Hotspotit, kotitaloudet ja sairaalat: Tehostettu lääkeresistentti tuberkuloositapaus Namibiassa (H3TB)

Huono tapausten hallinta, farmakokineettinen vaihtelu ja jatkuva leviäminen ovat edistäneet lääkeresistentin tuberkuloosin (DR-TB) epidemiaa, mikä johtaa maailmanlaajuiseen arviolta yli 500 000 uuteen monilääkeresistenttiin (MDR) tuberkuloositapaukseen vuodessa, joista noin 10 % on laajasti lääkeresistentti (XDR). Namibia on korkea tuberkuloositaakka maa, jonka ilmaantuvuusaste oli 446/100 000 vuonna 2016; noin 11 000 uutta tapausta vuodessa. Uusista tapauksista 3,9 prosentilla ja aiemmin hoidetuista tapauksista 8,7 prosentilla on MDR-TB. Koko genomin sekvensointia (WGS) on äskettäin sovellettu Mycobacterium tuberculosis (Mtb) -kantojen täydellisen geneettisen koodin tutkimiseen. WGS:n avulla voidaan päätellä identifioitujen kantojen välisiä suhteita sekä määrittää resistenssin kehittymiseen liittyvät genomivariaatiot.

H3TB-tutkimuksen erityistavoitteet ovat: (i) karakterisoida DR-TB-epidemiaa kliinisen, epidemiologisen, geospatiaalisen, sosiaalisen verkoston ja laboratoriotietojen perusteella, tunnistaa tartuntapisteet kolmella Namibian alueella, (ii) arvioida kohdennettujen tapausten havaitsemiseen tarkoitettujen interventiostrategioiden toteutettavuus DR-TB:n hallinnan parantamiseksi erittäin sairastuneissa populaatioissa ja (iii) leviämismallin kehittäminen tapausten havaitsemiseen liittyvien interventiostrategioiden mahdollisen vaikutuksen tutkimiseksi DR-TB:n ilmaantuvuuden suhteen Namibiassa.

Tammikuussa 2020 aloitettu prospektiivinen seurantatutkimus, joka sisältää kaikki DR-TB-tapaukset Namibiassa ja joka pesii H3TB:n. Tiedonkeruutyökalut ja muut tutkimuksen toteutustyökalut on suunniteltu ja toteutettu. Tutkimusryhmä työskentelee tiiviissä yhteistyössä National Institute of Patologian kanssa, jossa kaikki maan DR-TB-tapaukset rekisteröidään varmistaakseen, että kaikki mahdolliset tapaukset saadaan talteen. Tämä on tärkeää lähetyspisteiden tunnistamiseksi.

HREC- ja MOHSS-hyväksynnän jälkeen henkilöt, joilla on GeneXpert® MTB/RIF-rifampisiiniresistenttejä näytteitä ja positiivinen Mtb-viljelmä kolmelta Namibian alueelta, sisällytetään tartuntapisteiden tunnistustutkimukseen. Alustavat tiedot ovat osoittaneet, että näillä alueilla on DR-TB-klustereita. Kerätään kliinisiä, epidemiologisia, geospatiaalisia, sosiaalisten verkostojen ja laboratoriotietoja (GeneXpert® MTB/RIF, viljely, lääkeherkkyystestit). WGS-kapasiteetti on perustettu UNAM-tutkimuslaboratorioon, jossa WGS suoritetaan H3TB-osallistujien näytteille; tulokset validoidaan tutkimuskeskuksessa Borstelissa Saksassa. Nämä tutkimustulokset yhdessä systemaattisen tarkastelun ja meta-analyysin kanssa antavat tietoa tapausten löytämiseen liittyvien interventioiden suunnittelusta, ja ne arvioidaan sekamenetelmien toteutettavuustutkimuksella, joka tehdään alueilla, joilla on suuri leviäminen (hotspotit, kotitaloudet ja sairaalat). Näistä tutkimuksista ja tuberkuloosiohjelmasta saatujen tietojen perusteella kehitetään mallia, joka sisältää terveystalouskomponentin.

Tutkimus vahvistaa DR-TB-diagnoosia, -seurantaa ja -valvontaa, tiedottaa DR-TB-tapausten etsintäpolitiikasta Namibiassa ja alueellisesti, tiedottaa resurssien allokoinnista tunnistamalla korkeat leviämisalueet ja luo alustavaa dataa laajamittaisen DR-TB-tapauksen havaitsemistoimenpiteen suunnittelua varten.