AMR:n leviämisen, pysyvyyden ja evoluution dynamiikka ihmisten, eläinten ja niiden ympäristön välillä (Dyaspeo)

Mikrobilääkeresistenssi (AMR) on maailmanlaajuinen ja monitahoinen kansanterveysongelma. Pitkälle kehitetty AMR-tieto on osoittanut, että se ei vaikuta vain ihmisiin, vaan on myös laajalti levinnyt eläimiin ja ympäristöön. Suurin syy AMR-taakan aiheuttamiseen viittaa AMR:n kykyyn levitä yksilöiden sisällä ja välillä, myös ihmisten ja eläinten välillä. Johtavia esimerkkejä kansainvälisesti levinneistä AMR-bakteereista ovat enterobakteereja levittävät resistenssit laajakirjoisille kefalosporiineille (ESC-E) ja karbapeneemeille (CP-E). Silti niiden sektorien välisten siirtojen suuruus ja polut ovat huonosti ymmärrettyjä.

On suuri huolenaihe, että ihmiset, jotka ovat kosketuksissa eläinten kanssa, ovat vaarassa saada ESC-E/CP-E. Samalla kun ESC-E-kuljetuksia on raportoitu lisääntyneen viljelijöillä, jotka ovat kosketuksissa elintarviketuotantoon käytettävien eläintensä kanssa, AMR:n tarttumista ihmisiin suoran kontaktin kautta seuraeläinten kanssa on tutkittu paljon vähemmän. Lemmikkieläinten ja omistajien välisten läheisten suhteiden ja sen tosiasian, että 50 prosentissa kotitalouksista Ranskassa on koira tai kissa, hypoteesi, jonka mukaan lemmikkieläinten omistaminen on riski ihmisille hankkia ESC-E/CP-E, vaikuttaa erittäin tärkeältä. DYASPEO-projektissa tutkitaan tätä kysymystä yhdistämällä useita lähestymistapoja kenttätutkimuksista laboratoriotutkimuksiin, mukaan lukien epidemiologia, ekologia, molekyyli- ja populaatiogenomiikka, suoliston mikrobiotan tutkimukset, mallinnus ja yhteiskuntatieteet.

Oletamme, että ihmisten ja seuraeläinten välisellä rajapinnalla on merkittävä rooli ESC-E/CP-E:n siirrossa. Tätä hypoteesia tukevat (i) viimeaikaiset Ranskasta saadut tiedot, jotka osoittavat, että seuraeläinten antibioottialtistus lisääntyy edelleen toisin kuin kaikki muut isännät (esim. elintarviketuotantoeläimet) ja (ii) konsortion tuoreessa tutkimuksessa, joka osoittaa korkean AMR-prevalenssin koirilla, jotka palaavat kotiin sairaalahoidon jälkeen.