Diagnostic de l'endométriose de nouvelle génération grâce à une analyse multidimensionnelle complète (AdEnd)

Des recherches récentes indiquent que l'analyse épigénétique du sang pourrait révolutionner le diagnostic de l'endométriose. De plus, de fortes corrélations entre l'endomètre et la méthylation du sang ont été rapportées (Giacomini et al., 2021), suggérant un potentiel diagnostique important. Les données préliminaires sur les scores de risque polygénique (PRS) sont également prometteuses pour l'identification des profils génétiques associés à la gravité de la maladie (Katz et al., 2003).

Les progrès de l’intelligence artificielle (IA) offrent des prédictions diagnostiques précises basées sur des images, soulignant le potentiel transformateur de l’intégration de l’IA aux analyses génétiques. De plus, nos études préliminaires ont démontré le potentiel de l'utilisation des données d'expression génique des vésicules extracellulaires du liquide utérin (UF-EV) pour comprendre la réceptivité de l'endomètre, avec des implications pour la détection de l'endométriose et de l'adénomyose (Vercellini et al., 2023).

Grâce à cette étude, nous émettons l'hypothèse que les profils différentiels de méthylation, intégrés aux données génétiques, épigénétiques et cliniques, peuvent classer avec précision les cas d'endométriose et d'adénomyose. De plus, nous émettons l'hypothèse que les profils d'expression génique des UF-EV diffèrent considérablement entre l'endométriose, l'adénomyose et les contrôles fertiles, fournissant ainsi des informations essentielles sur la réceptivité de l'endomètre et les marqueurs diagnostiques potentiels de ces conditions.

Objectif principal :

Identifier les sites CpG spécifiques qui présentent des niveaux de méthylation différentiels entre les cas d'endométriose et les témoins. Ces profils de méthylation, combinés aux scores de risque polygéniques (PRS) et aux données du questionnaire clinique, seront utilisés pour classer les cas et les contrôles grâce à l'analyse de l'apprentissage automatique. (Objectif 1) En plus de l'analyse différentielle de méthylation, un « génotypage SNP à haute résolution » sera utilisé. Ce génotypage ajustera l'analyse de méthylation et aidera à dériver des scores de risque polygénique.

Objectifs secondaires :

Développer et valider un modèle de diagnostic intégrant l'imagerie échographique avec des données génétiques, épigénétiques et cliniques pour identifier et différencier avec précision l'adénomyose en tant qu'extension de l'endométriose et prédire l'issue de la grossesse chez les femmes subissant une FIV. (Objectif 2)

Objectifs tertiaires :

Pour caractériser les profils d'expression génique des vésicules extracellulaires du liquide utérin (UF-EV) spécifiques à l'endométriose et à l'adénomyose, nous analyserons des échantillons à deux moments critiques : LH+2 (non réceptive) et LH+7 (réceptive). Nous comparerons les données d'expression génique obtenues avec les données précédemment collectées auprès de patients fertiles et infertiles. En comparant ces profils, nous visons à identifier des signatures moléculaires distinctes associées à chaque affection, améliorant ainsi notre compréhension de leur impact sur la fertilité et la réceptivité de l'endomètre. De plus, cette comparaison nous permettra d'affiner les marqueurs diagnostiques et potentiellement de développer des interventions ciblées pour les femmes affectées. (Objectif 3)

Cette étude est menée comme un projet multicentrique, impliquant deux centres de procréation assistée, elle comprendra une cohorte diversifiée de 800 femmes. L'étude implique 530 participantes et trois groupes distincts : des femmes diagnostiquées avec de l'endométriose, des femmes diagnostiquées avec de l'endométriose et de l'adénomyose et un groupe témoin de femmes stériles sans ces conditions. Chaque groupe participera à l'étude, elle est prévue pour durer 24 mois depuis le début du recrutement jusqu'à l'analyse finale des données collectées. Un groupe supplémentaire sera composé de 300 échantillons d'ADN biobanqués provenant de femmes diagnostiquées avec l'endométriose.