Ruokatorven syöpään liittyvien neoantigeenien laskennallinen ennustaminen ja kokeellinen validointi
tiistai 9. elokuuta 2022 päivittänyt: University Medical Center Ho Chi Minh City (UMC)
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on kehittää laskennallisia putkia ja kokeellisia validointimäärityksiä ruokatorven syöpää sairastavien potilaiden neoantigeenien tunnistamisen parantamiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ei vielä rekrytointia
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Ruokatorven syöpä (EC) on yleinen pahanlaatuinen kasvain, jonka eloonjääminen on huono.
Pitkälle edenneiden EC-vaiheiden potilaiden pitkän aikavälin eloonjäämisaste ei ole parantunut monitieteisillä hoidoilla, mukaan lukien leikkaus, kemoterapia ja säteily.
Viime aikoina immunoterapiamenetelmät, joissa käytetään tarkistuspisteen estäjiä (CPI), syöpärokotteita ja adoptiivista T-soluterapiaa, ovat parantaneet EC-potilaiden eloonjäämistuloksia.
Kliiniset tulokset liittyvät ilmentymistasoihin sekä somamutaatioista johtuvien neoantigeenien immunogeenisyyteen.
Siksi immunogeenisten neoantigeenien tunnistaminen on välttämätöntä tehokkaiden hoitojen saavuttamiseksi.
Tumor Neoantigen Selection Alliancen (TESLA) tuoreet julkaisemat tiedot osoittavat, että suurimmalla osalla (98 %) ennustetuista neoantigeeneistä puuttuu immunogeenisyys ja ne eivät ole tehokkaita aktivoimaan kasvainten vastaisia immuunivasteita.
Tutkimuksessamme pyrimme kehittämään putkilinjan, jossa on sekä laskennallisia ennustetyökaluja että kokeellisia validointimäärityksiä neoantigeenien tunnistamisen tarkkuuden parantamiseksi.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
50
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Long Vo Duy, PhD
- Puhelinnumero: +84.8.39525656
- Sähköposti: long.vd@umc.edu.vn
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Thong Dang Quang
- Sähköposti: thong.dq@umc.edu.vn
Opiskelupaikat
-
-
-
Ho Chi Minh City, Vietnam, 700000
- University Medical Center Ho Chi Minh City
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
15 vuotta - 90 vuotta (Lapsi, Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Kaikki potilaat, joilla diagnosoitiin edennyt ruokatorven syöpä ja joille tehtiin leikkaus
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 18-vuotiaat ja sitä vanhemmat mies- tai naispotilaat
- Diagnoosi edennyt ruokatorven syöpä
- Hoito-naiivi
- Ei tunneta muiden samanaikaisten syöpien osalta
- Anna kirjallinen tietoinen suostumus
Poissulkemiskriteerit:
- Riittämättömät kasvainkudokset (alle 1 cm3)
- Tietoon perustuvaa suostumusta ei voi allekirjoittaa
- Kävi hoitoon
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Ruokatorven syöpää sairastavien potilaiden neoantigeenimaisema
Aikaikkuna: 3 kuukautta opintojen alkamisesta
|
Kasvain-DNA- ja RNA-sekvensointitietojen analyysi antaa selville ruokatorven syöpää sairastavien potilaiden mutaatiojakauman, joka voi aiheuttaa neoantigeenejä.
Niistä tunnistetaan neoantigeenit, jotka ovat peräisin vietnamilaisten ruokatorven syöpäpotilaiden hotspot-mutaatioista.
|
3 kuukautta opintojen alkamisesta
|
|
HLA-I:n esittämien ennustettujen neoantigeenien suhde
Aikaikkuna: 6 kuukautta opintojen alkamisesta
|
Laskennallisia putkia käytetään ennustamaan neoantigeenien ja HLA-molekyylien pariutumista.
Myöhemmin näiden ennustettujen neoantigeenien suhde validoidaan yhteisimmunosaostuksella anti-HLA-vasta-aineiden kanssa ja massaspektrometrialla niiden sitoutumisen vastaaviin HLA-molekyyleihin.
|
6 kuukautta opintojen alkamisesta
|
|
Niiden ennustettujen neoantigeenien suhde, jotka ovat immunogeenisiä
Aikaikkuna: 12 kuukautta opintojen alkamisesta
|
Immunomäärityksiä käytetään sellaisten neoantigeenien tunnistamiseen, jotka voivat aktivoida CD4- ja CD8-T-soluja tappamaan kasvainsoluja ja toimia oletettuina immunoterapian ehdokkaina.
|
12 kuukautta opintojen alkamisesta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Odotettu)
Torstai 1. syyskuuta 2022
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Sunnuntai 31. joulukuuta 2023
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Sunnuntai 31. joulukuuta 2023
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 9. elokuuta 2022
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 9. elokuuta 2022
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Torstai 11. elokuuta 2022
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Torstai 11. elokuuta 2022
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 9. elokuuta 2022
Viimeksi vahvistettu
Maanantai 1. elokuuta 2022
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 61/GCN-HDDD
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .