Analyse de l'urine pendant l'instillation du BCG chez les patients atteints d'un cancer de la vessie pour le suivi de la maladie

Le NMIBC à risque moyen à élevé présente un taux de récidive de 40,5 % après la TURBT, nécessitant ainsi une surveillance fréquente et une instillation vésicale. Parmi les patients présentant un NMIBC à risque moyen à élevé, le traitement préféré est le BCG. Le taux élevé de récidive de cette maladie est associé à l'efficacité du BCG et au cancer résiduel, mais la pleine compréhension du mécanisme d'installation du BCG complique la prédiction de son efficacité chez les individus atteints d'un cancer de la vessie.

Auparavant, on croyait que le système urinaire était stérile ; cependant, un récent séquençage à haut débit et une culture quantitative améliorée de l'urine ont confirmé la présence de bactéries résidentes dans l'urine d'individus en bonne santé. Les micro-organismes présents dans la vessie ont le potentiel de modifier le microenvironnement immunitaire, ce qui a un impact sur l'efficacité de l'instillation du BCG.

CIN désigne des erreurs continues dans la séparation des chromosomes au cours de la division cellulaire, englobant une instabilité numérique et structurelle. La perte du chromosome Y (LOY) représente un type spécifique de CIN associé au pronostic du cancer. La CIN sert de signe distinctif des tumeurs malignes et peut être utilisée pour indiquer la présence d'une maladie résiduelle minimale (MRD) consécutive à la TURBT. L'analyse de LOY peut mieux élucider la progression de la maladie, et des explorations plus approfondies sont nécessaires pour comprendre l'importance de la détection des CIN pour prédire la récidive tumorale.

LC-WGS est une technique rentable, efficace et robuste qui peut être utilisée pour analyser à la fois le génome des micro-organismes et le génome humain dans des échantillons d'urine. Le microbiome est généralement détecté par séquençage ribosomique 16S. Par rapport au séquençage 16S, LC-WGS offre des avantages tels qu’une détection améliorée des espèces bactériennes, de la diversité et une prédiction génétique améliorée. Dans le contexte de la détection CIN et LOY, la technologie LC-WGS offre une sensibilité accrue, un faible coût et un débit élevé par rapport aux méthodes traditionnelles telles que l'hybridation génomique comparative ou l'hybridation in situ par fluorescence.

Dans cet essai clinique observationnel prospectif à un seul bras, les enquêteurs visent à évaluer LOY, CIN et le microbiome urinaire détecté par LC-WGS pour l'évaluation de l'efficacité de l'instillation du BCG et du suivi du NMIBC.