Tutkimus SNP:iden vaikutuksesta p53- ja p53-vasteelementeissä tulehdusvasteeseen DNA-vaurioille
SNP:iden vaikutus p53- ja p53-vasteelementeissä tulehdusvasteeseen DNA-vaurioille
Tausta:
- Tutkimukset ovat osoittaneet, että tietyt solujen proteiinit voivat liittyä suurempiin tulehduksiin, kasvaimiin ja muihin lääketieteellisiin ongelmiin. Tutkimalla, kuinka terveiden vapaaehtoisten verisolut reagoivat ympäristöaltistukseen, tutkijat toivovat ymmärtävänsä paremmin geenien, ympäristötekijöiden ja ihmisten sairauksien välistä suhdetta.
Tavoitteet:
- Tutkia, miten verisolujen tietyt geenit ja proteiinit reagoivat ympäristöaltistukseen.
Kelpoisuus:
- Terveet vapaaehtoiset 18–45-vuotiaat.
Design:
- Tutkimus sisältää yhden 45-60 minuutin vierailun.
- Osallistujat seulotaan lyhyellä fyysisellä tutkimuksella ja sormella sen määrittämiseksi, ovatko he oikeutettuja luovuttamaan verta tutkimukseen, ja he täyttävät kyselylomakkeen mahdollisista lääkkeistä tai muista huumeista (esim. savukkeista).
- Osallistujat toimittavat verinäytteen tutkimustarkoituksiin.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä tutkimustutkimus tutkii SNP:iden roolia p53- ja p53-vasteelementeissä DNA-vaurioiden tulehdusvasteessa. Yhteensä 200 vähintään 18-vuotiasta osallistujaa, joilla on yksi viidestä kiinnostavasta SNP:stä ja villityypin kontrollista, tunnistetaan ja rekrytoidaan Environmental Polymorphism Registry (EPR) -rekisteristä. Lisäksi osallistujat rekrytoidaan heidän terveystulostensa ja SNP-yhdistysten perusteella EPR-rekisteristä tutkimaan genotyyppi-fenotyyppivaikutuksia lymfosyytteihin. EPR on pitkäaikainen hanke, jossa kerätään ja säilytetään jopa 15 000 DNA-näytettä tutkimusta varten henkilöiltä Pohjois-Carolinan kolmion alueella.
Tämä havainnollinen geeniassosiaatiotutkimus värvää osallistujia genotyypin tai fenotyypin perusteella ja sitten tarkkailee lymfosyyttien vastetta kemoterapeuttisille aineille ja asiaankuuluville ympäristöpatogeeneille. Kiinnostavat SNP:t ovat p53, samoin kuin neljä sen alavirran kohdegeeniä, mukaan lukien FLT1, MDM2, TLR8 ja RRM1. Jokaiselta osallistujalta saadaan enintään 320 ml verta yhden noin tunnin kestävän käynnin aikana. Luovutetuista verinäytteistä otetuista soluista tutkitaan niiden vaste altistuneelle ympäristöstressille ex vivo.
Ensisijainen tavoite on määrittää viiden SNP:n ja p53-kohdegeenin ilmentymisen välinen yhteys Nutlinille tai doksorubisiinille (kemoterapeuttiset aineet) altistuksen jälkeen RT-PCR:llä mitatun tuloksen kanssa. Viisi SNP:tä ovat p53 rs1042522, MDM2 rs2279744, FLT1 C-677T, TLR8 rs3761624 ja RMM1 rs1465952. Toissijaiset tavoitteet ovat: (1) määrittää p53-promoottorin käyttöaste ChIP-analyysillä mitattuna seuraaville SNP:ille: FLT1 C-677T, TLR8 rs3761624 ja RMM1 rs1465952; (2) apoptoosin mittaamiseksi anneksiini V-PI -määrityksellä p53 rs1042522 SNP:ille; (3) tutkia solusyklin profiilianalyysi (FACS) sytofluorometrialla p53 rs1042522SNP:ille; ja (4) DNA-korjauksen määrittäminen käyttämällä pulssikenttäelektroforeesigeeliä (TAFE-geelit) seuraaville p53 rs1042522SNP:ille. Lisäksi tutkitaan kiinnostavien SNP:iden ja fenotyyppisten ominaisuuksien välistä yhteyttä käyttämällä EPR-terveys- ja altistustutkimusta merkittävien genotyyppi-fenotyyppi-assosiaatioiden tunnistamiseksi EPR-populaatiossa. Assosiaatioiden vaikutusta testataan lymfosyyttien toimintaan Nutlinille tai doksorubisiinille altistuksen jälkeen.
Olemme todenneet, että p53 voi muuttaa suuresti monien immuunigeenien ilmentymistä, mukaan lukien useimmat toll-like reseptorin (TLR) synnynnäiset immuniteettigeenit, joita pidetään HIV-infektion vastaisen antiviraalisen immuniteetin tärkeinä komponentteina. Ottaen huomioon TLR-signaloinnin ainutlaatuiset roolit akuutin HIV-1-infektion aikana ja niiden potentiaalisen roolin kroonisessa tulehduksessa, on tärkeää selvittää, vaikuttavatko TLR-polymorfismit HIV-1:n patogeneesiin ja taudin etenemisen vaihteluun.
Äskettäin vahvistimme, että p53 voi kohdistaa TLR8 ssRNA -responsiiviseen reseptoriin yhdellä nukleotidipolymorfismista (SNP) riippuvaisella tavalla (rs3761624). Olemme osoittaneet ihmistutkimuksessa, että SNP TLR8-promoottorin p53-vasteelementissä voi vaikuttaa voimakkaasti hengityselinten synsyyttivirukseen (RSV) liittyvään sairauteen imeväisillä. Lisäksi p53:n koodaavalla alueella on SNP:itä, jotka muuttavat tälle proteiinille kuuluvan signaloinnin amplitudia. Projisoimalla nämä löydökset HIV:hen ja AIDSiin, oletamme, että p53 on alavirran efektori, joka käynnistää antiproliferatiiviset synnynnäiset immuunivasteet viruksille ja muille patogeeneille, mikä luo p53:lle uuden roolin. Nämä uudet tutkimukset antavat kriittisen ymmärryksen synnynnäisten restriktiotekijöiden roolista HIV-1-resistenssissä ja taudin etenemisessä.
Kaiken kaikkiaan toivomme, että tämän tutkimuksen tulokset johtavat tärkeän tiedon löytämiseen p53- ja p53-vasteelementeissä sijaitsevien SNP:iden roolista ihmisen sairauksissa, mikä mahdollisesti tunnistaa uusia kohteita tulevia tutkimuksia varten.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
North Carolina
-
Research Triangle Park, North Carolina, Yhdysvallat
- NIEHS Clinical Research Unit (CRU)
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
- SISÄLLYTTÄMISKRITEERIT:
- Mies tai nainen 18 vuotta täyttänyt
- Osallistujien on kyettävä ymmärtämään ja antamaan kirjallinen tietoinen suostumus osallistua tutkimukseen
- Osallistujien on voitava matkustaa CRU:lle
- Ei-raskaana
- Terveet osallistujat Kansainvälisen Punaisen Ristin ohjeiden mukaisesti (Terve tarkoittaa, että henkilö voi hyvin ja voi suorittaa normaaleja toimintoja. Jos henkilöllä on krooninen sairaus, kuten diabetes tai korkea verenpaine, terve tarkoittaa myös sitä, että häntä hoidetaan ja tila on hallinnassa).
- Osallistujat, joiden terveystulokset on tunnistettu genotyyppi-fenotyyppi-assosiaatiotutkimuksilla.
- Lääkehoidossa oleva HIV-1-seropositiivinen (vain HIV P53- ja TLR8-ryhmät) (tarkastetaan 6 kuukauden välein käynnillä)
POISTAMISKRITEERIT:
- Immunosuppressanttien tai muiden immuunijärjestelmää muokkaavien lääkkeiden käyttö [esim. Rituxan, Humira, Enbrel, syklosporiini (Neoral, Sandimmune ja SangCya), atsatiopriini (Imuran)], monoklonaaliset vasta-aineet [esim. infliksimabi (vain Remicade)] (terveille kontrolleille)
- Inhaloitavien systeemisten steroidien krooninen käyttö
- Reseptimääräisten paikallisten kortikosteroidien nykyinen tai käyttö viimeisen 7 päivän aikana
- Syövän historia, mukaan lukien ihosyöpä (vain terveille verrokeille)
- Aiempi kemoterapia tai sädehoito (vain terveille verrokeille)
- Vahvistettu tai epäilty immuunivastetta heikentävä tai immuunipuutostila (vain terveille kontrolleille)
- Hepatiitti B/C -positiivinen tila (tarkastetaan 6 kuukauden välein käynnillä)
- Paino < 50 kg (<110 lbs)
Jos luovutettu verta ylittää 200 ml:
- Hematokriitti <34% naisilla tai <36% miehillä tai >56% kummallakaan sukupuolella
- Lämpötila > 37,6 C; verenpaine < 90/50 mm Hg tai verenpaine > 160/100 mm Hg; syke < 50 tai > 100 lyöntiä minuutissa
- Veren tai plasman luovutus, jonka seurauksena osallistuja ylittää 550 ml verta viimeisen 8 viikon aikana
HIV1-luovuttajat, joilla on opportunistisia infektioita:
- Keuhkoputkien, henkitorven, ruokatorven tai keuhkojen kandidiaasi
- Invasiivinen kohdunkaulan syöpä
- Coccidioidomycosis
- Kryptokokoosi
- Kryptosporidioosi, krooninen suolisto (yli kuukauden kesto)
- Sytomegalovirussairaus (erityisesti CMV-retiniitti)
- Enkefalopatia, HIV:hen liittyvä
- Herpes simplex: krooninen haava(t) (kesto yli 1 kuukauden); tai keuhkoputkentulehdus, keuhkoputkentulehdus tai esofagiitti
- Histoplasmoosi
- Isosporiasis, krooninen suolisto (yli kuukauden kesto)
- Kaposin sarkooma
- Lymfooma, useita muotoja
- Mycobacterium avium -kompleksi
- Tuberkuloosi
- Pneumocystis carinii -keuhkokuume
- Keuhkokuume, toistuva
- Progressiivinen multifokaalinen leukoenkefalopatia
- Salmonella-septikemia, toistuva
- Aivojen toksoplasmoosi
HIV:n aiheuttama tuhlausoireyhtymä
- HIV- ja hepatiittitulokset hankitaan luottamuksellisesti. Testaus tehdään ulkopuolisen sertifioidun laboratorion kanssa. Tulokset ovat vain tutkimusryhmän käytettävissä seuraavin varoin:
Kaikki positiiviset HIV-, B- ja C-hepatiittitulokset, jotka ovat odottamattomia (esim. osallistuja ei ole tällä hetkellä mukana EPR:ssä lääkehoidon aikana HIV-1-seropositiivisena) tutkimuksen lääkäri/PI tai CRU:n johtaja ilmoittaa asiasta viipymättä luovuttajalle. Osallistuja ohjataan lääkärin ja/tai N.C:n puoleen. Terveysministeriö vahvistavia testejä ja neuvontaa varten. Kuten liitteenä olevassa Täydennysosassa, joka kuvaa N.C. Osavaltion terveysministeriön koodia noudatetaan. Osavaltiokoodi velvoittaa raportoimaan positiivisista tuloksista sekä osallistujan nimen ja tunnistetiedot N.C:lle. Kansanterveysministeriö. Testauslaboratorion kanssa solmittaessa selvitetään ja dokumentoidaan, onko sopimuslaboratorio vai tutkimuspäällikkö vastuussa positiivisten tulosten ilmoittamisesta valtiolle päällekkäisten raportoinnin välttämiseksi. Vastaanotettuaan testitulokset N.C. Terveysministeriö ottaa osallistujaan yhteyttä ja kertoo positiivisesta tuloksesta, hoidon löytämisestä, muiden tartuttamisen välttämisestä, miten äskettäin todetusta HIV- ja/tai hepatiittitartunnasta raportoidaan sekä mahdollisen riskin kumppanien informoinnin tärkeydestä, koska HIV- ja/tai hepatiittitartunnastaan. Jos HIV-, B- ja C-hepatiittitulokset ovat negatiivisia, osallistujalle ei ilmoiteta. Osallistuja voi kuitenkin ottaa yhteyttä tutkimussairaanhoitajaan tuloksistaan.
HIV- ja hepatiitti B/C -testitulokset, ei-reaktiiviset ja reaktiiviset, dokumentoidaan luottamuksellisesti PI:n tai tutkimuskoordinaattorin toimesta tutkittavan asiakirjaan, ja ne säilytetään lukitussa arkistokaappissa CRU:n lääketieteellisten asiakirjojen huoneessa. Raportointimenettelyn ja raportointiprosessiin liittyvän ajan dokumentoimiseksi on luotu asiakirja, joka on sijoitettu tutkimuskohtaiseen käsikirjaan (Hepatiitti B/C- ja HIV-ilmoitusprosessi reaktiivisille tuloksille -lomake).
- Terveet kontrollin osallistujat, joilla on SNP:t TLR8 ja FLT1 ja jotka käyttävät parhaillaan hormonaalista ehkäisyä (esim. suun kautta otettavat ehkäisyvalmisteet, hormonikierukat, ehkäisylaastarit) tai hormonikorvaushoito suljetaan pois tutkimuksesta, ellei osallistuja ole ollut poissa hormonihoidosta kuukauden tai pidempään.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
FLT1 C-677T
SNP
|
|
MDM2 rs2279744
SNP
|
|
p53 rs1042522
SNP
|
|
RMM1 rs1465952
SNP
|
|
TLR8 rs3761624
SNP
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
p53-kohdegeenin ilmentyminen
Aikaikkuna: käynnin yhteydessä otetun veren analyysi
|
Tämän tutkimuksen ensisijainen päätepiste on RTPCR:llä mitattu p53-kohdegeenin ilmentyminen seuraaville viidelle SNP:lle: p53 rs1042522, MDM2 rs2279744, FLT1 C-677T, TLR8 rs3761624 ja RMM1 rs1465952.
|
käynnin yhteydessä otetun veren analyysi
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
p53-promoottorin miehitys
Aikaikkuna: käynnin yhteydessä otetun veren analyysi
|
Mitattu ChIP-analyysillä seuraaville SNP:ille: FLT1 C-677T, TLR8 rs3761624 ja RMM1 rs1465952.
|
käynnin yhteydessä otetun veren analyysi
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Daniel Menendez, Ph.D., National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Bond GL, Hu W, Bond EE, Robins H, Lutzker SG, Arva NC, Bargonetti J, Bartel F, Taubert H, Wuerl P, Onel K, Yip L, Hwang SJ, Strong LC, Lozano G, Levine AJ. A single nucleotide polymorphism in the MDM2 promoter attenuates the p53 tumor suppressor pathway and accelerates tumor formation in humans. Cell. 2004 Nov 24;119(5):591-602. doi: 10.1016/j.cell.2004.11.022.
- Menendez D, Inga A, Resnick MA. The expanding universe of p53 targets. Nat Rev Cancer. 2009 Oct;9(10):724-37. doi: 10.1038/nrc2730.
- Murphy ME. Polymorphic variants in the p53 pathway. Cell Death Differ. 2006 Jun;13(6):916-20. doi: 10.1038/sj.cdd.4401907. No abstract available.
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 100134
- 10-E-0134
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .