ANDDI-PRENATOME — технико-экономическое обоснование «быстрого» пангеномного анализа высокопроизводительного секвенирования в пренатальной диагностике (AnddiPrenatome)
Пренатальная диагностика генетических заболеваний является настоящей медицинской проблемой. Обнаружение антенатальных аномалий на УЗИ часто (от 5 до 10% беременностей), и когда аномалии видны на УЗИ, это повышает вероятность наличия лежащей в основе аномалии развития. В настоящее время во Франции при обнаружении аномалий при ультразвуковом сканировании этиологический диагноз основывается на дополнительных визуализирующих исследованиях (МРТ головного мозга, 3D-томографии костей, КТ плода, КТ плода) или диагностических тестах, таких как инвазивный биопсий хориона, амниоцентез или фетальный анализ. кровь для инфекционных, метаболических, иммунологических и генетических исследований (стандартный кариотип, FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) для быстрого выявления анеуплоидии, хромосомный анализ на ДНК-чипе (ACPA или CGH-массив) и возможное секвенирование целевых генов, когда они доступны). в сроки, совместимые с беременностью). НИПТ (неинвазивное пренатальное тестирование) на бесклеточную ДНК плода, циркулирующую в материнской крови, имеет более ограниченные показания, позволяя с раннего срока беременности определять пол плода и его резус-фактор, а также искать анеуплоидию.
Однако установление этиологического диагноза во время беременности имеет много преимуществ для родителей: выяснение причины, получение более точного прогноза для определения будущего ведения и исхода беременности, а также установление риска рецидива.
За последнее десятилетие медицинская генетика претерпела настоящую технологическую революцию, что привело к развитию высокопроизводительного полногеномного, экзомного (ES) и геномного (GS) секвенирования. Однако лишь немногие страны в настоящее время приступили к применению ЭС/ГС в дородовой помощи из-за нехватки времени и сложности интерпретации геномных данных, когда клинические данные ограничены данными антенатальной визуализации.
В 2016 году Франция запустила план France Medicine Genomics 2025 (PFMG2025) для внедрения GS, в частности, для диагностики редких заболеваний. Таким образом, становится необходимым определить способы назначения этого тестирования, в частности, во время пренатальной диагностики. Параллельно, начиная с первых публикаций, применение геномного анализа циркулирующей ДНК плода, по-видимому, может распространяться на секвенирование генома для исследования SNV, ответственных за болезни развития.
Поэтому сеть здравоохранения AndDDI-rares предлагает этот пилотный проект ANDDI-PRENATOME для изучения возможности «быстрого» анализа ЭС в пренатальной диагностике у 61 плода с ультразвуковыми аномалиями в качестве первого шага перед рассмотрением будущей экономической эффективности (PRME) или Исследования эффективности системы ухода (PREPS) в сочетании с PFMG2025.
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
- Биологический: Инвазивный забор крови плода, забор крови матери и отца
- Другой: Интервью с родителями (факультативное организационное исследование)
- Другой: Анкета для родителей (факультативное организационное исследование)
- Биологический: забор крови у матери для восстановления циркулирующей внеклеточной ДНК плода
- Другой: профессиональные интервью (дополнительное организационное исследование)
- Другой: Фокус-группа для профессионалов (дополнительное организационное исследование)
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Dijon, Франция, 21079
- CHU Dijon Bourgogne
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Беременные женщины с антенатальным обнаружением как минимум двух акушерских ультразвуковых аномалий (2 больших порока развития, или 1 большой порок развития и 1 малый порок развития, или 1 изолированный порок развития с высокой вероятностью генетического заболевания): которые подвергаются инвазивному антенатальному взятию проб для диагностики CGH-матрицы ; у которых уже был инвазивный антенатальный забор образцов для диагностики CGH-массива и для которого было обнаружено, что фетальный CGH-массив является нормальным (должно быть в наличии достаточно ДНК плода или амниотической жидкости, чтобы можно было выполнить секвенирование экзома без дополнительной амниотической жидкости прокол).
- Беременная женщина и отец в возрасте 18 лет и старше
- Письменное согласие беременной женщины и отца плода
- Возможность получения достаточного количества образца плода (амниотической жидкости или крови плода) для сбора дополнительного образца для пилотного проекта.
- Возможность забора крови у беременной и отца плода (периферическая кровь)
- Беременная женщина и отец плода в состоянии понять исследование
Пилотное организационное исследование:
В дополнение к критериям включения и исключения основного исследования:
- Беременная женщина и биологический отец плода, давшие устное согласие на интервью
- Профессионалы (акушер, акушер, генетик, биолог), согласившиеся на интервью
Критерий исключения:
- Диагностическая гипотеза считается высоковероятной и может быть подтверждена доступным молекулярным или цитогенетическим тестом с меньшей стоимостью, чем ЭС (например, микроделеция 22q11) или высоким подозрением на внутриутробную инфекцию (например, сероконверсия токсопламоза)
- Отказ беременной женщины или отца плода от участия в исследовании
- Беременность ранее 15 недель аменореи или позднее 34 недель аменореи
- Беременная женщина и отец плода, не охваченные национальной системой медицинского страхования
- Беременная женщина и/или отец плода, находящиеся под частичной судебной защитой
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
контроль
плод с не менее чем двумя ультразвуковыми аномалиями и оба родителя
|
выполнить анализ секвенирования экзома в трио
Интервью с социологом или психологом для изучения восприятия ЭС и влияния результатов, ожиданий в отношении определенных типов результатов, недоступных в настоящее время, эмоциональной ситуации и позиции в отношении продолжения беременности. В 4 различных периода времени: при включении, при время результатов CGA-массива, во время результатов ES и на расстоянии от результатов ES
Для оценки опыта, восприятий, влияния анализов на решение, удовлетворенности и беспокойства по поводу ЭС и его результатов, мнений об определенных типах результатов, недоступных в настоящее время, а также беспокойства и возможного психологического стресса В 4 разных момента времени : при включении, при выдаче результатов CGA-массива, при выдаче результатов ЭС и на расстоянии от выдачи результатов ЭС
|
|
сравнение
плод с не менее чем 2 ультразвуковыми аномалиями с диагнозом ЭС при инвазивном биопсии плода
|
выполнить анализ секвенирования экзома в трио
Интервью с социологом или психологом для изучения восприятия ЭС и влияния результатов, ожиданий в отношении определенных типов результатов, недоступных в настоящее время, эмоциональной ситуации и позиции в отношении продолжения беременности. В 4 различных периода времени: при включении, при время результатов CGA-массива, во время результатов ES и на расстоянии от результатов ES
Для оценки опыта, восприятий, влияния анализов на решение, удовлетворенности и беспокойства по поводу ЭС и его результатов, мнений об определенных типах результатов, недоступных в настоящее время, а также беспокойства и возможного психологического стресса В 4 разных момента времени : при включении, при выдаче результатов CGA-массива, при выдаче результатов ЭС и на расстоянии от выдачи результатов ЭС
провести секвенирование генома циркулирующей свободной эмбриональной ДНК
|
|
профессиональный
акушер, акушерка, генетик, биолог
|
интервью, чтобы понять, как формируется решение
интервью, чтобы уточнить, будут ли варианты неизвестного значения) VUS потенциально возвращены клиницистам или даже пациенту через клинициста.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Время, необходимое для предоставления результатов ЭС пациентам и их семьям в контексте пренатальной диагностики
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
|
количество расхождений между ES и WGS
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Анкета для понимания ожиданий пар и их априорного восприятия ЭС
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
Чтобы определить чувства и лучше узнать, как пары воспринимают ЭС и его последствия и, в частности, риск обнаружения ВУС (варианты неизвестного значения) и ИД (случайные данные).
|
По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
|
Анкета для оценки организации медицинских работников, участвующих в процессе принятия решений
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
По завершении обучения, в среднем 12 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Tran Mau-Them F, Delanne J, Denomme-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet. 2023 Mar 23;14:1099995. doi: 10.3389/fgene.2023.1099995. eCollection 2023.
- Thauvin-Robinet C, Garde A, Delanne J, Racine C, Rousseau T, Simon E, Francois M, Moutton S, Sylvie O, Quelin C, Morel G, Goldenberg A, Guerrot AM, Vera G, Gruchy N, Colson C, Boute O, Abel C, Putoux A, Amiel J, Guichet A, Isidor B, Deiller C, Wells C, Rooryck C, Legendre M, Francannet C, Dard R, Sigaudy S, Bruel AL, Safraou H, Denomme-Pichon AS, Nambot S, Asensio MH, Binquet C, Duffourd Y, Vitobello A, Philippe C, Faivre L, Tran-Mau-Them F, Bourgon N. Prenatal exome sequencing, a powerful tool for improving the description of prenatal features associated with genetic disorders. Prenat Diagn. 2024 Sep;44(10):1179-1197. doi: 10.1002/pd.6623. Epub 2024 Aug 13.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .