Hotspoty, gospodarstwa domowe i szpitale: zwiększona liczba przypadków gruźlicy lekoopornej w Namibii (H3TB)

Niewłaściwe zarządzanie przypadkami, zmienność parametrów farmakokinetycznych i ciągła transmisja sprzyjały epidemii gruźlicy lekoopornej (DR-TB), prowadząc do szacowanej na całym świecie liczby >500 000 nowych przypadków gruźlicy wielolekoopornej (MDR) rocznie, z czego około 10% to ekstensywnie lekooporny (XDR). Namibia jest krajem o dużym obciążeniu gruźlicą, ze wskaźnikiem zachorowalności na poziomie 446/100 000 w 2016 r.; około 11 000 nowych przypadków rocznie. 3,9% nowych przypadków i 8,7% wcześniej leczonych przypadków ma MDR-TB. Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) zostało ostatnio zastosowane do zbadania pełnego kodu genetycznego szczepów Mycobacterium tuberculosis (Mtb). WGS można wykorzystać do wnioskowania o powiązaniach między zidentyfikowanymi szczepami, a także do określenia zmian genomowych zaangażowanych w rozwój oporności.

Konkretne cele badania H3TB to: (i) scharakteryzowanie epidemii DR-TB pod względem danych klinicznych, epidemiologicznych, geoprzestrzennych, sieci społecznościowych i laboratoryjnych, aby zidentyfikować ogniska transmisji w trzech regionach Namibii, (ii) ocena wykonalności ukierunkowanych strategii interwencyjnych w celu znalezienia przypadku w celu poprawy kontroli gruźlicy DR w populacjach silnie dotkniętych oraz (iii) opracowania modelu przenoszenia w celu zbadania potencjalnego wpływu strategii interwencyjnych w celu znalezienia przypadku na występowanie gruźlicy DR w Namibii.

Prospektywne badanie obserwacyjne rozpoczęło się w styczniu 2020 r., które obejmuje wszystkie przypadki DR-TB w Namibii i które obejmie H3TB. Zaprojektowano i wdrożono narzędzia do gromadzenia danych i inne narzędzia do realizacji badań. Zespół badawczy ściśle współpracuje z Narodowym Instytutem Patologii, w którym rejestrowane są wszystkie przypadki DR-TB z kraju, aby zapewnić wychwytywanie wszystkich możliwych przypadków. Jest to ważne dla identyfikacji hotspotów transmisji.

Po zatwierdzeniu przez HREC i MOHSS osoby z próbkami GeneXpert® MTB/RIF opornymi na ryfampicynę i dodatnią kulturą Mtb z trzech regionów Namibii zostaną włączone do badania identyfikacji hotspotów transmisji. Wstępne dane wykazały, że w tych regionach istnieją klastry DR-TB. Gromadzone będą dane kliniczne, epidemiologiczne, geoprzestrzenne, sieci społecznościowe i laboratoryjne (GeneXpert® MTB/RIF, kultura, testy lekowrażliwości). Pojemność WGS została ustalona w laboratorium badawczym UNAM, gdzie WGS zostanie przeprowadzony na próbkach uczestników H3TB; wyniki zostaną zweryfikowane w Centrum Badawczym Borstel w Niemczech. Te wyniki badań w połączeniu z systematycznym przeglądem i metaanalizą będą stanowić podstawę do projektowania interwencji w celu znalezienia przypadku, które zostaną ocenione za pomocą studium wykonalności metod mieszanych, przeprowadzonego na obszarach o wysokiej transmisji (hotspoty, gospodarstwa domowe i szpitale). Dane z tych badań i programu gruźlicy zostaną wykorzystane do opracowania modelu, który będzie zawierał komponent ekonomiki zdrowia.

Badanie wzmocni diagnostykę, nadzór i kontrolę DR-TB, poinformuje o polityce wyszukiwania przypadków DR-TB w Namibii i na szczeblu regionalnym, poinformuje o alokacji zasobów poprzez identyfikację obszarów o wysokiej transmisji i stworzy wstępne dane do zaprojektowania interwencji w zakresie wyszukiwania przypadków DR-TB na dużą skalę.