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Etude Clinique et Génétique de la Sarcoïdose Familiale (SARCFAM) (SARCFAM)

8 juillet 2016 mis à jour par: Hospices Civils de Lyon

Les principaux impacts de la pollution de l'air sont les maladies pulmonaires telles que les maladies granulomateuses et principalement la sarcoïdose. Comprendre le rôle respectif des inorganiques/nanoparticules et du fond génétique dans ces maladies chroniques est un enjeu majeur pour la prise en charge des patients et les stratégies de prévention. Les granulomes sont caractérisés par des cellules épithélioïdes géantes et multinucléées, reflétant une perturbation sévère des voies immunologiques induite à la fois par une exposition toxique et une prédisposition génétique. Des études antérieures ont démontré que le contexte environnemental professionnel et les expositions aiguës (catastrophe du World Trade Center) aux micro/nanoparticules ont un impact pathogène avec une forte augmentation de la sarcoïdose. La sarcoïdose est une maladie multifactorielle survenant dans un contexte génétiquement vulnérable. De nombreuses variantes de gènes ont été associées à un rapport de cotes accru de la maladie, telles que BTNL2, CCDC88B, ANNEXIN A11 impliquées dans la régulation des voies d'activation et de maturation des lymphocytes T. Nous contribuons depuis 2008 à une cohorte nationale (GSF, 28 centres) de ≈ 800 patients atteints de sarcoïdose avec une présentation familiale et sporadique de la maladie. Cette collection a été un outil exceptionnel (et unique au monde) pour la mise en place d'une base de données clinique exhaustive sur la sarcoïdose, la modélisation de l'évolution de la maladie et l'identification de critères cliniques/génétiques différenciant les formes sporadiques et familiales.

Les principaux objectifs du projet sont :

  1. Complétion des données génétiques afin d'établir un schéma de variantes génétiques ségrégeant avec les formes familiales de la maladie, par rapport à une forme sporadique. Cela se fera par analyse WES (WHOLE EXOME) sur les échantillons d'ADN précédemment collectés. Le consentement éclairé des patients comprenait des informations sur le gène BTNL2, déjà testé depuis 2008, et des gènes apparentés connectés aux voies immunitaires, permettant ainsi une information sans ambiguïté sur la finalité de recherche du projet.
  2. Complétion des données cliniques de chaque patient, en collaboration avec le réseau GSF, gestion de la base de données constituée depuis 2008. Les données recueillies sont celles qui sont couramment détaillées dans le suivi normal des patients. Le projet n'inclut aucune nouvelle intervention sur le patient (ni tests radiologiques ni invasifs).
  3. Des études biologiques spécifiques peuvent être effectuées sur les globules blancs des patients et peuvent nécessiter dans de tels cas un nouveau prélèvement sanguin, tant chez les patients que chez les témoins sains apparentés au premier degré. Ces études spécifiques seront présentées à un comité d'éthique (CCP) afin de valider la faisabilité en terme de « nouvelle intervention » sur la cohorte. Les échantillons prélevés seront au même volume qu'un prélèvement sanguin classique (2*7 ml).
  4. Tout autre projet soumis au réseau GSF devra faire l'objet d'une inscription spécifique et d'une validation par un comité d'éthique.

Aperçu de l'étude

Statut

Inconnue

Les conditions

Intervention / Traitement

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

800

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

4 ans à 76 ans (Enfant, Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

patient atteint de sarcoïdose

La description

Critère d'intégration:

  • patient atteint de sarcoïdose, tel que défini par des critères cliniques tels que : stadification radiographique du thorax, tests de la fonction pulmonaire, variables biologiques : calcium et créatinine sériques, numération cellulaire du lavage alvéolaire bronchique et, le cas échéant, une confirmation histologique du granulome par biopsie. La maladie peut se manifester initialement par une uvéite, une atteinte cutanée ou d'autres sites anatomiques, qui doit également être confirmée comme un granulome lié à la sarcoïdose par des pathologistes compétents.

Critère d'exclusion:

  • Toute autre maladie évoquant une sarcoïdose et se traduisant par des symptômes similaires, comme par ex. adénopathies hilaires, autres formes d'uvéites, syndromes pulmonaires restrictifs..etc….
  • Tous les patients dont le suivi n'était pas disponible sur le programme de 8 ans du GSF SARCFAM
  • âge < 8 ans ou > 80 ans

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
cas sporadiques (SP)
Les cas sporadiques sont définis comme les patients diagnostiqués pour une sarcoïdose, pour lesquels l'histoire familiale n'a révélé aucun autre cas, quel que soit le degré relatif : 1, 2, 3 ou 4. Le suivi clinique et les études génétiques réalisées dans le cadre de ce projet sont les mêmes que pour le groupe familial. Au cours du suivi régulier, les patients sont régulièrement interrogés sur la présence présumée de la maladie dans leur famille, et si une telle situation se produisait, le patient (et son entourage) peut passer du groupe SP au groupe familial (FAM). Dans les échantillons de sang, des analyses génétiques par SANGER et WHOLE EXOME NEXT GENERATION SEQUENCING seront effectuées.
Génétique: Analyse génétique par SANGER et WHOLE EXOME NEXT GENERATION SEQUENCING
Les patients atteints de sarcoïdose sont suivis dans le cadre du suivi régulier dans l'un des 28 centres cliniques GSF. Le prélèvement sanguin a été effectué dans deux tubes héparinés classiques de 5 ml, tels qu'utilisés pour l'analyse des globules rouges/blancs/plaquettaires. Les patients reçoivent des informations complètes sur le protocole SARCFAM et signent un consentement éclairé indiquant que l'étude génétique sera menée sur le gène BTNL2 et les gènes liés à l'immunité, y compris les loci autres que BTNL2.L'ADN a été extrait d'un échantillon de sang de 1 à 5 ml et stocké dans des conditions congelées jusqu'à l'analyse. L'ADN génomique est capturé à l'aide de la méthodologie d'enrichissement en solution Agilent (Human Clinical Research Exome, Agilent) avec leur bibliothèque de sondes d'oligonucléotides biotinylés, suivi d'un séquençage massivement parallèle à 75 bases appariées sur Illumina HiSEQ 400. Pour chaque position génomique, les fréquences exomiques (Homo & HTZ) sont déterminées à partir de tous les exomes déjà séquencés et/ou des résultats d'exomes fournis par la base de données 1000G, EVS, HapMap.
cas familiaux (FAM)
Les cas familiaux sont définis comme des patients diagnostiqués pour la sarcoïdose avec un parent apparenté au premier et/ou au deuxième degré également atteint d'un syndrome de sarcoïdose bien prouvé. Plus de 70 % des familles SARCFAM comprenaient deux personnes atteintes au premier degré, avec à la fois une transmission verticale ou horizontale. Le trait mendélien semble être autosomique dominant. 20 à 30 % des familles sont constituées de 3, 4 cas ou plus, avec un sous-ensemble de familles comprenant plus de 5 cas. Les patients sont pris en charge comme pour les patients sporadiques, et dans ces familles, un consentement éclairé a également été fourni avec une explication claire sur la complexité du fond génétique de la maladie. Dans les échantillons de sang, des analyses génétiques par SANGER et WHOLE EXOME NEXT GENERATION SEQUENCING seront effectuées.
Génétique: Analyse génétique par SANGER et WHOLE EXOME NEXT GENERATION SEQUENCING
Les patients atteints de sarcoïdose sont suivis dans le cadre du suivi régulier dans l'un des 28 centres cliniques GSF. Le prélèvement sanguin a été effectué dans deux tubes héparinés classiques de 5 ml, tels qu'utilisés pour l'analyse des globules rouges/blancs/plaquettaires. Les patients reçoivent des informations complètes sur le protocole SARCFAM et signent un consentement éclairé indiquant que l'étude génétique sera menée sur le gène BTNL2 et les gènes liés à l'immunité, y compris les loci autres que BTNL2.L'ADN a été extrait d'un échantillon de sang de 1 à 5 ml et stocké dans des conditions congelées jusqu'à l'analyse. L'ADN génomique est capturé à l'aide de la méthodologie d'enrichissement en solution Agilent (Human Clinical Research Exome, Agilent) avec leur bibliothèque de sondes d'oligonucléotides biotinylés, suivi d'un séquençage massivement parallèle à 75 bases appariées sur Illumina HiSEQ 400. Pour chaque position génomique, les fréquences exomiques (Homo & HTZ) sont déterminées à partir de tous les exomes déjà séquencés et/ou des résultats d'exomes fournis par la base de données 1000G, EVS, HapMap.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
nombre de mutations fondées dans le gène IL34-TIAM
Délai: Jour 0
Détermination du nombre de mutations fondées dans le gène IL34-TIAM qui a été décrit comme impliqué dans la formation du granulome, lésion clé de la sarcoïdose
Jour 0

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Hospices Civils de Lyon

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude

1 janvier 2008

Achèvement primaire (Anticipé)

1 septembre 2016

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 septembre 2016

Dates d'inscription aux études

Première soumission

4 juillet 2016

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

8 juillet 2016

Première publication (Estimation)

12 juillet 2016

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Estimation)

12 juillet 2016

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

8 juillet 2016

Dernière vérification

1 juillet 2016

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • D50604

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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