Hengitysnäytteiden kerääminen ja testaus

Joka vuosi akuutteihin hengitystieinfektioihin liittyvä sairastuvuus ja kuolleisuus vaihtelee kausiluonteisesti. Tämä nousu ja lasku liittyy hengitystievirusten esiintyvyyden muuttumiseen väestössä. Lukemattomat hengitystievirukset ovat vastuussa näistä infektioista. Esimerkiksi influenssavirus, respiratory Syncytial Virus (RSV), parainfluenssavirus, ihmisen metapneumovirus, rinovirus ja adenovirus on kaikki tunnistettu aiheuttavan tällaisia ​​akuutteja infektioita. Useimmissa näistä virusryhmistä on tunnistettu lukuisia patogeenisiä alatyyppejä. Vakavan akuutin hengitystieoireyhtymän (SARS) puhkeaminen vuonna 2003 tunnistettiin lopulta koronavirukseksi; SARS-kuolleisuus vanhusten keskuudessa voi olla jopa 50 %. Viime aikoina ihmisen bocaviruksen (HBoV) on myös tunnistettu aiheuttavan akuutteja hengitystieinfektioita. Vuonna 2005 HBoV tunnistettiin molekyylitesteillä, ja sen todettiin olevan ainoa virus, joka on tunnistettu hengitystieinfektioista kärsivien potilaiden alaryhmässä. Tukitoimenpiteitä (esim. vuodelepo, nesteytys jne.) lukuun ottamatta moniin näistä virusinfektioista ei ole tehokkaita hoitoja. kuitenkin antiviraalisia aineita (esim. neuraminidaasi-inhibiittoreita oseltamiviiria tai zanamiviiria) voidaan käyttää lievittämään flunssan kaltaisten oireiden vakavuutta. Hengitystieviruksen tunnistaminen taudinaiheuttajaksi on tärkeää, koska se eliminoi antibioottihoidon tarpeen; Lääkärit odottavat yleensä 7–10 päivää oireiden lievittymistä ennen antibioottien määräämistä bakteerien antibioottiresistenssin pahenemiseen liittyvien riskien vuoksi.

Joka vuosi viruspopulaatio vaihtelee ja sen mukana populaation läpi kiertävien hallitsevien kantojen antigeeninen esitys. Epidemioita syntyy, kun yhä suuremmilla osilla väestöstä ei ole synnynnäistä tai hankittua immunologista resistenssiä tällaisia ​​kantoja vastaan ​​tiettynä vuodenaikana. Maailman terveysjärjestö (WHO) ylläpitää erillistä verkkosivustoa, joka on omistettu influenssaepidemioiden, erityisesti lintuinfluenssan, seurantaan (https://www.who.int/fluvirus_tracker). Nämä zoonoottiset tartunnat, jotka mukautuvat edelleen mahdollistamaan ihmisestä ihmiseen siirtymisen, ovat suurin huolenaihe, koska ennustetaan, että käytännössä kaikki ihmiset ovat immunologisesti naiiveja. Zoonoottisia tartuntoja ihmispopulaatiossa seurataan siinä toivossa, että vuoden 1918 espanjantautia vastaava pandemia voidaan välttää. Espanjan flunssaan on arvioitu kuolleen yli 25 miljoonaa ihmistä. Yhdysvaltain hallitus ylläpitää myös erillistä verkkosivustoa, jossa on resursseja flunssasta ja pandemiasta (http://www.pandemicflu.gov/). 11. kesäkuuta 2009 WHO nosti pandemian uhkatason 6:een vastauksena uuden sikainfluenssa A -kannan (alatyyppi H1N1) ilmaantumiseen maailmanlaajuisesti. Nopeus, jolla H1N1-virus on levinnyt, on esimerkki siitä, että taudinpurkaukseen liittyvän viruspatogeenin nopea ja tarkka tunnistaminen on kriittistä maailmanlaajuisen kansanterveyden kannalta.

Influenssaepidemian uhan lisäksi akuutteja hengitystieinfektioita aiheuttavien virusten määrän kasvu vaikeuttaa primaarisen taudinaiheuttajan oikeaa ja nopeaa tunnistamista. jokainen uusi virus tai alatyyppi lisää testauksen monimutkaisuutta. Molekyylidiagnostiset määritykset sopivat ihanteellisesti tämän monimutkaisuuden ratkaisemiseen. Polymeraasiketjureaktioon (PCR) perustuvat määritykset voivat sisältää useita alukkeita ja koettimia (esim. multipleksoituja) yhteen reaktioon tämän monimutkaisuuden käsittelemiseksi. Tällaiset määritykset ovat erittäin herkkiä, niillä on korkea spesifisyys ja ne voidaan suorittaa hyvin nopeasti. Artus Influenza A/B RT-PCR -testi on reaaliaikainen PCR-määritys influenssa A:n ja B:n havaitsemiseen ja tunnistamiseen, kun taas QIAGEN ResPlex II Advanced Panel -testi on nukleiinihappomonistukseen perustuva määritys influenssa A:n ja B:n havaitsemiseen ja tunnistamiseen. laaja valikoima yleisimpiä akuutteihin hengitystieinfektioihin liittyviä hengitystieinfektioita. Tässä tutkimuksessa hengitysnäytteitä kerätään ja testataan käyttämällä artus Influenza A/B RT-PCR -testiä ja QIAGEN ResPlex II Advanced Panel -testiä.