- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT02829853
Klinická a genetická studie familiární sarkoidózy (SARCFAM) (SARCFAM)
Hlavními dopady znečištění ovzduší jsou plicní onemocnění, jako jsou granulomatózní onemocnění a především sarkoidóza. Pochopení příslušné úlohy anorganických/nanočástic a genetického pozadí u těchto chronických onemocnění je hlavní výzvou pro léčbu pacientů a strategie prevence. Granulomy jsou charakterizovány obřími epiteloidními a mnohojadernými buňkami, což odráží závažnou poruchu v imunologických drahách vyvolanou jak toxickou expozicí, tak genetickou predispozicí. Předchozí studie ukázaly, že profesionální environmentální kontext a akutní expozice (katastrofa World Trade Center) mikro/nanočásticím mají patogenní dopad s prudkým nárůstem sarkoidózy. Sarkoidóza je multifaktoriální onemocnění vyskytující se v geneticky zranitelném kontextu. Mnoho genových variant bylo spojeno se zvýšeným poměrem pravděpodobnosti onemocnění, jako jsou BTNL2, CCDC88B, ANNEXIN A11, které se podílejí na regulaci cest aktivace a zrání T-buněk. Od roku 2008 jsme přispěli do národní kohorty (GSF, 28 center) ≈ 800 pacientů se sarkoidózou s familiární a sporadickou prezentací onemocnění. Tato sbírka je výjimečným (a celosvětově unikátním) nástrojem pro implementaci vyčerpávající klinické databáze sarkoidózy, modelování vývoje onemocnění a identifikaci klinických/genetických kritérií rozlišujících sporadické a familiární formy.
Hlavní cíle projektu jsou:
- Doplnění genetických dat za účelem stanovení vzoru genových variant segregujících s familiárními formami onemocnění ve srovnání se sporadickou. To bude provedeno analýzou WES (WHOLE EXOME) na dříve odebraných vzorcích DNA. Informovaný souhlas pro pacienty obsahoval informaci o genu BTNL2, který je již testován od roku 2008, a příbuzných genech napojených na imunitní dráhy, a umožnil tak jednoznačnou informaci o výzkumné finalitě projektu.
- Kompletace klinických dat o každém pacientovi ve spolupráci se sítí GSF, správa databáze založené od roku 2008. Shromážděná data jsou ta, která jsou běžně podrobně popsána při běžném sledování pacientů. Projekt nezahrnuje žádné nové intervence u pacienta (ani radiologické ani invazivní testy).
- Specifické biologické studie mohou být provedeny na bílých krvinkách pacientů a v takových případech mohou vyžadovat nový odběr krve, a to jak u pacientů, tak u zdravých kontrol prvního stupně. Tyto specifické studie budou předloženy etické komisi (CCP) za účelem ověření proveditelnosti z hlediska „nové intervence“ u kohorty. Odebrané vzorky budou ve stejném objemu jako klasický odběr krve (2*7 ml).
- Jakékoli další projekty předložené do sítě GSF budou vyžadovat zvláštní registraci a ověření etickou komisí.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Lyon, Francie, 69003
- Nábor
- Hospices Civils de Lyon / Hopital Edouard Herriot
-
Kontakt:
- Yves Pacheco
- E-mail: yves.pacheco@univ-lyon1.fr
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- pacient postižený sarkoidózou, jak je definováno klinickými kritérii, jako jsou: staging RTG hrudníku, testy plicních funkcí, biologické proměnné: sérový vápník a kreatinin, počet buněk z bronchiální alveolární laváže a je-li k dispozici, histologické potvrzení granulomu biopsií. Onemocnění se může zpočátku projevovat jako uveitida, postižení kůže nebo jiných anatomických míst, což musí být také potvrzeno kompetentními patology jako granulom související se sarkoidózou.
Kritéria vyloučení:
- Jakékoli jiné onemocnění naznačující sarkoidózu a vyjádřené podobnými příznaky, jako např. hilová lymfadenopatie, jiné formy uveitidy, restriktivní plicní syndromy .. atd….
- Všichni pacienti, pro které nebylo sledování dostupné během 8letého programu GSF SARCFAM
- věk < 8 let nebo > 80 let
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
sporadické případy (SP)
Sporadické případy jsou definovány jako pacienti s diagnostikovanou sarkoidózou, u kterých familiární anamnéza neodhalila žádné další případy, ať je relativní stupeň 1, 2, 3 nebo 4. Klinické sledování a genetické studie provedené v rámci tento projekt je stejný jako u rodinné skupiny.
Při pravidelném sledování jsou pacienti pravidelně dotazováni na domnělý výskyt onemocnění v jejich rodině, a pokud taková situace nastane, může dojít k přechodu pacienta (a jeho příbuzného) ze SP do familiární (FAM) skupiny.
Ve vzorcích krve bude provedena genetická analýza pomocí SANGER a WHOLE EXOME NEXT GENERATION SQUENCING.
|
Pacienti se sarkoidózou jsou pravidelně sledováni v jednom z 28 klinických center GSF.
Odběr krve byl proveden ve dvou 5ml klasických heparinizovaných zkumavkách, které se používají pro analýzu červených/bílých/trombocytů.
Pacienti obdrží kompletní informace o protokolu SARCFAM a podepíší informovaný souhlas s tím, že genetická studie bude provedena na genu BTNL2 a genech souvisejících s imunitou, včetně jiných lokusů než BTNL2. DNA byla extrahována z 1-5 ml vzorku krve a skladovány ve zmrazeném stavu až do analýzy.
Genomová DNA je zachycena pomocí metodologie obohacování Agilent v roztoku (Human Clinical Research Exome, Agilent) s jejich knihovnou biotinylovaných oligonukleotidových sond, po které následuje masivně paralelní sekvenování na párových koncích 75 bází na Illumina HiSEQ 400.
Pro každou genomovou pozici jsou exomické frekvence (Homo & HTZ) určeny ze všech již sekvenovaných exomů a/nebo výsledků exomů poskytnutých 1000G, EVS, HapMap databází.
|
|
rodinné případy (FAM)
Rodinné případy jsou definovány jako pacienti s diagnózou sarkoidózy s příbuzným rodičem prvního a/nebo druhého stupně, kteří jsou rovněž postiženi dobře prokázaným syndromem sarkoidózy.
Více než 70 % rodin SARCFAM zahrnovalo dva postižené jedince prvního stupně, s vertikálním nebo horizontálním přenosem.
Zdá se, že mendelovský rys je autozomálně dominantní.
20 až 30 % rodin tvoří 3, 4 nebo více případů, přičemž podskupina rodin zahrnuje více než 5 případů.
Pacienti jsou vedeni jako sporadičtí a v takových rodinách byl poskytnut i informovaný souhlas s jasným vysvětlením složitosti genetického pozadí onemocnění.
Ve vzorcích krve bude provedena genetická analýza pomocí SANGER a WHOLE EXOME NEXT GENERATION SQUENCING.
|
Pacienti se sarkoidózou jsou pravidelně sledováni v jednom z 28 klinických center GSF.
Odběr krve byl proveden ve dvou 5ml klasických heparinizovaných zkumavkách, které se používají pro analýzu červených/bílých/trombocytů.
Pacienti obdrží kompletní informace o protokolu SARCFAM a podepíší informovaný souhlas s tím, že genetická studie bude provedena na genu BTNL2 a genech souvisejících s imunitou, včetně jiných lokusů než BTNL2. DNA byla extrahována z 1-5 ml vzorku krve a skladovány ve zmrazeném stavu až do analýzy.
Genomová DNA je zachycena pomocí metodologie obohacování Agilent v roztoku (Human Clinical Research Exome, Agilent) s jejich knihovnou biotinylovaných oligonukleotidových sond, po které následuje masivně paralelní sekvenování na párových koncích 75 bází na Illumina HiSEQ 400.
Pro každou genomovou pozici jsou exomické frekvence (Homo & HTZ) určeny ze všech již sekvenovaných exomů a/nebo výsledků exomů poskytnutých 1000G, EVS, HapMap databází.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
počet mutací založených v genu IL34-TIAM
Časové okno: Den 0
|
Stanovení počtu mutací založených v genu IL34-TIAM, který byl popsán jako zapojený do tvorby granulomu, klíčové léze sarkoidózy
|
Den 0
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Publikace a užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- D50604
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Genetická analýza SANGER a WHOLE EXOME NEXT GENERATION SQUENCING
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie