Monigeneettisen testin validointi määrittelemättömien kilpirauhasen kyhmyjen diagnosoimiseksi (CT-DS)
Ehdotetaan kliinistä tutkimusta Chilessä kehitetyn uuden geneettisen testin diagnostisen suorituskyvyn kliiniseksi validoimiseksi. Se määrittää niiden kilpirauhasen kyhmyjen luonteen, jotka on ilmoitettu epämääräisiksi sytologialla hienon neula-aspiraation (FNA) avulla.
Määrittämättömien kilpirauhasen kyhmyjen geneettinen luokitin on kvantitatiivinen geenin ilmentymistesti, joka yhdistää 10 biomarkkerin (CXCR3, CCR3, CXCl10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 ja CCR7) tulokset. yhden numeron pisteet. Se on tarkoitettu potilaille, joilla on sytologian mukaan epämääräinen kilpirauhasen kyhmy (Bethesda III ja IV, The Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopatology mukaan). Tätä testiä käytettäisiin ottamalla näyte hienolla neulaimulla (FNA) ja siten, että pystytään ennustamaan suurella tarkkuudella hyvänlaatuisia kyhmyjä, jotka eivät vaadi leikkausta.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Ongelma/tarpeet: Maailmassa sadoille tuhansille potilaille tehdään vuosittain tarpeettomia diagnostisia kilpirauhasen leikkauksia. Tätä tapahtuu potilailla, joiden FNA on ilmoitettu epämääräiseksi (joka vastaa 15-20 % kaikista FNA:sta), koska pahanlaatuisuuden riski on 15-25 %. Joten 75 % määrittämättömistä kyhmyistä leikataan tarpeettomasti, mikä tekee välttämättömäksi diagnostisen työkalun, jonka avulla voimme tunnistaa potilaat, joilla on hyvänlaatuisia kilpirauhasen kyhmyjä ja siten välttää leikkausta.
Ratkaisu: Olemme kehittäneet testin, joka analysoi 10 geenin ilmentymistä PCR:llä reaaliajassa FNA-näytteissä, integroituna algoritmilla, sulkee pois syövän esiintymisen, jonka negatiivinen ennustearvo (NPV) on 96 %. Spesifisyys 81 %.
Hyöty/perustelu: Korkean NPV:n ansiosta kliinikko voi suositella tarkkailua vaihtoehtona leikkaukselle. Väärien negatiivisten tulosten 6 % on kliinisesti hyväksytty, koska sytologiassa itsessään on 5 % vääriä negatiivisia. Toisaalta 75 %:n spesifisyys mahdollistaa leikkauksen välttämisen 75 %:ssa hyvänlaatuisista tapauksista, mikä tekee testistä kustannustehokkaan.
Edistyminen: Testi on saattanut päätökseen prototyypin kehittämisen ja analyyttisen validoinnin vaiheen. Seuraava vaihe on kliininen validointi ja se vastaa tässä protokollassa ehdotettua tutkimusta.
Hypoteesi: Geneettinen testimme sulkee pois syövän esiintymisen, jonka NPV on yli 94 % ja spesifisyys yli 75 % määrittämättömissä kyhmynäytteissä.
Ehdotettu tutkimus: Chilessä kehitetään monikeskeinen (9 paikkaa) kliininen tutkimus, jolla on tilastollinen teho määrittää herkkyys ja kliininen spesifisyys, negatiiviset ja positiiviset ennustearvot, todennäköisyyssuhteet ja luottamusvälit.
Menetelmä: Potilaat, joilla on hoitavan lääkärin osoittama FNA, koska heillä on epämääräinen kyhmy, joka on määritettävä, onko se hyvänlaatuinen vai pahanlaatuinen, kutsutaan osallistumaan tähän tutkimukseen. Kun tietoinen suostumus on allekirjoitettu, FNA-näyte otetaan sytologiaa ja molekyylitutkimusta varten. Näytteen saaminen molekyylitutkimusta varten on osa samaa menettelyä. Enintään 4000 näytettä tulee rekisteröidä. Noin 300 täyttää kaikki vaatimukset tutkimuksen loppuun saattamiseksi, mukaan lukien: heillä on vahvistettu epämääräinen sytologia, lähetetään leikkaukseen (kultastandardi) ja heillä on oikea mRNA-näyte. Koko tutkimuksen ajan hoitava lääkäri ei muuta käyttäytymistään missään vaiheessa ja päätökset perustuvat säännöllisesti käytettävään kliiniseen tietoon.
Aikajana/seuranta: Tutkimuksen rekrytointivaiheen odotetaan kestävän noin 28 kuukautta (24 kuukautta ilmoittautumista ja 4 kuukautta seurantaa vähintään kirurgisen biopsian tuloksen saamiseksi). Tätä aikajanaa voidaan kuitenkin pidentää odottaessaan, että 300 määrittelemätöntä näytettä lopettavat tutkimuksen. Jokaisella paikalla on päätutkija, jota ohjaa palkattu CRO ja joka valvoo kokeen asianmukaista suorittamista.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Santiago, Chile
- Hospital Clínico de la Universidad de Chile
-
-
Region Metropolitana
-
Santiago, Region Metropolitana, Chile
- Clinica Alemana de Santiago
-
Santiago, Region Metropolitana, Chile
- Centro de Diagnóstico Plaza Italia
-
Santiago, Region Metropolitana, Chile
- Hospital Clinico de la Pontificia Universidad Catolica de Chile
-
-
Región Metropolitana
-
Santiago, Región Metropolitana, Chile
- Clínica San Carlos de Apoquindo
-
Santiago, Región Metropolitana, Chile
- Clinica Santa Maria
-
Santiago, Región Metropolitana, Chile
- Fundacion Arturo Lopez Perez
-
Santiago, Región Metropolitana, Chile
- Hospital del Salvador
-
Santiago, Región Metropolitana, Chile
- Hospital San Juan de Dios
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Potilas ≥ 18 vuotta vanha, mies tai nainen Patentti, jonka kilpirauhasen kyhmy on ultraäänellä mitattuna halkaisijaltaan ≥ 8,0 mm. Potilas, jolla on merkkejä kilpirauhasen hienoneulaaspiraatiosta (FNA). Potilas, jolla ei ole todettu spontaaneja verenvuotoja. Potilas voi ymmärtää ja allekirjoittaa ICF:n.
Poissulkemiskriteerit:
- Potilas alle 18-vuotias, mies tai nainen.
- Potilas, jolla on ultraäänidiagnoosissa kilpirauhasen kyhmy < 8,0 mm.
- Potilas, jolla on todettu spontaania verenvuotoa.
- Potilas, jolla on tämänhetkisiä verenvuoto-oireita.
- Potilas, joka ei ymmärrä ja allekirjoittaa ICF:n.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tarkista herkkyys, spesifisyys, NPV, PPV.
Aikaikkuna: 30 kuukautta
|
Herkkyys: Todelliset positiiviset Spesifisyys: Todelliset negatiiviset NPV: Kyky ennustaa hyvänlaatuinen PPV: Kyky ennustaa pahanlaatuinen
|
30 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Opintojohtaja: Hernán E González, MD, Pontificia Universidad Católica de Chile
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Alexander EK, Kennedy GC, Baloch ZW, Cibas ES, Chudova D, Diggans J, Friedman L, Kloos RT, LiVolsi VA, Mandel SJ, Raab SS, Rosai J, Steward DL, Walsh PS, Wilde JI, Zeiger MA, Lanman RB, Haugen BR. Preoperative diagnosis of benign thyroid nodules with indeterminate cytology. N Engl J Med. 2012 Aug 23;367(8):705-15. doi: 10.1056/NEJMoa1203208. Epub 2012 Jun 25.
- Sosa JA, Hanna JW, Robinson KA, Lanman RB. Increases in thyroid nodule fine-needle aspirations, operations, and diagnoses of thyroid cancer in the United States. Surgery. 2013 Dec;154(6):1420-6; discussion 1426-7. doi: 10.1016/j.surg.2013.07.006. Epub 2013 Oct 2.
- Pfaffl MW. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR. Nucleic Acids Res. 2001 May 1;29(9):e45. doi: 10.1093/nar/29.9.e45.
- Bongiovanni M, Spitale A, Faquin WC, Mazzucchelli L, Baloch ZW. The Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopathology: a meta-analysis. Acta Cytol. 2012;56(4):333-9. doi: 10.1159/000339959. Epub 2012 Jul 25.
- Hodak SP, Rosenthal DS; American Thyroid Association Clinical Affairs Committee. Information for clinicians: commercially available molecular diagnosis testing in the evaluation of thyroid nodule fine-needle aspiration specimens. Thyroid. 2013 Feb;23(2):131-4. doi: 10.1089/thy.2012.0320. Epub 2012 Nov 27.
- Nikiforova MN, Wald AI, Roy S, Durso MB, Nikiforov YE. Targeted next-generation sequencing panel (ThyroSeq) for detection of mutations in thyroid cancer. J Clin Endocrinol Metab. 2013 Nov;98(11):E1852-60. doi: 10.1210/jc.2013-2292. Epub 2013 Aug 26.
- Ali SZ, Fish SA, Lanman R, Randolph GW, Sosa JA. Use of the afirma(R) gene expression classifier for preoperative identification of benign thyroid nodules with indeterminate fine needle aspiration cytopathology. PLoS Curr. 2013 Feb 11;5:ecurrents.eogt.e557cbb5c7e4f66568ce582a373057e7. doi: 10.1371/currents.eogt.e557cbb5c7e4f66568ce582a373057e7.
- Sipos JA, Mazzaferri EL. Thyroid cancer epidemiology and prognostic variables. Clin Oncol (R Coll Radiol). 2010 Aug;22(6):395-404. doi: 10.1016/j.clon.2010.05.004. Epub 2010 Jun 3.
- Pellegriti G, Frasca F, Regalbuto C, Squatrito S, Vigneri R. Worldwide increasing incidence of thyroid cancer: update on epidemiology and risk factors. J Cancer Epidemiol. 2013;2013:965212. doi: 10.1155/2013/965212. Epub 2013 May 7.
- Davies L, Welch HG. Current thyroid cancer trends in the United States. JAMA Otolaryngol Head Neck Surg. 2014 Apr;140(4):317-22. doi: 10.1001/jamaoto.2014.1.
- Wang CC, Friedman L, Kennedy GC, Wang H, Kebebew E, Steward DL, Zeiger MA, Westra WH, Wang Y, Khanafshar E, Fellegara G, Rosai J, Livolsi V, Lanman RB. A large multicenter correlation study of thyroid nodule cytopathology and histopathology. Thyroid. 2011 Mar;21(3):243-51. doi: 10.1089/thy.2010.0243. Epub 2010 Dec 29.
- Nikiforov YE, Ohori NP, Hodak SP, Carty SE, LeBeau SO, Ferris RL, Yip L, Seethala RR, Tublin ME, Stang MT, Coyne C, Johnson JT, Stewart AF, Nikiforova MN. Impact of mutational testing on the diagnosis and management of patients with cytologically indeterminate thyroid nodules: a prospective analysis of 1056 FNA samples. J Clin Endocrinol Metab. 2011 Nov;96(11):3390-7. doi: 10.1210/jc.2011-1469. Epub 2011 Aug 31.
- Najafzadeh M, Marra CA, Lynd LD, Wiseman SM. Cost-effectiveness of using a molecular diagnostic test to improve preoperative diagnosis of thyroid cancer. Value Health. 2012 Dec;15(8):1005-13. doi: 10.1016/j.jval.2012.06.017. Epub 2012 Sep 25.
- Bustin SA, Benes V, Garson JA, Hellemans J, Huggett J, Kubista M, Mueller R, Nolan T, Pfaffl MW, Shipley GL, Vandesompele J, Wittwer CT. The MIQE guidelines: minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments. Clin Chem. 2009 Apr;55(4):611-22. doi: 10.1373/clinchem.2008.112797. Epub 2009 Feb 26.
- Vergara IA, Norambuena T, Ferrada E, Slater AW, Melo F. StAR: a simple tool for the statistical comparison of ROC curves. BMC Bioinformatics. 2008 Jun 5;9:265. doi: 10.1186/1471-2105-9-265.
- Melo F, Sali A. Fold assessment for comparative protein structure modeling. Protein Sci. 2007 Nov;16(11):2412-26. doi: 10.1110/ps.072895107. Epub 2007 Sep 28.
- Lewis CM, Chang KP, Pitman M, Faquin WC, Randolph GW. Thyroid fine-needle aspiration biopsy: variability in reporting. Thyroid. 2009 Jul;19(7):717-23. doi: 10.1089/thy.2008.0425.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 14-463
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .