Analysere urinen under BCG-instillasjon hos pasienter med blærekreft for sykdomsoppfølging

NMIBC ved middels til høy risiko viser en gjentakelsesrate på 40,5 % post-TURBT, noe som krever hyppig overvåking og blæreinstillasjon. Blant pasienter med middels til høy risiko NMIBC er den foretrukne behandlingen BCG. Den høye tilbakefallsfrekvensen av denne sykdommen er assosiert med BCGs effektivitet og gjenværende kreft, men den fulle forståelsen av BCG-installasjonens mekanisme kompliserer forutsigelsen av dens effektivitet blant personer med blærekreft.

Tidligere trodde man at urinsystemet var sterilt; Nylig sekvensering med høy gjennomstrømning og forbedret kvantitativ urinkultur har imidlertid bekreftet tilstedeværelsen av fastboende bakterier i urinen til friske individer. Mikroorganismer i blæren har potensial til å endre immunmikromiljøet, og dermed påvirke effekten av BCG-instillasjon.

CIN betegner kontinuerlige feil i kromosomseparasjon under celledeling, som omfatter numerisk og strukturell ustabilitet. Tap av Y-kromosomet (LOY) representerer en spesifikk type CIN assosiert med kreftprognose. CIN fungerer som et kjennetegn på maligniteter og kan brukes til å indikere tilstedeværelsen av minimal restsykdom (MRD) etter TURBT. Å analysere LOY kan bedre belyse sykdommens progresjon, og mer utforskning er nødvendig for å forstå betydningen av å oppdage CIN for å forutsi tumorresidiv.

LC-WGS er en kostnadseffektiv, effektiv og robust teknikk som kan brukes til å analysere både mikroorganismer og menneskelige genomer i urinprøver. Mikrobiomet blir ofte oppdaget ved hjelp av 16S ribosomal sekvensering. Sammenlignet med 16S-sekvensering gir LC-WGS fordeler som forbedret deteksjon av bakteriearter, mangfold og forbedret genprediksjon. I sammenheng med CIN- og LOY-deteksjon tilbyr LC-WGS-teknologi økt følsomhet, lav pris og høy gjennomstrømning sammenlignet med tradisjonelle metoder som komparativ genomisk hybridisering eller fluorescens in situ hybridisering.

I denne prospektive, enarmede observasjonskliniske studien tar etterforskerne sikte på å evaluere LOY, CIN og urinmikrobiomet oppdaget av LC-WGS for vurdering av BCG-instillasjonseffektivitet og NMIBC-oppfølging.