EGFR-mutaatioiden havaitseminen nestepohjaisista sytologisista näytteistä

Aktivoivien epidermaalisen kasvutekijäreseptorin (EGFR) mutaatioiden esiintyminen tunnistaa potilaat, joilla on keuhkojen adenokarsinooma ja joissa EGFR-tyrosiinikinaasin estäjät (TKI) voivat olla mahdollinen ensilinjan hoito. Tällä hetkellä saatavilla olevia TKI-lääkkeitä ovat erlotinibi, gefitinibi ja afatinibi, jotka estävät reseptorityrosiinikinaasin aktiivisuuden ja pysäyttävät siten solujen lisääntymisen ja aiheuttavat solukuoleman. Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että ensilinjan TKI-hoito pidentää etenemisvapaata eloonjäämistä verrattuna tavanomaiseen kemoterapiaan, ja siihen liittyy myös suotuisampi siedettävyys ja vähemmän haittavaikutuksia.

Näytteet EGFR-mutaatioanalyysiä varten kerätään potilailta endobronkiaalisella ultraääniohjatulla transbronkiaalisella neulaaspiraatiolla (EBUS-TBNA) ja keuhkoputkien harjauksilla ja pesuilla. EBUS-TBNA tarjoaa minimaalisesti invasiivisen menetelmän kudosnäytteiden ottamiseen rintakehän radiologisesti epäilyttävistä imusolmukkeista käyttämällä ohutta neulaa. Saadut näytteet kerätään ja lähetetään laboratorioon käsittelyä varten. Tällä hetkellä laboratoriot luottavat EGFR-testaukseen FFPE-näytteiden käyttöön, joten laboratoriossa muodostuu hyytymiä kerätyistä kudosfragmenteista. Hyytynyt näyte on tämän jälkeen kiinnitettävä formaliiniin ennen kuin se käsitellään histologisessa laboratoriossa objektilasien tuottamiseksi konsulttipatologin suorittamaa mikroskooppista tutkimusta varten. Kun adenokarsinooma on diagnosoitu, FFPE-näytteet lähetetään sitten EGFR-mutaatioanalyysiin. Nykyinen laboratorioprosessi kestää noin 5 päivää.

Samoilla näytteenottomenetelmillä saadut nestepohjaiset sytologianäytteet (LBC) valmistetaan myös laboratoriossa ja kiinnitetään metanolipohjaisella liuoksella (PreservCyt). Aikaisempia tutkimuksia on tehty sen selvittämiseksi, voidaanko LBC-näytteitä käyttää FFPE-näytteiden sijasta EGFR-mutaatioiden havaitsemiseen edullisin tuloksin. Esimerkkejä tästä ovat Zhaon et al (2017), Satouchi et al (2017), De Luca et al (2017) ja Malapelle et al (2016) tutkimukset. Siirtyminen LBC-näytteiden käyttöön EGFR-testauksessa poistaisi useita prosessointivaiheita näytereitiltä mutaatiotestaukseen. Immunosytokemiaa tarvitaan useimmissa tapauksissa adenokarsinooman vahvistamiseksi. Tämä nopeampi reitti olisi hyödyllinen tapauksissa, joissa on jo vahvistettu adenokarsinooma toisen linjan EGFR-hoitotestausta varten (T790M) ja tapauksissa, joissa jäännössytologian näytettä, joka normaalisti hylätään, voidaan käyttää testaukseen optimoiden näytteenoton potentiaalia.

Tässä tutkimuksessa tutkitaan, ovatko LBC-näytteet käyttökelpoinen vaihtoehto FFPE-näytteille EGFR-mutaatioiden havaitsemiseksi Biocartis Idylla -alustaa käyttämällä.

Jos nestepohjaiset sytologiset näytteet havaitaan käyttökelpoiseksi vaihtoehdoksi, tämä voi johtaa:

• Nopeampi tulosten läpimenoaika yksiselitteisen adenokarsinooman tapauksissa. Tämä tarjoaisi aikaisemman pääsyn TKI:iin, mikä mahdollistaisi optimaalisen potilaan hallinnan.
• Helpompi näytteen valmistelu laboratoriossa
• Mahdollistaa kaiken näytteenottomenettelyistä hankitun materiaalin tehokkaan käytön. Esimerkiksi FFPE-kudokselle voitaisiin tehdä lisätestejä EGFR-testauksen sijasta, mikä voisi auttaa diagnoosissa. Materiaalin tehokkaan käytön lisääminen voisi myös estää EBUS-toimenpiteen toistumisen potilailla.
• Metanolin on havaittu olevan parempi kiinnitysaine kuin formaliini. Nestepohjaisten sytologisten näytteiden käyttö voi mahdollistaa parempien tulosten molekyylitestauksen.
• Antaisi tukea ajatukselle, että muiden syöpien molekyylitestejä voidaan tehdä nestepohjaisista sytologisista näytteistä, esimerkiksi BRAF-mutaatiotestaus melanooman varalta. Tukee myös muiden nestemäisten näytteiden käyttöä molekyylitestaukseen, kuten verinäytteitä, jotka voitaisiin testata kiertävien kasvainsolujen varalta (vähemmän invasiivinen näytteenotto).