Reinterpretación de CNV con significado desconocido: un análisis retrospectivo de 5 años (ReAC)

Array-CGH es una técnica de primera línea en muchas indicaciones genéticas tanto en entornos prenatales como posnatales. Permite la detección de reordenamientos cromosómicos (duplicación o deleción por ejemplo) en rutina. La interpretación y clasificación de estas variaciones del número de copias o CNVs es esencial pero compleja. Requiere un análisis sistemático y metódico de la variación en el contexto de la literatura científica. Cuando estas revisiones no cumplen con los criterios de patogenicidad o benignidad, se las denomina variación de significado desconocido (o VUS). Representan una proporción significativa de las revisiones hasta el 75% (Palmer et al., 2013).

La detección de VUS no permite, en la mayoría de los casos, un diagnóstico y, a menudo, requiere el uso de otras técnicas costosas. El impacto humano también puede ser significativo en ausencia de un posible asesoramiento genético (p. ej., en el contexto de un futuro embarazo). El reanálisis de una VUS es de gran interés por lo menos por dos razones: (1) la primera, si se clasifica como benigna, permite cerrar la investigación de la variante, considerar otras pistas sin motivos ocultos y tranquilizar a la paciente sobre la ausencia de patogenicidad de la variante. (2) si el VUS es finalmente patógeno, esto permite nombrar la enfermedad para el paciente, especificar el consejo genético, evitar una investigación más larga y costosa y posiblemente proponer un tratamiento.

Actualmente, el laboratorio puede volver a analizar VUS a pedido del médico que prescribe o posiblemente de otro médico. Sin embargo, actualmente no existe ningún procedimiento de reanálisis sistemático.

Aunque estas variaciones de significados desconocidos son frecuentes y representan un problema importante, hasta donde sabemos, no se ha llevado a cabo ningún estudio sistemático de bases de datos. Sin embargo, se han llevado a cabo algunos trabajos similares durante un período más corto o ad hoc, lo que muestra un interés en este tipo de enfoque (Palmer et al., 2014).

En efecto, parece fundamental determinar el interés de reanalizar dichas variaciones en varias modalidades: diagnóstica, económica y humana.