Raccolta e test di campioni respiratori

Ogni anno la morbilità e la mortalità associate alle infezioni acute del tratto respiratorio fluttuano stagionalmente. Questo aumento e calo è associato alla mutevole prevalenza dei virus respiratori nella popolazione. Una miriade di virus respiratori sono responsabili di queste infezioni. Ad esempio, il virus dell'influenza, il virus respiratorio sinciziale (RSV), il virus della parainfluenza, il metapneumovirus umano, il rinovirus e l'adenovirus sono stati tutti identificati come causa di tali infezioni acute. Nella maggior parte di questi gruppi virali sono stati identificati numerosi sottotipi patogeni. Lo scoppio della sindrome respiratoria acuta grave (SARS) nel 2003 è stato infine identificato come un coronavirus; la mortalità della SARS tra gli anziani può raggiungere il 50%. Più recentemente, anche il Bocavirus umano (HBoV) è stato identificato come causa di infezioni acute del tratto respiratorio. Nel 2005 l'HBoV è stato identificato mediante test molecolari ed è risultato essere l'unico virus identificato in una sottopopolazione di pazienti affetti da infezioni del tratto respiratorio. A parte le misure di supporto (ad esempio, riposo a letto, idratazione, ecc.), non esistono trattamenti efficaci per molte di queste infezioni virali; tuttavia, gli agenti antivirali (ad esempio, gli inibitori della neuraminidasi oseltamivir o zanamivir) possono essere utilizzati per alleviare la gravità dei sintomi simil-influenzali. L'identificazione di un virus respiratorio come agente eziologico è importante perché elimina la necessità di trattamento con antibiotici; i medici in genere aspettano 7-10 giorni affinché i sintomi si allevino prima di prescrivere antibiotici a causa dei rischi associati all'esacerbazione della resistenza batterica agli antibiotici.

Ogni anno la popolazione virale fluttua e con essa la presentazione antigenica dei ceppi dominanti che circolano nella popolazione. Le epidemie si verificano quando porzioni sempre più grandi della popolazione non hanno una resistenza immunologica innata o acquisita a tali ceppi in una data stagione. L'Organizzazione mondiale della sanità (OMS) gestisce un sito Web separato dedicato al monitoraggio dei focolai di influenza, in particolare l'influenza aviaria (https://www.who.int/fluvirus_tracker). Queste trasmissioni zoonotiche che si adattano ulteriormente per consentire la trasmissione da uomo a uomo sono motivo di grande preoccupazione perché si prevede che praticamente tutti gli esseri umani saranno immunologicamente naïve. Le trasmissioni zoonotiche nella popolazione umana sono monitorate nella speranza che si possa evitare una pandemia simile all'influenza spagnola del 1918; si stima che oltre 25 milioni di persone siano morte a causa dell'influenza spagnola. Il governo degli Stati Uniti mantiene anche un sito Web separato con risorse riguardanti l'influenza e le informazioni relative alla pandemia (http://www.pandemicflu.gov/). L'11 giugno 2009 l'OMS ha innalzato il livello di minaccia di pandemia a 6 in risposta alla comparsa globale di un nuovo ceppo di influenza suina A (sottotipo H1N1). La rapidità con cui il virus H1N1 si è diffuso esemplifica l'idea che l'identificazione rapida e accurata di un agente patogeno virale associato a un focolaio sia fondamentale per la salute pubblica globale.

Oltre alla minaccia di un'epidemia di influenza, l'espansione del numero di virus che causano infezioni acute del tratto respiratorio aggrava la difficoltà di identificare correttamente e rapidamente l'agente patogeno primario; ogni nuovo virus o sottotipo aumenta la complessità dei test. I test diagnostici molecolari sono ideali per affrontare questa complessità. I saggi basati sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) possono incorporare più primer e sonde (ad esempio, multiplexati) in una singola reazione per far fronte a questa complessità.4 Tali saggi sono estremamente sensibili, hanno un alto grado di specificità e possono essere eseguiti molto rapidamente. Il test artus Influenza A/B RT-PCR è un test PCR in tempo reale per il rilevamento e l'identificazione dell'influenza A e B, mentre il test QIAGEN ResPlex II Advanced Panel è un test basato sull'amplificazione degli acidi nucleici per il rilevamento e l'identificazione di un'ampia gamma di alcuni dei virus respiratori più comuni associati alle infezioni acute del tratto respiratorio. Nel presente studio i campioni respiratori saranno raccolti e testati in modo prospettico utilizzando il test artus Influenza A/B RT-PCR e il test QIAGEN ResPlex II Advanced Panel.