Recolección y análisis de muestras respiratorias

Cada año, la morbilidad y la mortalidad asociadas con las infecciones agudas de las vías respiratorias fluctúan estacionalmente. Este aumento y disminución está asociado con la prevalencia cambiante de los virus respiratorios en la población. Una miríada de virus respiratorios son responsables de estas infecciones. Por ejemplo, el virus de la influenza, el virus respiratorio sincitial (RSV), el virus de la parainfluenza, el metapneumovirus humano, el rinovirus y el adenovirus han sido identificados como causantes de tales infecciones agudas. Se han identificado numerosos subtipos patógenos dentro de la mayoría de estos grupos virales. El brote del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS) en 2003 finalmente se identificó como un Coronavirus; la mortalidad del SARS entre los ancianos puede llegar al 50%. Más recientemente, el Bocavirus Humano (HBoV) también ha sido identificado como causante de infecciones agudas del tracto respiratorio. En 2005, el HBoV se identificó mediante pruebas moleculares y se descubrió que era el único virus identificado en una subpoblación de pacientes que padecían infecciones del tracto respiratorio. Aparte de las medidas de apoyo (por ejemplo, reposo en cama, hidratación, etc.), no existen tratamientos efectivos para muchas de estas infecciones virales; sin embargo, se pueden usar agentes antivirales (p. ej., los inhibidores de la neuraminidasa oseltamivir o zanamivir) para aliviar la gravedad de los síntomas similares a los de la gripe. La identificación de un virus respiratorio como agente causal es importante porque elimina la necesidad de tratamiento con antibióticos; los médicos suelen esperar de 7 a 10 días para que los síntomas se alivie antes de recetar antibióticos debido a los riesgos asociados con la exacerbación de la resistencia bacteriana a los antibióticos.

Cada año la población del virus fluctúa, y con ella la presentación antigénica de las cepas dominantes que circulan en la población. Las epidemias surgen cuando porciones cada vez más grandes de la población no tienen resistencia inmunológica innata o adquirida a tal(es) cepa(s) en una temporada dada. La Organización Mundial de la Salud (OMS) mantiene un sitio web separado dedicado al seguimiento de brotes de influenza, especialmente de influenza aviar (https://www.who.int/fluvirus_tracker). Estas transmisiones zoonóticas que se adaptan aún más para permitir la transmisión de persona a persona son de gran preocupación porque se predice que prácticamente todos los humanos serán inmunológicamente ingenuos. Las transmisiones zoonóticas en la población humana se monitorean con la esperanza de que se pueda evitar una pandemia similar a la gripe española de 1918; se estima que más de 25 millones de personas murieron a causa de la gripe española. El gobierno de los Estados Unidos también mantiene un sitio web separado con recursos relacionados con la gripe y la información relacionada con la pandemia (http://www.pandemicflu.gov/). El 11 de junio de 2009, la OMS elevó el nivel de amenaza pandémica a 6 en respuesta a la aparición mundial de una nueva cepa de influenza porcina A (subtipo H1N1). La rapidez con la que se ha propagado el virus H1N1 ejemplifica la noción de que la identificación rápida y precisa de un patógeno viral asociado con un brote es fundamental para la salud pública mundial.

Además de la amenaza de un brote de influenza, la expansión en la cantidad de virus que causan infecciones agudas del tracto respiratorio agrava la dificultad para identificar correcta y rápidamente el patógeno primario; cada nuevo virus o subtipo aumenta la complejidad de las pruebas. Los ensayos de diagnóstico molecular son ideales para abordar esta complejidad. Los ensayos basados ​​en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) pueden incorporar múltiples cebadores y sondas (p. ej., multiplexados) en una sola reacción para hacer frente a esta complejidad.4 Dichos ensayos son extremadamente sensibles, tienen un alto grado de especificidad y se pueden realizar muy rápidamente. La prueba artus Influenza A/B RT-PCR es un ensayo de PCR en tiempo real para la detección e identificación de la influenza A y B, mientras que la prueba QIAGEN ResPlex II Advanced Panel es un ensayo basado en la amplificación de ácidos nucleicos para la detección e identificación de una amplia gama de algunos de los virus respiratorios más comunes asociados con infecciones agudas del tracto respiratorio. En el presente estudio, las muestras respiratorias se recolectarán prospectivamente y se analizarán mediante la prueba artus Influenza A/B RT-PCR y la prueba QIAGEN ResPlex II Advanced Panel.