ANDDI-PRENATOME - 产前诊断中“快速”泛基因组高通量测序分析的可行性研究 (AnddiPrenatome)
遗传病的产前诊断是一项真正的医学挑战。 产前超声发现异常的情况很常见(占妊娠的 5% 到 10%),当超声发现异常时,会增加潜在发育异常的可能性。 目前,在法国,当超声扫描发现异常时,病因学诊断基于额外的影像学检查(脑 MRI、3D 骨断层扫描、胎儿 CT、胎儿 CT)或诊断测试,如侵入性绒毛膜绒毛取样、羊膜穿刺术或胎儿穿刺术用于感染、代谢、免疫和遗传研究的血液(标准核型、用于快速检测非整倍体的 FISH(荧光原位杂交)、DNA 芯片(ACPA 或 CGH 阵列)上的染色体分析以及目标基因可用时的可能测序)在适合怀孕的时间范围内)。 NIPT(无创产前检测)对母体血液中循环的无细胞胎儿 DNA 的适应症更为有限,允许从怀孕的早期阶段确定胎儿性别和胎儿恒河猴因子并寻找非整倍体。
然而,在怀孕期间建立病因诊断对父母有很多好处:明确病因,获得更准确的预后以确定未来的管理和妊娠结局,并确定复发风险。
在过去十年中,医学遗传学经历了一场真正的技术革命,导致了高通量全基因组、外显子组 (ES) 和基因组 (GS) 测序的发展。 然而,由于时间限制和当临床数据仅限于产前影像数据时难以解释基因组数据,目前很少有国家在产前保健中开展 ES/GS。
2016 年,法国启动了法国医学基因组学 2025 计划 (PFMG2025) 以部署 GS,特别是在罕见病的诊断方面。 因此,定义这种测试的处方方式变得至关重要,特别是在产前诊断期间。 同时,从第一篇出版物开始,基因组分析对循环胎儿 DNA 的应用似乎能够扩展到基因组测序,以研究导致发育疾病的 SNV。
因此,AnDDI-rares 健康网络提出了这个 ANDDI-PRENATOME 试点项目,以研究在 61 名超声异常胎儿的产前诊断中“快速”分析 ES 的可行性,作为考虑未来成本效益 (PRME) 或护理系统性能 (PREPS) 研究与 PFMG2025 结合。
研究概览
地位
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Christel THAUVIN
- 电话号码:+33 03.80.29.53.13
- 邮箱:christel.thauvin@chu-dijon.fr
学习地点
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Dijon、法国、21079
- 招聘中
- CHU Dijon Bourgogne
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接触:
- Christel THAUVIN
- 电话号码:+33 03.80.29.53.13
- 邮箱:christel.thauvin@chu-dijon.fr
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 产前发现至少两种产科超声异常的孕妇(2 种主要畸形,或 1 种主要畸形和 1 种轻微畸形,或 1 种孤立的畸形,很可能是遗传病):接受侵入性产前取样以进行 CGH 阵列诊断;已经进行了侵入性产前取样以诊断 CGH 阵列并且发现胎儿 CGH 阵列正常(应提供足够的胎儿 DNA 或羊水以允许在没有进一步羊水的情况下进行外显子组测序刺)。
- 孕妇和年满 18 岁的父亲
- 孕妇和胎儿父亲提供的书面同意书
- 可能有足够的胎儿标本(羊水或胎儿血液)为试点项目收集额外样本
- 可以对孕妇和胎儿的父亲进行采样(外周血)
- 孕妇和胎儿的父亲能够理解的研究
试点组织研究:
除了主要研究的纳入和排除标准外:
- 口头同意接受采访的孕妇和胎儿的亲生父亲
- 同意接受采访的专业人士(产科医生、助产士、遗传学家、生物学家)
排除标准:
- 被认为极有可能的诊断假设可以通过比 ES 成本更低的可用分子或细胞遗传学测试(例如 22q11 微缺失)或高度怀疑胎儿感染(例如弓形虫血清转化)来证实
- 孕妇或胎儿父亲拒绝参加研究
- 怀孕早于闭经 15 周或晚于闭经 34 周
- 未加入国民健康保险的孕妇和胎儿的父亲
- 受部分司法保护的孕妇和/或胎儿的父亲
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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控制
胎儿和父母双方至少有 2 处超声异常
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在 trio 中执行外显子组测序分析
与社会学家或心理学家面谈,探讨对 ES 的看法和结果的影响、对目前不可用的某些类型结果的期望、情绪状况以及对继续妊娠的立场 在 4 个不同的时间:纳入时、在CGA 阵列结果的时间、ES 结果的时间以及与 ES 结果的距离
评估经验、看法、分析对决策的影响、对 ES 及其结果的满意度和担忧、对当前不可用的某些类型结果的意见,以及焦虑和可能的心理困扰在 4 个不同的时间点: 在包含处,在 CGA 阵列结果的传递处,在 ES 结果的传递处以及与 ES 结果传递的距离处
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比较
胎儿有至少 2 个超声异常,并在侵入性胎儿取样中诊断为 ES
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在 trio 中执行外显子组测序分析
与社会学家或心理学家面谈,探讨对 ES 的看法和结果的影响、对目前不可用的某些类型结果的期望、情绪状况以及对继续妊娠的立场 在 4 个不同的时间:纳入时、在CGA 阵列结果的时间、ES 结果的时间以及与 ES 结果的距离
评估经验、看法、分析对决策的影响、对 ES 及其结果的满意度和担忧、对当前不可用的某些类型结果的意见,以及焦虑和可能的心理困扰在 4 个不同的时间点: 在包含处,在 CGA 阵列结果的传递处,在 ES 结果的传递处以及与 ES 结果传递的距离处
对循环游离胎儿 DNA 的基因组进行测序分析
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专业的
产科医生、助产士、遗传学家、生物学家
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面谈以了解决定是如何形成的
面谈以指定未知意义的变体)VUS 是否有可能返回给临床医生,甚至通过临床医生返回给患者。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
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在产前诊断背景下将 ES 结果返回给患者及其家属所需的时间
大体时间:通过学习完成,平均12个月
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通过学习完成,平均12个月
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ES 和 WGS 之间的差异数量
大体时间:通过学习完成,平均12个月
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通过学习完成,平均12个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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调查问卷以了解夫妻的期望及其对 ES 的先验看法
大体时间:通过学习完成,平均12个月
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定义感受并更好地了解夫妻如何看待 ES 及其影响,特别是发现 VUS(意义不明的变体)和 ID(附带数据)的风险。
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通过学习完成,平均12个月
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评估参与决策过程的卫生专业人员组织的调查问卷
大体时间:通过学习完成,平均12个月
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通过学习完成,平均12个月
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
与本研究相关的术语
其他研究编号
- THAUVIN AnDDI rares 2018
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
研究美国 FDA 监管的设备产品
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