ANDDI-PRENATOME - Etude de faisabilité d'une analyse de séquençage pangénomique " rapide " à haut débit dans le diagnostic prénatal (AnddiPrenatome)
Le diagnostic prénatal des maladies génétiques est un véritable défi médical. La découverte d'anomalies anténatales à l'échographie est fréquente (5 à 10 % des grossesses), et lorsqu'une anomalie est vue à l'échographie, elle évoque la possibilité d'une anomalie sous-jacente du développement. Actuellement, en France, lorsque des anomalies sont découvertes à l'échographie, le diagnostic étiologique repose sur des examens complémentaires d'imagerie (IRM cérébrale, tomographie osseuse 3D, scanner fœtal, scanner fœtal) ou des tests diagnostiques tels que le prélèvement invasif de villosités choriales, l'amniocentèse ou l'examen fœtal. sang pour les investigations infectieuses, métaboliques, immunologiques et génétiques (caryotype standard, FISH (hybridation in situ par fluorescence) pour la détection rapide de l'aneuploïdie, analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA ou CGH-array) et séquençage éventuel des gènes ciblés lorsqu'ils sont disponibles dans un délai compatible avec une grossesse). Le NIPT (Test prénatal non invasif) sur ADN fœtal acellulaire circulant dans le sang maternel a des indications plus limitées, permettant, dès le début de la grossesse, la détermination du sexe fœtal et du facteur rhésus fœtal et la recherche d'une aneuploïdie.
Cependant, établir un diagnostic étiologique pendant la grossesse présente de nombreux avantages pour les parents : clarifier la cause, obtenir un pronostic plus précis pour déterminer la prise en charge future et l'issue de la grossesse, établir les risques de récidive.
Au cours de la dernière décennie, la génétique médicale a connu une véritable révolution technologique, conduisant au développement du séquençage pangénomique à haut débit, des exomes (ES) et des génomes (GS). Cependant, peu de pays se sont actuellement lancés dans l'ES/GS en soins prénatals, en raison des contraintes de temps et de la difficulté d'interprétation des données génomiques lorsque les données cliniques se limitent aux données d'imagerie prénatale.
En 2016, la France a lancé le Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG2025) pour déployer la SG, notamment dans le diagnostic des maladies rares. Il devient donc indispensable de définir les modalités de prescription de ces tests, notamment lors du diagnostic prénatal. En parallèle, dès les premières publications, les applications de l'analyse génomique sur l'ADN fœtal circulant semblent pouvoir s'étendre au séquençage du génome pour la recherche des SNV responsables de maladies du développement.
Le réseau de santé AnDDI-rares propose donc ce projet pilote ANDDI-PRENATOME pour étudier la faisabilité d'une analyse "rapide" des SE en diagnostic prénatal à partir de 61 fœtus présentant des anomalies échographiques, dans un premier temps avant d'envisager le futur coût-efficacité (PRME) ou études de performance du système de soins (PREPS) en lien avec le PFMG2025.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
- Biologique: Prélèvement fœtal invasif, prélèvement sanguin de la mère et du père
- Autre: Entretiens avec les parents (étude organisationnelle facultative)
- Autre: questionnaire parent (étude organisationnelle facultative)
- Biologique: Prélèvement sanguin de la mère pour récupérer l'ADN fœtal exempt de cellules circulantes
- Autre: entretiens professionnels (étude organisationnelle facultative)
- Autre: Focus group pour professionnels (étude organisationnelle optionnelle)
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Christel THAUVIN
- Numéro de téléphone: +33 03.80.29.53.13
- E-mail: christel.thauvin@chu-dijon.fr
Lieux d'étude
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Dijon, France, 21079
- Recrutement
- CHU Dijon Bourgogne
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Contact:
- Christel THAUVIN
- Numéro de téléphone: +33 03.80.29.53.13
- E-mail: christel.thauvin@chu-dijon.fr
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Femmes enceintes avec découverte anténatale d'au moins deux anomalies échographiques obstétricales (2 malformations majeures, ou 1 malformation majeure et 1 malformation mineure, ou 1 malformation isolée avec une forte probabilité d'une condition génétique) : qui subissent un prélèvement anténatal invasif pour le diagnostic par CGH-array ; qui a déjà subi un prélèvement prénatal invasif pour le diagnostic de CGH-array et pour lequel le fœtus CGH-array s'est avéré normal (une quantité suffisante d'ADN fœtal ou de liquide amniotique doit être disponible pour permettre le séquençage de l'exome sans autre liquide amniotique crevaison).
- Femme enceinte et père âgés de 18 ans ou plus
- Consentement écrit fourni par la femme enceinte et le père du fœtus
- Possibilité d'un échantillon fœtal suffisant (liquide amniotique ou sang fœtal) pour prélever un échantillon supplémentaire pour le projet pilote
- Possibilité de prélever la femme enceinte et le père du fœtus (sang périphérique)
- Femme enceinte et père du fœtus capable de comprendre l'étude
Étude organisationnelle pilote :
En plus des critères d'inclusion et d'exclusion de l'étude principale :
- Femme enceinte et père biologique du fœtus qui ont donné leur consentement oral pour être interrogés
- Professionnels (obstétricien, sage-femme, généticien, biologiste) acceptant d'être interviewés
Critère d'exclusion:
- Hypothèse diagnostique considérée comme hautement probable pouvant être confirmée par un test moléculaire ou cytogénétique disponible avec un coût moindre que l'ES (ex. microdélétion 22q11) ou forte suspicion d'infection fœtale (ex. séroconversion toxoplasmique)
- Refus de la femme enceinte ou du père du fœtus de participer à l'étude
- Grossesse avant 15 semaines d'aménorrhée ou après 34 semaines d'aménorrhée
- Femme enceinte et père du fœtus non couverts par le système national d'assurance maladie
- Femme enceinte et/ou père du fœtus sous protection judiciaire partielle
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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contrôle
fœtus avec au moins 2 anomalies échographiques et les deux parents
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réaliser une analyse de séquençage de l'exome en trio
Entretien avec un sociologue ou un psychologue pour explorer les perceptions de l'ES et l'impact des résultats, les attentes vis-à-vis de certains types de résultats non disponibles actuellement, la situation émotionnelle et la position vis-à-vis de la poursuite de la grossesse A 4 moments différents : à l'inclusion, à la moment des résultats de la matrice CGA, au moment des résultats ES et à distance des résultats ES
Évaluer l'expérience, les perceptions, l'impact des analyses sur la décision, la satisfaction et les inquiétudes concernant l'ES et ses résultats, les opinions sur certains types de résultats non disponibles actuellement, ainsi que l'anxiété et la détresse psychologique possible À 4 moments différents : à l'inclusion, à la livraison des résultats CGA-array, à la livraison des résultats ES et à distance de la livraison des résultats ES
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comparaison
fœtus avec au moins 2 anomalies échographiques avec diagnostic de SE sur prélèvement fœtal invasif
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réaliser une analyse de séquençage de l'exome en trio
Entretien avec un sociologue ou un psychologue pour explorer les perceptions de l'ES et l'impact des résultats, les attentes vis-à-vis de certains types de résultats non disponibles actuellement, la situation émotionnelle et la position vis-à-vis de la poursuite de la grossesse A 4 moments différents : à l'inclusion, à la moment des résultats de la matrice CGA, au moment des résultats ES et à distance des résultats ES
Évaluer l'expérience, les perceptions, l'impact des analyses sur la décision, la satisfaction et les inquiétudes concernant l'ES et ses résultats, les opinions sur certains types de résultats non disponibles actuellement, ainsi que l'anxiété et la détresse psychologique possible À 4 moments différents : à l'inclusion, à la livraison des résultats CGA-array, à la livraison des résultats ES et à distance de la livraison des résultats ES
Biologique: Prélèvement sanguin de la mère pour récupérer l'ADN fœtal exempt de cellules circulantes
réaliser une analyse de séquençage du génome de l'ADN fœtal libre circulant
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professionnel
obstétricien, sage-femme, généticien, biologiste
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entretien pour comprendre comment la décision est prise
entretien pour préciser si des variants de signification inconnue) VUS seront potentiellement retournés aux cliniciens, voire au patient via le clinicien.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
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Temps nécessaire pour retourner les résultats de la SE aux patients et à leurs familles dans un contexte de diagnostic prénatal
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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nombre d'écarts entre ES et WGS
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Questionnaire pour comprendre les attentes des couples et leur perception a priori des ES
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Définir les sentiments et mieux connaître comment les couples perçoivent l'ES et ses implications et notamment le risque de découverte de VUS (variantes de signification inconnue) et ID (données incidentes).
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Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Questionnaire pour évaluer l'organisation des professionnels de santé impliqués dans le processus décisionnel
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 12 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (RÉEL)
Achèvement primaire (ANTICIPÉ)
Achèvement de l'étude (ANTICIPÉ)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (RÉEL)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (RÉEL)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Autres numéros d'identification d'étude
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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Essais cliniques sur Prénatal
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University of ArkansasRecrutementKōmmour Prenatal chez les femmes enceintes marshallaisesÉtats-Unis