- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT00090441
Risk Burden of Lipoprotein Metabolic Gene Haplotypes
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
BACKGROUND:
In recent years, a number of candidate genetic variants (e.g., single nucleotide polymorphisms, SNPs) have been reported to be associated with coronary heart disease (CHD). However, these association studies have suffered from variability and failures of replication. This may result in part from selection of marker SNPs in linkage disequilibrium (LD) with true disease-related SNPs or with other effect-modulating genetic variants. Other issues include the play of chance in samples of limited size, population stratification artifacts, and small effect size for single SNPs. A recent discovery is that the genome is organized into largely invariant DNA fragments at the population level characterized by infrequent recombination events interspersed with "hotspots" of recombination and designated "haplotype blocks". These haplotype blocks can be determined by creating a dense map of SNPs across the gene of interest and analyzing population level LD. A few SNPs then can be chosen that designate ("tag") each haplotype block and used to comprehensively assess disease associations across the entire gene. Applying this approach to multiple genes in pathways critical to vascular health and assessing combinations of genes is likely to increase the power to discover genetic associations with CHD risk.
DESIGN NARRATIVE:
The study will establish high density SNP maps across exons, splice regions, and 5' and 3' regulatory regions of 6 genes that play key roles in lipoprotein transport and metabolism (ABCA1, CETP, LCAT, HL, LPL, SRB1); introns will be examined for 2 of the genes (CETP, LPL). By analyzing combinations of haplotype-tagging (ht) SNPs, "genetic burden" can be scored and correlated with CHD risk at 4 levels: 1) biomarker (lipid/lipoprotein levels), 2) anatomic (angiographic) CHD, 3) clinical outcome (death/MI), and 4) (exploratory) response to lipid-lowering. Testing will be performed in 3 large, distinct, but complementary Utah populations at primary or secondary risk of premature CHD. Testing will occur in 2 stages to establish reproducibility: an initial screening phase followed by a confirmation phase (for genetic markers and combinations showing promise) in a larger, independent sample. The study will employ novel methods that combine high-throughput SNP discovery and genotyping capability with genetic epidemiological methods to identify the haplotype blocks within and surrounding the genes of interest, identify htSNPs, and assess disease associations with individual and combinations of htSNPs ("genetic burden"). To this, the study brings large, well characterized databases, assembled and followed for up to 9 years, which will be further expanded under the current project.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
---|
To discover all common single nucleotide polymorphisms among a set of 6 key genes in the reverse cholesterol transport system and test them for associations with angiographic coronary artery disease.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Jeffrey Anderson, MD, Intermountain Health Care; University of Utah School of Medicine
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 1265
- 5R01HL071878-04 (Yhdysvaltain NIH-apuraha/sopimus)
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Sydänsairaudet
-
Region SkaneIlmoittautuminen kutsustaSydämen vajaatoiminta New York Heart Associationin (NYHA) luokka II | Sydämen vajaatoiminta New York Heart Associationin (NYHA) luokka IIIRuotsi
-
Medical University of BialystokInstitute of Cardiology, Warsaw, Poland; Medical University of Lodz; Poznan... ja muut yhteistyökumppanitEi vielä rekrytointiaSystolinen sydämen vajaatoiminta | Sydämen vajaatoiminta pienentyneellä ejektiofraktiolla | Sydämen vajaatoiminta New York Heart Associationin luokka IV | Sydämen vajaatoiminta New York Heart Associationin luokka IIIPuola
-
Mathematica Policy Research, Inc.University of Pennsylvania; University of California, San Francisco; Arnold... ja muut yhteistyökumppanitAktiivinen, ei rekrytointiKeuhkokuume | COPD | CHF - Congestive Heart FailureYhdysvallat
-
Novartis PharmaceuticalsValmisPotilaat, jotka päättivät onnistuneesti ydintutkimuksen 12 kuukauden hoitojakson (de Novo Heart Recipipient), jotka olivat kiinnostuneita EC-MPS-hoidosta
-
University of WashingtonAmerican Heart AssociationValmisSydämen vajaatoiminta, kongestiivinen | Mitokondrioiden muutos | Sydämen vajaatoiminta New York Heart Associationin luokka IVYhdysvallat
-
CHX Technologies Inc.The Research Institute of St Joe's Hamilton; St. Joseph's Health System...Ei vielä rekrytointiaDialyysi | COPD (krooninen obstruktiivinen keuhkosairaus) | Krooninen aineenvaihduntahäiriö | Congestive Heart Failure (CHF)