ANDDI-PRENATOME - Mulighetsstudie for en "rask" pangenomisk sekvenseringsanalyse med høy gjennomstrømning i prenatal diagnose (AnddiPrenatome)
Prenatal diagnose av genetiske sykdommer er en reell medisinsk utfordring. Oppdagelsen av prenatale abnormiteter på ultralyd er hyppig (5 til 10 % av svangerskapene), og når en abnormitet sees på ultralyd, øker det muligheten for en underliggende utviklingsavvik. For øyeblikket, i Frankrike, når abnormiteter oppdages med en ultralydsskanning, er den etiologiske diagnosen basert på ytterligere bildediagnostiske tester (cerebral MR, 3D-bentomografi, føtal CT, føtal CT) eller diagnostiske tester som invasiv chorionic villus prøvetaking, fostervannsprøve eller foster blod for infeksiøse, metabolske, immunologiske og genetiske undersøkelser (standard karyotype, FISH (fluorescens in situ hybridisering) for rask påvisning av aneuploidi, kromosomanalyse på DNA-brikke (ACPA eller CGH-array) og mulig sekvensering av målrettede gener når de er tilgjengelige innenfor en tidsramme som er kompatibel med graviditet). NIPT (Non-invasive prenatal testing) på cellefritt føtalt DNA som sirkulerer i mors blod har mer begrensede indikasjoner, og tillater, fra et tidlig stadium av svangerskapet, bestemmelse av fosterkjønn og føtal rhesusfaktor og leting etter aneuploidi.
Å etablere en etiologisk diagnose under graviditet har imidlertid mange fordeler for foreldrene: klargjøring av årsaken, oppnåelse av en mer presis prognose for å bestemme fremtidig behandling og utfall av svangerskapet, og fastslå risikoen for tilbakefall.
I løpet av det siste tiåret har medisinsk genetikk gjennomgått en reell teknologisk revolusjon, noe som har ført til utviklingen av høy gjennomstrømming av genomomfattende, exome (ES) og genom (GS) sekvensering. Imidlertid har få land foreløpig tatt fatt på ES/GS i prenatal omsorg, på grunn av tidsbegrensninger og vanskelighetene med å tolke genomiske data når de kliniske dataene er begrenset til prenatal bildediagnostikk.
I 2016 lanserte Frankrike France Medicine Genomics 2025 Plan (PFMG2025) for å distribuere GS, spesielt ved diagnostisering av sjeldne sykdommer. Det er derfor i ferd med å bli viktig å definere forskrivningsmetodene for denne testen, spesielt under prenatal diagnose. Parallelt, fra de første publikasjonene, ser anvendelsen av genomisk analyse på sirkulerende føtalt DNA ut til å kunne utvides til genomsekvensering for forskning av SNV-er som er ansvarlige for utviklingssykdommer.
Helsenettverket AndDDI-rares foreslår derfor dette ANDDI-PRENATOME-pilotprosjektet for å studere muligheten for en "rask" analyse av ES ved prenatal diagnose fra 61 fostre med ultralydavvik, som et første skritt før man vurderer fremtidig kostnadseffektivitet (PRME) eller omsorgssystemytelse (PREPS) studier i forbindelse med PFMG2025.
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
- Biologisk: Invasiv fosterprøvetaking, blodprøvetaking av mor og far
- Annen: Foreldresamtaler (valgfritt organisasjonsstudie)
- Annen: foreldrespørreskjema (valgfri organisasjonsstudie)
- Biologisk: blodprøvetaking fra moren for å gjenvinne det sirkulerende cellefrie fosterets DNA
- Annen: faglige intervjuer (valgfritt organisasjonsstudie)
- Annen: Fokusgruppe for fagfolk (valgfritt organisasjonsstudium)
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Dijon, Frankrike, 21079
- CHU Dijon Bourgogne
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Gravide kvinner med prenatal oppdagelse av minst to obstetriske ultralydavvik (2 store misdannelser, eller 1 større misdannelse og 1 mindre misdannelse, eller 1 isolert misdannelse med høy sannsynlighet for en genetisk tilstand): som gjennomgår invasiv antenatal prøvetaking for CGH-array-diagnose ; som allerede har tatt en invasiv antenatal prøvetaking for diagnostisering av CGH-array og hvor føtal CGH-array er funnet å være normal (tilstrekkelig føtalt DNA eller fostervann bør være tilgjengelig for å tillate eksomsekvensering uten ytterligere fostervann punktering).
- Gravid kvinne og far på 18 år eller mer
- Skriftlig samtykke gitt av den gravide kvinnen og faren til fosteret
- Mulighet for tilstrekkelig føtalprøve (fostervann eller føtalt blod) for å ta en ekstra prøve for pilotprosjektet
- Mulighet for prøvetaking av den gravide kvinnen og faren til fosteret (perifert blod)
- Gravid kvinne og far til fosteret i stand til å forstå studien
Pilot organisasjonsstudie:
I tillegg til inkluderings- og eksklusjonskriteriene for hovedstudien:
- Gravid kvinne og biologisk far til foster som ga muntlig samtykke til intervju
- Fagpersoner (fødselslege, jordmor, genetiker, biolog) samtykker i å bli intervjuet
Ekskluderingskriterier:
- Diagnostisk hypotese anses som svært sannsynlig og kan bekreftes av en tilgjengelig molekylær eller cytogenetisk test med en lavere kostnad enn ES (f.eks. 22q11 mikrodelesjon) eller høy mistanke om fosterinfeksjon (f.eks. toksoplatoseserokonversjon)
- Avslag fra gravid kvinne eller far til foster å delta i studien
- Graviditet tidligere enn 15 uker med amenoré eller senere enn 34 uker med amenoré
- Gravid kvinne og fosterfar som ikke dekkes av det nasjonale helseforsikringssystemet
- Gravid kvinne og/eller far til fosteret under delvis rettslig beskyttelse
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
kontroll
foster med minst 2 ultralydavvik og begge foreldrene
|
å utføre en exome-sekvenseringsanalyse i trio
Intervju med en sosiolog eller psykolog for å utforske oppfatninger av ES og virkningen av resultatene, forventninger til visse typer resultater som ikke er tilgjengelige for øyeblikket, den emosjonelle situasjonen, og posisjon angående fortsettelsen av svangerskapet På 4 forskjellige tidspunkter: ved inkludering, kl. tidspunktet for CGA-matriseresultatene, på tidspunktet for ES-resultatene og i avstand fra ES-resultatene
For å evaluere opplevelsen, oppfatningene, innvirkningen av analysene på beslutningen, tilfredshet og bekymringer angående ES og dens resultater, meninger om visse typer resultater som ikke er tilgjengelige for øyeblikket, samt angst og mulig psykologisk lidelse på 4 forskjellige tidspunkter : ved inkludering, ved levering av CGA-array-resultatene, ved levering av ES-resultatene og i en avstand fra leveringen av ES-resultatene
|
|
sammenligning
foster med minst 2 ultralydavvik med ES-diagnose på invasiv fosterprøvetaking
|
å utføre en exome-sekvenseringsanalyse i trio
Intervju med en sosiolog eller psykolog for å utforske oppfatninger av ES og virkningen av resultatene, forventninger til visse typer resultater som ikke er tilgjengelige for øyeblikket, den emosjonelle situasjonen, og posisjon angående fortsettelsen av svangerskapet På 4 forskjellige tidspunkter: ved inkludering, kl. tidspunktet for CGA-matriseresultatene, på tidspunktet for ES-resultatene og i avstand fra ES-resultatene
For å evaluere opplevelsen, oppfatningene, innvirkningen av analysene på beslutningen, tilfredshet og bekymringer angående ES og dens resultater, meninger om visse typer resultater som ikke er tilgjengelige for øyeblikket, samt angst og mulig psykologisk lidelse på 4 forskjellige tidspunkter : ved inkludering, ved levering av CGA-array-resultatene, ved levering av ES-resultatene og i en avstand fra leveringen av ES-resultatene
å utføre en sekvenseringsanalyse av genomet til sirkulerende fritt føtalt DNA
|
|
profesjonell
fødselslege, jordmor, genetiker, biolog
|
intervju for å forstå hvordan beslutningen er dannet
intervju for å spesifisere om varianter av ukjent betydning) VUS potensielt vil bli returnert til klinikerne, eller til og med til pasienten via klinikeren.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Tid som kreves for å returnere ES-resultater til pasienter og deres familier i en kontekst prenatal diagnose
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
|
antall avvik mellom ES og WGS
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Spørreskjema for å forstå forventningene til par og deres a priori oppfatning av ES
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Å definere følelser og å vite bedre hvordan par oppfatter ES og dets implikasjoner og spesielt risikoen for oppdagelse av VUS (varianter av ukjent betydning) og ID (tilfeldig data).
|
Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
|
Spørreskjema for å evaluere organiseringen av helsepersonell involvert i beslutningsprosessen
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 12 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Tran Mau-Them F, Delanne J, Denomme-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet. 2023 Mar 23;14:1099995. doi: 10.3389/fgene.2023.1099995. eCollection 2023.
- Thauvin-Robinet C, Garde A, Delanne J, Racine C, Rousseau T, Simon E, Francois M, Moutton S, Sylvie O, Quelin C, Morel G, Goldenberg A, Guerrot AM, Vera G, Gruchy N, Colson C, Boute O, Abel C, Putoux A, Amiel J, Guichet A, Isidor B, Deiller C, Wells C, Rooryck C, Legendre M, Francannet C, Dard R, Sigaudy S, Bruel AL, Safraou H, Denomme-Pichon AS, Nambot S, Asensio MH, Binquet C, Duffourd Y, Vitobello A, Philippe C, Faivre L, Tran-Mau-Them F, Bourgon N. Prenatal exome sequencing, a powerful tool for improving the description of prenatal features associated with genetic disorders. Prenat Diagn. 2024 Sep;44(10):1179-1197. doi: 10.1002/pd.6623. Epub 2024 Aug 13.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .