ANDDI-PRENATOME - Toteutettavuustutkimus "nopealle" pangenomiselle korkean suorituskyvyn sekvensointianalyysille synnytystä edeltävässä diagnoosissa (AnddiPrenatome)
Geneettisten sairauksien synnytystä edeltävä diagnoosi on todellinen lääketieteellinen haaste. Synnytyksen poikkeavuuksien havaitseminen ultraäänellä on yleistä (5-10 % raskauksista), ja kun ultraäänitutkimuksessa havaitaan poikkeavuus, se lisää taustalla olevan kehityshäiriön mahdollisuutta. Tällä hetkellä Ranskassa, kun ultraäänitutkimuksella havaitaan poikkeavuuksia, etiologinen diagnoosi perustuu ylimääräisiin kuvantamistutkimuksiin (aivojen MRI, 3D luutomografia, sikiön CT, sikiön CT) tai diagnostisiin testeihin, kuten invasiiviseen suonikalvon näytteenottoon, lapsivesitutkimukseen tai sikiön tutkimukseen. veri infektio-, aineenvaihdunta-, immunologisiin ja geneettisiin tutkimuksiin (standardi karyotyyppi, FISH (fluoresenssi in situ -hybridisaatio) aneuploidian nopeaan havaitsemiseen, kromosomianalyysi DNA-sirulla (ACPA tai CGH-array) ja mahdollinen kohdegeenien sekvensointi, kun niitä on saatavilla raskauden kanssa yhteensopivan ajan sisällä). Äidin veressä kiertävän soluttoman sikiön DNA:n NIPT:llä (non-invasive prenatal testing) on rajallisempi indikaatio, joka mahdollistaa sikiön sukupuolen ja sikiön reesustekijän määrittämisen ja aneuploidian etsimisen jo raskauden alkuvaiheessa.
Etiologisen diagnoosin asettamisesta raskauden aikana on kuitenkin monia etuja vanhemmille: syyn selvittäminen, tarkemman ennusteen saaminen raskauden tulevan hallinnan ja lopputuloksen määrittämiseksi sekä uusiutumisriskien selvittäminen.
Viime vuosikymmenen aikana lääketieteellinen genetiikka on käynyt läpi todellisen teknologisen vallankumouksen, joka on johtanut korkean suorituskyvyn genominlaajuisen, eksomin (ES) ja genomin (GS) sekvensoinnin kehittämiseen. Kuitenkin harvat maat ovat tällä hetkellä ottaneet käyttöön ES/GS:n synnytystä edeltävässä hoidossa aikarajoitusten ja genomitietojen tulkinnan vaikeuden vuoksi, kun kliiniset tiedot rajoittuvat synnytystä edeltävään kuvantamistietoon.
Ranska käynnisti vuonna 2016 France Medicine Genomics 2025 -suunnitelman (PFMG2025) ottaakseen käyttöön GS:n erityisesti harvinaisten sairauksien diagnosoinnissa. Tästä syystä on tulossa oleellisen tärkeäksi määritellä tämän testauksen määräämisen yksityiskohtaiset säännöt, erityisesti synnytystä edeltävän diagnoosin aikana. Samanaikaisesti ensimmäisistä julkaisuista lähtien kiertävän sikiön DNA:n genomianalyysin sovellukset näyttävät voivan ulottua genomin sekvensointiin kehityssairauksista vastuussa olevien SNV:iden tutkimuksessa.
AnDDI-harvinaisten terveydenhuoltoverkosto ehdottaa siksi tätä ANDDI-PRENATOME-pilottiprojektia, jossa tutkitaan ES:n "nopean" analyysin toteutettavuutta synnytystä edeltävässä diagnoosissa 61 sikiöstä, joilla on ultraäänipoikkeavuuksia, ensimmäisenä askeleena ennen kuin harkitaan tulevaa kustannustehokkuutta (PRME) tai PREPS-tutkimukset yhdessä PFMG2025:n kanssa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
- Biologinen: Invasiivinen sikiönäytteenotto, äidin ja isän verinäytteet
- Muut: Vanhempien haastattelut (valinnainen organisaatiotutkimus)
- Muut: vanhempien kysely (valinnainen organisaatiotutkimus)
- Biologinen: verinäytteen ottaminen äidiltä kiertävän soluttoman sikiön DNA:n talteenottamiseksi
- Muut: ammatilliset haastattelut (valinnainen organisaatiotutkimus)
- Muut: Fokusryhmä ammattilaisille (valinnainen organisaatiotutkimus)
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Dijon, Ranska, 21079
- CHU Dijon Bourgogne
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Raskaana olevat naiset, joilla on ennen synnytystä löydetty vähintään kaksi synnytyksen poikkeavaa synnytyksen ultraäänitutkimuksessa (2 suurta epämuodostumaa tai 1 suuri epämuodostuma ja 1 pieni epämuodostuma tai 1 eristetty epämuodostuma, jolla on suuri geneettisen tilan todennäköisyys): joille tehdään invasiivinen synnytystä edeltävä näyte CGH-array-diagnoosia varten ; jolle on jo otettu invasiivinen syntymää edeltävä näyte CGH-array-diagnoosin diagnosoimiseksi ja jolle sikiön CGH-array on todettu normaaliksi (sikiön DNA:ta tai lapsivettä on oltava saatavilla riittävästi, jotta eksoomisekvensointi voidaan suorittaa ilman lisää lapsivettä puhkaisu).
- Raskaana oleva nainen ja isä vähintään 18-vuotiaat
- Raskaana olevan naisen ja sikiön isän antama kirjallinen suostumus
- Mahdollisuus saada riittävästi sikiönäytettä (lapsivesi tai sikiön veri) lisänäytteen keräämiseksi pilottiprojektia varten
- Mahdollisuus ottaa näytteitä raskaana olevasta naisesta ja sikiön isästä (perifeerinen veri)
- Raskaana oleva nainen ja sikiön isä pystyvät ymmärtämään tutkimuksen
Pilottiorganisaatiotutkimus:
Päätutkimuksen mukaanotto- ja poissulkemiskriteerien lisäksi:
- Raskaana oleva nainen ja sikiön biologinen isä, joka antoi suullisen suostumuksen haastatteluun
- Ammattilaiset (synnyttäjä, kätilö, geneetikko, biologi) suostuvat haastatteluun
Poissulkemiskriteerit:
- Erittäin todennäköisenä pidetty diagnostinen hypoteesi, joka voidaan vahvistaa saatavilla olevalla molekyyli- tai sytogeneettisellä testillä edullisemmin kuin ES (esim. 22q11-mikrodeleetio) tai suurella epäilyllä sikiöinfektiosta (esim. toksoplamoosin serokonversio).
- Raskaana olevan naisen tai sikiön isän kieltäytyminen osallistumasta tutkimukseen
- Raskaus aikaisemmin kuin 15 viikkoa kuukautisia tai myöhemmin kuin 34 viikkoa amenorreaa
- Raskaana oleva nainen ja sikiön isä, jotka eivät kuulu kansallisen sairausvakuutusjärjestelmän piiriin
- Raskaana oleva nainen ja/tai sikiön isä osittaisen oikeussuojan alaisena
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
ohjata
sikiö, jolla on vähintään 2 ultraäänipoikkeavuutta ja molemmat vanhemmat
|
suorittaa exome-sekvensointianalyysi triossa
Haastattelu sosiologin tai psykologin kanssa selvittääksesi käsityksiä ES:stä ja tulosten vaikutuksista, odotuksia tietyntyyppisistä tuloksista, joita ei tällä hetkellä ole saatavilla, emotionaalista tilannetta ja kantaa raskauden jatkumiseen 4 eri ajankohtana: sisällytyksessä, CGA-taulukon tulosten aikaan, ES-tulosten aikaan ja etäisyyden päässä ES-tuloksista
Arvioida kokemuksia, havaintoja, analyysien vaikutusta päätökseen, tyytyväisyyttä ja huolenaiheita ES:stä ja sen tuloksista, mielipiteitä tietyntyyppisistä tuloksista, joita ei ole tällä hetkellä saatavilla, sekä ahdistusta ja mahdollista psyykkistä kärsimystä 4 eri ajankohtana : sisällytettäessä, toimitettaessa CGA-taulukon tulokset, toimitettaessa ES-tuloksia ja etäisyyden päässä ES-tulosten toimittamisesta
|
|
vertailu
sikiö, jolla on vähintään 2 ultraäänipoikkeavuutta ja ES-diagnoosi invasiivisessa sikiönäytteenotossa
|
suorittaa exome-sekvensointianalyysi triossa
Haastattelu sosiologin tai psykologin kanssa selvittääksesi käsityksiä ES:stä ja tulosten vaikutuksista, odotuksia tietyntyyppisistä tuloksista, joita ei tällä hetkellä ole saatavilla, emotionaalista tilannetta ja kantaa raskauden jatkumiseen 4 eri ajankohtana: sisällytyksessä, CGA-taulukon tulosten aikaan, ES-tulosten aikaan ja etäisyyden päässä ES-tuloksista
Arvioida kokemuksia, havaintoja, analyysien vaikutusta päätökseen, tyytyväisyyttä ja huolenaiheita ES:stä ja sen tuloksista, mielipiteitä tietyntyyppisistä tuloksista, joita ei ole tällä hetkellä saatavilla, sekä ahdistusta ja mahdollista psyykkistä kärsimystä 4 eri ajankohtana : sisällytettäessä, toimitettaessa CGA-taulukon tulokset, toimitettaessa ES-tuloksia ja etäisyyden päässä ES-tulosten toimittamisesta
suorittaakseen kiertävän vapaan sikiön DNA:n genomin sekvensointianalyysin
|
|
ammattilainen
synnytyslääkäri, kätilö, geneetikko, biologi
|
haastattelu ymmärtääksesi, miten päätös syntyy
haastattelu sen selvittämiseksi, onko VUS mahdollisesti palautettu kliinikoille tai jopa potilaalle lääkärin kautta.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Aika, joka tarvitaan ES-tulosten palauttamiseen potilaille ja heidän perheilleen synnytystä edeltävän diagnoosin yhteydessä
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
|
ES:n ja WGS:n välisten erojen määrä
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kyselylomake ymmärtääksesi pariskuntien odotukset ja heidän a priori käsityksensä ES:stä
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Määritellä tunteita ja tietää paremmin, miten parit näkevät ES:n ja sen seuraukset ja erityisesti riskin VUS:n (merkittävyyden tuntemattoman muunnelman) ja ID:n (satunnaiset tiedot) löytämisestä.
|
Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
|
Kyselylomake päätöksentekoprosessiin osallistuvien terveydenhuollon ammattilaisten organisaation arvioimiseksi
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 12 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Tran Mau-Them F, Delanne J, Denomme-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet. 2023 Mar 23;14:1099995. doi: 10.3389/fgene.2023.1099995. eCollection 2023.
- Thauvin-Robinet C, Garde A, Delanne J, Racine C, Rousseau T, Simon E, Francois M, Moutton S, Sylvie O, Quelin C, Morel G, Goldenberg A, Guerrot AM, Vera G, Gruchy N, Colson C, Boute O, Abel C, Putoux A, Amiel J, Guichet A, Isidor B, Deiller C, Wells C, Rooryck C, Legendre M, Francannet C, Dard R, Sigaudy S, Bruel AL, Safraou H, Denomme-Pichon AS, Nambot S, Asensio MH, Binquet C, Duffourd Y, Vitobello A, Philippe C, Faivre L, Tran-Mau-Them F, Bourgon N. Prenatal exome sequencing, a powerful tool for improving the description of prenatal features associated with genetic disorders. Prenat Diagn. 2024 Sep;44(10):1179-1197. doi: 10.1002/pd.6623. Epub 2024 Aug 13.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .