Virtsan analysointi BCG:n tiputuksen aikana virtsarakon syöpäpotilaille taudin seurantaa varten

NMIBC:n keskitason ja suuren riskin kohdalla uusiutumisaste on 40,5 % TURBT:n jälkeen, mikä edellyttää säännöllistä seurantaa ja virtsarakon instillaatiota. Potilailla, joilla on keskisuuren tai korkean riskin NMIBC, suositeltava hoito on BCG. Tämän sairauden korkea uusiutumisaste liittyy BCG:n tehokkuuteen ja jäännössyöpään, mutta BCG-asennuksen mekanismin täydellinen ymmärtäminen vaikeuttaa sen tehokkuuden ennustamista potilailla, joilla on virtsarakon syöpä.

Aikaisemmin uskottiin, että virtsatiejärjestelmä oli steriili; kuitenkin viimeaikainen korkean suorituskyvyn sekvensointi ja tehostettu kvantitatiivinen virtsan viljely ovat vahvistaneet pysyvän bakteerin esiintymisen terveiden yksilöiden virtsassa. Virtsarakossa olevat mikro-organismit voivat muuttaa immuunijärjestelmää, mikä vaikuttaa BCG:n tiputuksen tehokkuuteen.

CIN tarkoittaa jatkuvia virheitä kromosomien erottamisessa solun jakautumisen aikana, mukaan lukien numeerinen ja rakenteellinen epävakaus. Y-kromosomin menetys (LOY) edustaa tiettyä CIN-tyyppiä, joka liittyy syövän ennusteeseen. CIN toimii pahanlaatuisten kasvainten tunnusmerkkinä, ja sitä voidaan käyttää osoittamaan TURBT:n jälkeisen minimaalisen jäännössairauden (MRD) esiintymistä. LOY:n analysointi voi paremmin selvittää taudin etenemistä, ja lisää tutkimusta tarvitaan, jotta ymmärrettäisiin CIN:n havaitsemisen merkitys kasvaimen uusiutumisen ennustamisessa.

LC-WGS on kustannustehokas, tehokas ja vankka tekniikka, jota voidaan käyttää sekä mikro-organismien että ihmisen genomien analysointiin virtsanäytteistä. Mikrobiomi havaitaan yleisesti käyttämällä 16S ribosomaalista sekvensointia. Verrattuna 16S-sekvensointiin LC-WGS tarjoaa etuja, kuten tehostetun bakteerilajien havaitsemisen, monimuotoisuuden ja paremman geenien ennustamisen. CIN- ja LOY-tunnistuksen yhteydessä LC-WGS-tekniikka tarjoaa korkeamman herkkyyden, alhaiset kustannukset ja korkean suorituskyvyn verrattuna perinteisiin menetelmiin, kuten vertailevaan genomiseen hybridisaatioon tai fluoresenssiin situ -hybridisaatioon.

Tässä tulevassa yksihaaraisessa kliinisessä havainnointitutkimuksessa tutkijat pyrkivät arvioimaan LOY:tä, CIN:ää ja LC-WGS:n havaitsemaa virtsan mikrobiomia BCG:n tiputuksen tehokkuuden ja NMIBC-seurannan arvioimiseksi.