Metabolinen fenotyypitys paksusuolensyövän leikkauksen jälkeen: Uusien ennustavien biomarkkerien tutkimus

Jopa 30–40 %:lla paksusuolensyövän vuoksi leikatuista potilaista kasvain uusiutuu. Ennakoivia biomarkkereita tarvitaan niiden potilaiden tunnistamiseen, joilla on suurempi uusiutumisriski. Päätavoitteemme on määrittää kolorektaalisyöpäpotilaiden veriplasman metaboliittiprofiili, joka voidaan liittää onkologiseen lopputulokseen ja joka voidaan validoida prognostisiksi biomarkkereiksi tulevissa tutkimuksissa. Toissijaisena tavoitteena on tutkia samojen potilaiden plasmanäytteillä käsiteltyjen paksusuolensyöpäsolulinjojen glykolyyttistä metaboliaa. Erityisesti vahvistamaan kasvainsolujen lisääntynyt laktaatin käyttö metabolisena substraattina käyttämällä leikkauksen jälkeisiä ihmisnäytteitä, kuten havaitsimme aiemmin in vitro käyttämällä tulehdusympäristöä hypoksian ja glukoosin puutteen olosuhteissa. Mukana ovat potilaat, joilla on paksusuolen syöpä ja joille on tehty kirurginen resektio. Plasmanäytteet otetaan ennen leikkausta ja 4. päivänä ja 3., 6., 12. ja 18. kuukautta leikkauksen jälkeen. Plasmanäytteiden aineenvaihduntaprofiilit määritetään käyttämällä pakkausta, joka mahdollistaa 180 metaboliitin kvantifioinnin massaspektrometrialla. Solumääritykset suoritetaan paksusuolensyöpäsolulinjoille SW620 ja HT-29. Solut käsitellään plasmanäytteillä ja laktaatin ja muiden aineenvaihduntatuotteiden pitoisuus analysoidaan alustan supernatanteissa. Kliinistä seurantaa ylläpidetään vähintään 2 vuoden ajan kasvaimen uusiutumisen tunnistamiseksi.