CNV:n uudelleentulkinta, jolla on tuntematon merkitys: 5 vuoden retrospektiivinen analyysi (ReAC)

Array-CGH on etulinjan tekniikka monissa geneettisissä indikaatioissa sekä synnytystä edeltävissä että postnataalisissa olosuhteissa. Se mahdollistaa kromosomien uudelleenjärjestelyjen (esimerkiksi päällekkäisyyden tai deleetioiden) havaitsemisen rutiininomaisesti. Näiden kopiomäärämuunnelmien tai CNV:iden tulkinta ja luokittelu on olennaista, mutta monimutkaista. Se edellyttää vaihtelun systemaattista ja menetelmällistä analysointia tieteellisen kirjallisuuden kontekstissa. Kun nämä versiot eivät täytä patogeenisuus- tai hyvänlaatuisuuskriteerejä, niitä kutsutaan vaihteluksi, jonka merkitys on tuntematon (tai VUS). Niiden osuus tarkistuksista on merkittävä, jopa 75 % (Palmer et al., 2013).

VUS:n havaitseminen ei useimmissa tapauksissa mahdollista diagnoosia ja vaatii usein muiden kalliiden tekniikoiden käyttöä. Ihmisen vaikutus voi olla merkittävä myös mahdollisen geneettisen neuvonnan puuttuessa (esim. tulevan raskauden yhteydessä). VUS:n uudelleenanalyysi on erittäin kiinnostava ainakin kahdesta syystä: (1) ensimmäinen, jos se luokitellaan hyvänlaatuiseksi, mahdollistaa muunnelman tutkimuksen päättämisen, muiden johtajien huomioimisen ilman taka-ajatuksia ja rauhoittaa potilaalle variantin patogeenisuuden puuttumisesta. (2) jos VUS on lopulta patogeeninen, tämä mahdollistaa taudin nimeämisen potilaalle, geneettisen neuvonnan täsmentämisen, pitkän ja kalliin lisätutkimuksen välttämiseksi ja mahdollisesti hoidon ehdottamisen.

Tällä hetkellä VUS:n voi analysoida uudelleen laboratoriossa määräävän lääkärin tai mahdollisesti toisen lääkärin pyynnöstä. Tällä hetkellä ei kuitenkaan ole käytössä systemaattista uudelleenanalyysimenettelyä.

Vaikka nämä tuntemattomien merkityksien muunnelmat ovat yleisiä ja ovat tärkeä kysymys, tietojemme mukaan järjestelmällistä tietokantatutkimusta ei ole tehty. Joitakin vastaavia töitä on kuitenkin tehty lyhyemmän ajanjakson aikana tai tapauskohtaisesti, mikä osoittaa kiinnostusta tämäntyyppistä lähestymistapaa kohtaan (Palmer et al., 2014).

Itse asiassa näyttää oleelliselta määrittää tällaisten vaihteluiden uudelleenanalyysin edut useissa eri muodoissa: diagnostisissa, taloudellisissa ja inhimillisissä.