Seuraavan sukupolven endometrioosin diagnostiikka kattavan moniulotteisen analyysin avulla (AdEnd)

Viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että epigeneettinen verianalyysi voi mullistaa endometrioosin diagnoosin, ja lisäksi on raportoitu vahvoja korrelaatioita kohdun limakalvon ja veren metylaation välillä (Giacomini et al., 2021), mikä viittaa merkittävään diagnostiseen potentiaaliin. Alustavat tiedot polygeenisistä riskipisteistä (PRS) osoittavat lupaavuuden myös taudin vakavuuteen liittyvien geneettisten profiilien tunnistamisessa (Katz et al., 2003).

Tekoälyn (AI) edistysaskeleet tarjoavat tarkkoja kuvapohjaisia ​​diagnostisia ennusteita, jotka korostavat tekoälyn ja geneettisten analyysien yhdistämisen transformatiivisia mahdollisuuksia. Lisäksi alustavat tutkimuksemme ovat osoittaneet, että kohdun nesteen ekstrasellulaarisista rakkuloista (UF-EV) saatuja geeniekspressiotietoja on mahdollista käyttää kohdun limakalvon vastaanottavuuden ymmärtämiseen, mikä vaikuttaa sekä endometrioosin että adenomyoosin havaitsemiseen (Vercellini et al., 2023).

Tämän tutkimuksen avulla oletamme, että erilaiset metylaatioprofiilit, jotka on integroitu geneettisiin, epigeneettisiin ja kliinisiin tietoihin, voivat luokitella tarkasti endometrioosi- ja adenomyoositapaukset. Lisäksi oletamme, että UF-EV-geenin ilmentymisprofiilit eroavat merkittävästi endometrioosin, adenomyoosin ja hedelmällisyyden kontrollien välillä, mikä tarjoaa kriittisiä näkemyksiä kohdun limakalvon vastaanottavuudesta ja mahdollisista diagnostisista markkereista näille sairauksille.

Ensisijainen tavoite:

Tunnistaa tietyt CpG-kohdat, joilla on erilaiset metylaatiotasot endometrioositapausten ja kontrollien välillä. Näitä metylaatioprofiileja yhdistettynä polygeenisten riskipisteiden (PRS) ja kliinisen kyselylomakkeen tietojen kanssa käytetään tapausten ja kontrollien luokitteluun koneoppimisanalyysin avulla. (Tavoite 1) Differentiaalisen metylaatioanalyysin lisäksi käytetään "korkean resoluution SNP-genotyypitystä". Tämä genotyypitys säätää metylaatioanalyysiä ja auttaa johtamaan polygeenisiä riskipisteitä.

Toissijaiset tavoitteet:

Kehittää ja validoida diagnostinen malli, joka integroi ultraäänikuvauksen geneettisiin, epigeneettisiin ja kliinisiin tietoihin adenomyoosin tarkasti tunnistamiseksi ja erottamiseksi endometrioosin jatkeena ja raskauden tulosten ennustamiseksi IVF-hoitoa saavilla naisilla. (Tavoite 2)

Kolmannen asteen tavoitteet:

Endometrioosille ja adenomyoosille spesifisten kohdun nesteen ekstrasellulaaristen rakkuloiden (UF-EV) geeniekspressioprofiilien karakterisoimiseksi analysoimme näytteitä kahdessa kriittisessä ajankohdassa: LH+2 (ei-reseptiivinen) ja LH+7 (reseptiivinen). Vertailemme saatuja geenien ilmentymistietoja aiemmin kerättyihin hedelmöityneiltä ja hedelmättömiltä potilailta saatuihin tietoihin. Vertailemalla näitä profiileja pyrimme tunnistamaan jokaiseen sairauteen liittyvät erilliset molekyyliset allekirjoitukset, mikä parantaa ymmärrystämme niiden vaikutuksesta hedelmällisyyteen ja kohdun limakalvon vastaanottavuuteen. Tämän vertailun avulla voimme myös tarkentaa diagnostisia markkereita ja mahdollisesti kehittää kohdennettuja interventioita sairastuneille naisille. (Tavoite 3)

Tämä tutkimus tehdään monikeskusprojektina, johon osallistuu kaksi avustettua lisääntymiskeskusta, ja siihen osallistuu 800 naisen monipuolinen kohortti. Tutkimukseen osallistuu 530 osallistujaa ja kolme erillistä ryhmää: naiset, joilla on diagnosoitu endometrioosi, naiset, joilla on diagnosoitu sekä endometrioosi että adenomyoosi, sekä kontrolliryhmä hedelmättömiä naisia, joilla ei ole näitä sairauksia. Jokainen ryhmä osallistuu tutkimukseen, sen on suunniteltu kestävän 24 kuukautta rekrytoinnin alkamisesta kerätyn tiedon lopulliseen analyysiin. Toinen ryhmä koostuu 300 DNA-biopankkinäytteestä naisilta, joilla on diagnosoitu endometrioosi.