Aplicação da Metagenômica Clínica no Diagnóstico da Ascite

A infecção do líquido ascítico é uma complicação grave associada a alta morbidade e mortalidade. Esse fluido geralmente é colonizado por bactérias que podem causar infecção do peritônio e possivelmente sepse. Muitas bactérias do microbioma intestinal humano não podem ser cultivadas por métodos padrão; portanto, parece provável que muitas das bactérias relevantes não sejam descobertas em diagnósticos de rotina, mas podem ser relevantes para a patogênese. Abordagens independentes de cultura, como NGS (Sequenciamento de próxima geração), em princípio, tornaram possível estudar ou provar a colonização microbiana complexa. Como o NGS é uma tecnologia relativamente nova, os protocolos de diagnóstico microbiológico precisam ser ainda mais personalizados e refinados para integração com o fluxo de trabalho de diagnóstico padrão, se necessário. Para diagnóstico microbiológico, o material é coletado dos pacientes com ascite apropriados e enviado para diagnóstico microbiológico. Em seguida, são realizados os diagnósticos culturais como parte do atendimento ao paciente no hospital universitário. Neste estudo, os investigadores planejam usar essas amostras para analisar e comparar a presença de bactérias por NGS em paralelo com o diagnóstico de cultura e, em seguida, compará-lo com o microbioma intestinal dos pacientes, para entender o possível efeito do microbioma na patogênese da ascite e resultado.