ANDDI-PRENATOME - Machbarkeitsstudie für eine "schnelle" pangenomische Hochdurchsatz-Sequenzierungsanalyse in der Pränataldiagnostik (AnddiPrenatome)

Die pränatale Diagnostik genetischer Erkrankungen ist eine echte medizinische Herausforderung. Die Entdeckung von vorgeburtlichen Anomalien im Ultraschall ist häufig (5 bis 10 % der Schwangerschaften), und wenn im Ultraschall eine Anomalie zu sehen ist, erhöht dies die Möglichkeit einer zugrunde liegenden Entwicklungsanomalie. Wenn in Frankreich Anomalien bei einer Ultraschalluntersuchung entdeckt werden, basiert die ätiologische Diagnose derzeit auf zusätzlichen bildgebenden Verfahren (zerebrale MRT, 3D-Knochentomographie, fötale CT, fötale CT) oder diagnostischen Tests wie invasiver Chorionzottenbiopsie, Amniozentese oder fötaler Blut für infektiöse, metabolische, immunologische und genetische Untersuchungen (Standard-Karyotyp, FISH (Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung) zum schnellen Nachweis von Aneuploidien, Chromosomenanalyse auf DNA-Chips (ACPA oder CGH-Array) und mögliche Sequenzierung von Zielgenen, wenn sie verfügbar sind innerhalb eines mit der Schwangerschaft kompatiblen Zeitrahmens). NIPT (Non-Invasive Prenatal Testing) an zellfreier fötaler DNA, die im mütterlichen Blut zirkuliert, hat begrenztere Indikationen und ermöglicht bereits in einem frühen Stadium der Schwangerschaft die Bestimmung des fötalen Geschlechts und des fötalen Rhesusfaktors sowie die Suche nach Aneuploidie.

Die Erstellung einer ätiologischen Diagnose während der Schwangerschaft hat jedoch viele Vorteile für die Eltern: Klärung der Ursache, Erlangung einer genaueren Prognose zur Bestimmung des zukünftigen Managements und Ausganges der Schwangerschaft und Ermittlung der Risiken eines erneuten Auftretens.

In den letzten zehn Jahren hat die medizinische Genetik eine echte technologische Revolution erlebt, die zur Entwicklung der genomweiten Sequenzierung von Exomen (ES) und Genomen (GS) mit hohem Durchsatz geführt hat. Aufgrund des Zeitdrucks und der Schwierigkeit, genomische Daten zu interpretieren, wenn sich die klinischen Daten auf pränatale Bildgebungsdaten beschränken, haben derzeit jedoch nur wenige Länder mit ES/GS in der Schwangerschaftsvorsorge begonnen.

Im Jahr 2016 startete Frankreich den Plan France Medicine Genomics 2025 (PFMG2025), um GS insbesondere bei der Diagnose seltener Krankheiten einzusetzen. Es wird daher immer wichtiger, die Modalitäten der Verschreibung dieser Tests zu definieren, insbesondere während der pränatalen Diagnostik. Parallel dazu scheinen sich die Anwendungen der Genomanalyse von zirkulierender fötaler DNA seit den ersten Veröffentlichungen auf die Genomsequenzierung für die Erforschung von SNVs erstrecken zu können, die für Entwicklungskrankheiten verantwortlich sind.

Das AnDDI-rares-Gesundheitsnetzwerk schlägt daher dieses ANDDI-PRENATOME-Pilotprojekt vor, um die Machbarkeit einer "schnellen" Analyse von ES in der pränatalen Diagnose von 61 Föten mit Ultraschallanomalien als ersten Schritt zu untersuchen, bevor die zukünftige Kosteneffektivität (PRME) oder berücksichtigt wird Pflegesystemleistungsstudien (PREPS) in Verbindung mit dem PFMG2025.