbiológico, se recolecta material de los pacientes con ascitis apropiados y se envía para diagnóstico microbiológico. Posteriormente se realizan los diagnósticos culturales como parte de la atención al paciente en el hospital universitario. En este estudio, los investigadores planean usar estas muestras para analizar y comparar la presencia de bacterias por NGS en paralelo con el diagnóstico de cultivo, y luego compararlo con el microbioma intestinal de los pacientes, para comprender el posible efecto del microbioma en la patogenia de la ascitis y resultado.