CNV:n uudelleentulkinta, jolla on tuntematon merkitys: 5 vuoden retrospektiivinen analyysi (ReAC)
Intérêt de la réinterprétation Des CNV de Signification Inconnue Mis en évidence Par ACPA
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Array-CGH on etulinjan tekniikka monissa geneettisissä indikaatioissa sekä synnytystä edeltävissä että postnataalisissa olosuhteissa. Se mahdollistaa kromosomien uudelleenjärjestelyjen (esimerkiksi päällekkäisyyden tai deleetioiden) havaitsemisen rutiininomaisesti. Näiden kopiomäärämuunnelmien tai CNV:iden tulkinta ja luokittelu on olennaista, mutta monimutkaista. Se edellyttää vaihtelun systemaattista ja menetelmällistä analysointia tieteellisen kirjallisuuden kontekstissa. Kun nämä versiot eivät täytä patogeenisuus- tai hyvänlaatuisuuskriteerejä, niitä kutsutaan vaihteluksi, jonka merkitys on tuntematon (tai VUS). Niiden osuus tarkistuksista on merkittävä, jopa 75 % (Palmer et al., 2013).
VUS:n havaitseminen ei useimmissa tapauksissa mahdollista diagnoosia ja vaatii usein muiden kalliiden tekniikoiden käyttöä. Ihmisen vaikutus voi olla merkittävä myös mahdollisen geneettisen neuvonnan puuttuessa (esim. tulevan raskauden yhteydessä). VUS:n uudelleenanalyysi on erittäin kiinnostava ainakin kahdesta syystä: (1) ensimmäinen, jos se luokitellaan hyvänlaatuiseksi, mahdollistaa muunnelman tutkimuksen päättämisen, muiden johtajien huomioimisen ilman taka-ajatuksia ja rauhoittaa potilaalle variantin patogeenisuuden puuttumisesta. (2) jos VUS on lopulta patogeeninen, tämä mahdollistaa taudin nimeämisen potilaalle, geneettisen neuvonnan täsmentämisen, pitkän ja kalliin lisätutkimuksen välttämiseksi ja mahdollisesti hoidon ehdottamisen.
Tällä hetkellä VUS:n voi analysoida uudelleen laboratoriossa määräävän lääkärin tai mahdollisesti toisen lääkärin pyynnöstä. Tällä hetkellä ei kuitenkaan ole käytössä systemaattista uudelleenanalyysimenettelyä.
Vaikka nämä tuntemattomien merkityksien muunnelmat ovat yleisiä ja ovat tärkeä kysymys, tietojemme mukaan järjestelmällistä tietokantatutkimusta ei ole tehty. Joitakin vastaavia töitä on kuitenkin tehty lyhyemmän ajanjakson aikana tai tapauskohtaisesti, mikä osoittaa kiinnostusta tämäntyyppistä lähestymistapaa kohtaan (Palmer et al., 2014).
Itse asiassa näyttää oleelliselta määrittää tällaisten vaihteluiden uudelleenanalyysin edut useissa eri muodoissa: diagnostisissa, taloudellisissa ja inhimillisissä.
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Ilmoittautuminen
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Nancy, Ranska
- Lorraine University
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- AIKUINEN
- OLDER_ADULT
- LAPSI
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Allekirjoitettu suostumus array-CGH:lle (lupa biologisen näytteen säilyttämiseen ja sen myöhempään käyttöön tutkimusten jatkamiseen);
- array-CGH suoritettu genetiikan laboratoriossa Nancyssa 1. tammikuuta 2010 ja 31. joulukuuta 2017 välisenä aikana (raportin validointipäivämäärä huomioon ottaen);
- Sellaisten muunnelmien tunnistaminen, joilla on tuntematon kliininen merkitys.
Poissulkemiskriteerit:
- ei mitään
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Ryhmien/kohorttien lukumäärä
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/KohorttiRyhmä/Kohortti |
Interventio / HoitoInterventio / Hoito |
|---|---|
|
Kohortti
ei väliintuloa.
|
Tuntemattoman merkityksen CNV:n uudelleentulkinta
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Määritä CNV-arvojen uudelleenluokittelun yleinen määrä ja vuosikohtainen uudelleenluokittelun kaikkien vuosien 2010 ja 2016 välisenä aikana VUS:iksi tunnistetun järjestelmällisen analyysin jälkeen.
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Patogeenisten varianttien osuus vastaa patogeenisten varianttien prosenttiosuutta kaikkien uudelleenluokiteltujen varianttien joukossa.
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Määritä patogeenisten muunnelmien osuus uudelleen luokitelluista CNV:istä;
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Patogeenisten varianttien osuus vastaa patogeenisten varianttien prosenttiosuutta kaikkien uudelleenluokiteltujen varianttien joukossa.
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
|
Määritä uusien diagnoosien osuus taudinaiheuttajiksi uudelleen luokitelluista CNV:istä;
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Uusien diagnoosien osuus vastaa niiden potilaiden osuutta, joiden patogeenisyys liittyy patologiaan, kaikkien ratkaistujen patogeenisten varianttien joukossa.
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
|
Vertaa CNV:iden uudelleenluokittelunopeutta tyypin mukaan (poisto/kopiointi)
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Uudelleenluokituksen tyyppi määritellään joko deleetiolla tai kromosomaalisen duplikoinnin avulla
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
|
Vertaa CNV:n kokoa muunnelman uudelleenluokituksen tyypin mukaan.
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
in bp
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
|
Vertaa uudelleenluokitteluprosenttia sairauden tyypin mukaan.
Aikaikkuna: heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Seuraavat tilat otetaan huomioon: synnytystä edeltävä/postnataalinen; kehitysvamma tai hermoston kehityshäiriö/epämuodostuma/muu.
|
heinäkuun 2019 ja marraskuun 2019 välisenä aikana
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Lambert Laëtitia, MD, PhD, CHRU Nancy, Lorraine University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- ReAC
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .