Perheen sarkoidoosin kliininen ja geneettinen tutkimus (SARCFAM) (SARCFAM)

Ilmansaasteiden merkittävimmät vaikutukset ovat keuhkosairaudet, kuten granulomatoottiset sairaudet ja pääasiassa sarkoidoosi. Epäorgaanisten/nanohiukkasten ja geneettisen taustan merkityksen ymmärtäminen näissä kroonisissa sairauksissa on suuri haaste potilaiden hoidossa ja ehkäisystrategioissa. Granuloomeille on tunnusomaista jättimäiset epiteeli- ja monitumaiset solut, mikä kuvastaa vakavaa häiriötä immunologisissa reiteissä, jotka aiheutuvat sekä toksisesta altistumisesta että geneettisestä taipumuksesta. Aiemmat tutkimukset osoittivat, että ammatillinen ympäristö ja akuutti altistuminen mikro-/nanohiukkasille (World Trade Centerin katastrofi) vaikuttavat patogeenisesti ja lisäävät sarkoidoosia jyrkästi. Sarkoidoosi on monitekijäinen sairaus, joka esiintyy geneettisesti haavoittuvassa tilanteessa. Monet geenimuunnelmat on yhdistetty taudin lisääntyneeseen todennäköisyyssuhteeseen, kuten BTNL2, CCDC88B, ANNEXIN A11, jotka osallistuvat T-solujen aktivaatio- ja kypsymisreittien säätelyyn. Olemme vuodesta 2008 lähtien tukeneet kansallista kohorttia (GSF, 28 keskusta), jossa on ≈ 800 sarkoidoosipotilasta, joilla on familiaalinen ja satunnainen sairaus. Tämä kokoelma on ollut poikkeuksellinen (ja maailmanlaajuisesti ainutlaatuinen) työkalu sarkoidoosin kattavan kliinisen tietokannan toteuttamiseen, taudin evoluution mallintamiseen ja kliinisten/geneettisten kriteerien tunnistamiseen, jotka erottavat satunnaiset ja perhemuodot.

Hankkeen päätavoitteet ovat:

1. Geneettisten tietojen täydentäminen, jotta saadaan aikaan malli geenivarianteista, jotka erottuvat taudin perhemuodoista, verrattuna satunnaiseen. Tämä tehdään WES-analyysillä (KOKO EXOME) aiemmin kerätyille DNA-näytteille. Potilaiden tietoinen suostumus sisälsi tiedot jo vuodesta 2008 testatusta BTNL2-geenistä ja siihen liittyvistä immuunipolkuihin liittyvistä geeneistä, mikä mahdollistaa yksiselitteisen tiedon projektin tutkimuksen lopullisuudesta.
2. Jokaisen potilaan kliinisen tiedon täydentäminen yhteistyössä GSF-verkoston kanssa, vuodesta 2008 perustetun tietokannan hallinta. Kerätyt tiedot ovat yleisesti yksityiskohtaisia ​​potilaiden normaalissa seurannassa. Projekti ei sisällä uusia potilaaseen kohdistuvia interventioita (ei radiologisia tai invasiivisia testejä).
3. Potilaiden valkosoluille voidaan tehdä erityisiä biologisia tutkimuksia, ja tällaisissa tapauksissa voidaan tarvita uusi verinäytteenotto sekä potilailla että ensimmäisen asteen terveillä kontrolleilla. Nämä erityistutkimukset esitellään eettiselle komitealle (CCP), jotta voidaan validoida kohortin "uuden interventio" toteutettavuus. Kerätyt näytteet ovat samassa tilavuudessa kuin perinteisessä verinäytteessä (2*7 ml).
4. Kaikki muut GSF-verkostoon lähetettävät projektit vaativat erityisen rekisteröinnin ja eettisen komitean validoinnin.