ANDDI-PRENATOME — studium wykonalności „szybkiej” analizy sekwencjonowania pangenomicznego o dużej przepustowości w diagnostyce prenatalnej (AnddiPrenatome)
Prenatalna diagnostyka chorób genetycznych to prawdziwe wyzwanie medyczne. Odkrycie nieprawidłowości przedporodowych w USG jest częste (5 do 10% ciąż), a gdy nieprawidłowości są widoczne w USG, zwiększa to prawdopodobieństwo leżącej u podłoża anomalii rozwojowej. Obecnie we Francji, w przypadku wykrycia nieprawidłowości w badaniu ultrasonograficznym, rozpoznanie etiologiczne opiera się na dodatkowych badaniach obrazowych (MRI mózgu, tomografia kości 3D, tomografia komputerowa płodu, tomografia komputerowa płodu) lub badaniach diagnostycznych, takich jak inwazyjne pobranie kosmówki kosmówki, amniopunkcja lub badanie płodu. krew do badań zakaźnych, metabolicznych, immunologicznych i genetycznych (kariotyp standardowy, FISH (fluorescencyjna hybrydyzacja in situ) do szybkiego wykrywania aneuploidii, analiza chromosomów na chipie DNA (ACPA lub CGH-array) i ewentualne sekwencjonowanie docelowych genów, gdy są one dostępne w ramach czasowych zgodnych z ciążą). NIPT (nieinwazyjne badanie prenatalne) na wolnym od komórek DNA płodu krążącym we krwi matki ma bardziej ograniczone wskazania, pozwalając już od wczesnego etapu ciąży na określenie płci płodu i płodowego czynnika rezus oraz poszukiwanie aneuploidii.
Jednak ustalenie rozpoznania etiologicznego w czasie ciąży niesie ze sobą wiele korzyści dla rodziców: wyjaśnienie przyczyny, uzyskanie dokładniejszej prognozy pozwalającej określić przyszłe postępowanie i wynik ciąży oraz określenie ryzyka nawrotu.
W ciągu ostatniej dekady genetyka medyczna przeszła prawdziwą rewolucję technologiczną, która doprowadziła do opracowania wysokowydajnego sekwencjonowania całego genomu, egzomu (ES) i genomu (GS). Jednak niewiele krajów rozpoczęło obecnie ES/GS w opiece prenatalnej ze względu na ograniczenia czasowe i trudności w interpretacji danych genomowych, gdy dane kliniczne są ograniczone do danych z obrazowania przedporodowego.
W 2016 r. Francja uruchomiła plan France Medicine Genomics 2025 (PFMG2025) w celu wdrożenia GS, szczególnie w diagnostyce rzadkich chorób. Niezbędne staje się zatem określenie zasad przepisywania tych badań, w szczególności w diagnostyce prenatalnej. Równolegle, od pierwszych publikacji, wydaje się, że zastosowania analizy genomowej krążącego DNA płodu mogą rozciągać się na sekwencjonowanie genomu do badań SNV odpowiedzialnych za choroby rozwojowe.
Sieć zdrowia AndDI-rares proponuje zatem pilotażowy projekt ANDDI-PRENATOME w celu zbadania wykonalności „szybkiej” analizy ES w diagnostyce prenatalnej 61 płodów z nieprawidłowościami ultrasonograficznymi, jako pierwszy krok przed rozważeniem przyszłej opłacalności (PRME) lub badania wydajności systemu opieki (PREPS) w połączeniu z PFMG2025.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
- Biologiczny: Inwazyjne pobieranie próbek płodu, pobieranie krwi matki i ojca
- Inny: Wywiady z rodzicami (opcjonalne badanie organizacji)
- Inny: kwestionariusz dla rodziców (opcjonalnie badanie organizacyjne)
- Biologiczny: pobieranie krwi od matki w celu odzyskania wolnego od krążących komórek DNA płodu
- Inny: wywiady zawodowe (opcjonalnie badanie organizacyjne)
- Inny: Grupa fokusowa dla profesjonalistów (opcjonalnie badanie organizacji)
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Dijon, Francja, 21079
- CHU Dijon Bourgogne
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Kobiety w ciąży, u których przed porodem wykryto co najmniej dwie położnicze nieprawidłowości w badaniu USG (2 duże wady rozwojowe lub 1 duża wada rozwojowa i 1 niewielka wada rozwojowa lub 1 izolowana wada rozwojowa z dużym prawdopodobieństwem choroby genetycznej): które poddawane są przedporodowemu inwazyjnemu pobraniu próbek w celu diagnostyki za pomocą macierzy CGH ; u której wykonano już inwazyjne pobieranie próbek przedporodowych w celu rozpoznania macierzy CGH i u której stwierdzono, że macierz CGH płodu jest prawidłowa (powinna być dostępna wystarczająca ilość DNA płodu lub płynu owodniowego, aby umożliwić wykonanie sekwencjonowania egzomu bez dodatkowej ilości płynu owodniowego przebicie).
- Kobieta w ciąży i ojciec w wieku 18 lat lub więcej
- Pisemna zgoda kobiety ciężarnej i ojca płodu
- Możliwość pobrania wystarczającej ilości próbki płodu (płynu owodniowego lub krwi płodu) do pobrania dodatkowej próbki do projektu pilotażowego
- Możliwość pobrania próbki od kobiety ciężarnej i ojca płodu (krew obwodowa)
- Kobieta w ciąży i ojciec płodu w stanie zrozumieć badanie
Pilotażowe badanie organizacyjne:
Oprócz kryteriów włączenia i wyłączenia z badania głównego:
- Kobieta w ciąży i biologiczny ojciec płodu, który wyraził ustną zgodę na przesłuchanie
- Specjaliści (położnik, położna, genetyk, biolog) zgadzają się na wywiad
Kryteria wyłączenia:
- Hipoteza diagnostyczna uznana za wysoce prawdopodobną, którą można potwierdzić dostępnym testem molekularnym lub cytogenetycznym o niższym koszcie niż ES (np. mikrodelecja 22q11) lub dużym podejrzeniu zakażenia płodu (np. serokonwersja toksoplamozy)
- Odmowa udziału w badaniu kobiety ciężarnej lub ojca płodu
- Ciąża wcześniej niż 15 tygodni braku miesiączki lub później niż 34 tygodnie braku miesiączki
- Kobieta w ciąży i ojciec płodu nieobjęty ubezpieczeniem zdrowotnym
- Kobieta w ciąży i/lub ojciec płodu pod częściową ochroną sądową
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
kontrola
płód z co najmniej 2 nieprawidłowościami USG i oboje rodzice
|
przeprowadzić analizę sekwencjonowania egzomu w trio
Wywiad z socjologiem lub psychologiem w celu zbadania postrzegania ES i wpływu wyników, oczekiwań dotyczących niektórych rodzajów wyników, które obecnie nie są dostępne, sytuacji emocjonalnej i stanowiska dotyczącego kontynuacji ciąży W 4 różnych momentach: w momencie włączenia, w momencie czas wyników z tablicy CGA, w czasie wyników ES i w pewnej odległości od wyników ES
Aby ocenić doświadczenie, spostrzeżenia, wpływ analiz na decyzję, zadowolenie i obawy dotyczące ES i jego wyników, opinie na temat niektórych rodzajów wyników, które obecnie nie są dostępne, a także niepokój i możliwy stres psychiczny W 4 różnych momentach : przy włączeniu, przy dostarczeniu wyników z tablicy CGA, przy dostarczeniu wyników ES i w pewnej odległości od dostarczenia wyników ES
|
|
porównanie
płód z co najmniej 2 nieprawidłowościami ultrasonograficznymi z rozpoznaniem ES w inwazyjnym pobieraniu próbek płodu
|
przeprowadzić analizę sekwencjonowania egzomu w trio
Wywiad z socjologiem lub psychologiem w celu zbadania postrzegania ES i wpływu wyników, oczekiwań dotyczących niektórych rodzajów wyników, które obecnie nie są dostępne, sytuacji emocjonalnej i stanowiska dotyczącego kontynuacji ciąży W 4 różnych momentach: w momencie włączenia, w momencie czas wyników z tablicy CGA, w czasie wyników ES i w pewnej odległości od wyników ES
Aby ocenić doświadczenie, spostrzeżenia, wpływ analiz na decyzję, zadowolenie i obawy dotyczące ES i jego wyników, opinie na temat niektórych rodzajów wyników, które obecnie nie są dostępne, a także niepokój i możliwy stres psychiczny W 4 różnych momentach : przy włączeniu, przy dostarczeniu wyników z tablicy CGA, przy dostarczeniu wyników ES i w pewnej odległości od dostarczenia wyników ES
przeprowadzić analizę sekwencjonowania genomu krążącego wolnego płodowego DNA
|
|
profesjonalny
położnik, położna, genetyk, biolog
|
wywiad, aby zrozumieć, w jaki sposób powstaje decyzja
wywiad, aby określić, czy warianty o nieznanym znaczeniu) VUS zostaną potencjalnie zwrócone klinicystom, a nawet pacjentowi za pośrednictwem lekarza.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Ramy czasowe |
|---|---|
|
Czas potrzebny do zwrócenia wyników ES pacjentom i ich rodzinom w kontekście diagnostyki prenatalnej
Ramy czasowe: Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
|
liczba rozbieżności między ES a WGS
Ramy czasowe: Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Kwestionariusz mający na celu zrozumienie oczekiwań par i ich a priori postrzegania ES
Ramy czasowe: Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Zdefiniowanie uczuć i lepsze poznanie, jak pary postrzegają ES i jego implikacje, aw szczególności ryzyko odkrycia VUS (warianty o nieznanym znaczeniu) i ID (dane incydentalne).
|
Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
|
Kwestionariusz do oceny organizacji pracowników służby zdrowia zaangażowanych w proces decyzyjny
Ramy czasowe: Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Poprzez ukończenie studiów, średnio 12 miesięcy
|
Współpracownicy i badacze
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Tran Mau-Them F, Delanne J, Denomme-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet. 2023 Mar 23;14:1099995. doi: 10.3389/fgene.2023.1099995. eCollection 2023.
- Thauvin-Robinet C, Garde A, Delanne J, Racine C, Rousseau T, Simon E, Francois M, Moutton S, Sylvie O, Quelin C, Morel G, Goldenberg A, Guerrot AM, Vera G, Gruchy N, Colson C, Boute O, Abel C, Putoux A, Amiel J, Guichet A, Isidor B, Deiller C, Wells C, Rooryck C, Legendre M, Francannet C, Dard R, Sigaudy S, Bruel AL, Safraou H, Denomme-Pichon AS, Nambot S, Asensio MH, Binquet C, Duffourd Y, Vitobello A, Philippe C, Faivre L, Tran-Mau-Them F, Bourgon N. Prenatal exome sequencing, a powerful tool for improving the description of prenatal features associated with genetic disorders. Prenat Diagn. 2024 Sep;44(10):1179-1197. doi: 10.1002/pd.6623. Epub 2024 Aug 13.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .