Afatinibin genominen maisema

Nykyinen ehdotus sisältää eksomin ja transkription sekvensoinnin lähtötilanteessa kerätystä verestä sekä kasvainnäytteistä, jotka on otettu ennen afatinibin aloittamista ja taudin etenemisen aikana (yhteensä kaksi kudosnäytettä ja yksi verinäyte potilasta kohti). Näytteet kerätään IRB:n (Institutional Review Board) hyväksymän pankkitutkimuksen "Tissue and Blood Acquisition for Genomic Analysis and Collection of Health Information from Patients with Thoracic Malignancies, Suspected Thoracic Malignancies tai Mesoteliooma" perusteella.

Jos se toteutetaan onnistuneesti, ehdotettu strategia johtaa hyvin todennäköisesti laajempaan ja riittävän tehokkaaseen tutkimukseen (ehkä käyttämällä koko genomin sekvensointia), jotta voidaan ymmärtää täysin kehittyviä molekyylimuutoksia, jotka johtuvat kloonaalisesta valinnasta hoitopaineen alaisena. Parhaillaan meneillään olevan sekvensointitekniikan alan edistyminen todennäköisesti vain kiihtyy lähitulevaisuudessa, mikä tuottaa rikkaampaa ja erittäin sisältörikkaampaa tietoa. Lisäksi on todennäköistä, että DNA-sekvensoinnista ja transkriptomista saatua genomista informaatiota täydennetään translatomien ja proteomien analyyseillä.

Ehdotetun tutkimuksen onnistunut loppuunsaattaminen antaisi tuleville tutkimuksille mahdollisuuden hyödyntää täysin uusien teknologioiden potentiaalia kehittääkseen uusia lähestymistapoja EGFR TKI:n (tyrosiinikinaasi-inhibiittorin) ja muiden molekulaarisesti kohdistettujen hoitojen resistenssin hoitamiseksi ja jopa ehkäisemiseksi. Tämä voisi toimia mallina myös muille syöpätyypeille. Ajan myötä tämä laajalti käytetty lähestymistapa loisi samanaikaisesti erittäin arvokkaita annotoituja kasvainnäytteitä sekä itulinjan DNA:ta suuritehoisia genomitutkimuksia varten uusien kohteiden ja niiden vaikutuksen tunnistamiseksi taudin kulkuun. Kasvaimen molekyylimuutosten uudelleen analysointi taudin etenemisen aikana olisi todennäköisesti uusi hoitostandardi pelastushoidon ohjaamiseksi.