Diagnostika endometriózy nové generace prostřednictvím komplexní multidimenzionální analýzy (AdEnd)

Nedávný výzkum naznačuje, že epigenetická analýza krve by mohla způsobit revoluci v diagnostice endometriózy, navíc byly hlášeny silné korelace mezi metylací endometria a krve (Giacomini et al., 2021), což naznačuje významný diagnostický potenciál. Předběžné údaje o skóre polygenního rizika (PRS) také ukazují slibné při identifikaci genetických profilů spojených se závažností onemocnění (Katz et al., 2003).

Pokroky v oblasti umělé inteligence (AI) nabízejí přesné diagnostické předpovědi založené na obrázcích a zdůrazňují transformační potenciál integrace umělé inteligence s genetickými analýzami. Naše předběžné studie navíc prokázaly potenciál použití dat genové exprese z extracelulárních váčků děložní tekutiny (UF-EV) k pochopení receptivity endometria, s důsledky pro detekci endometriózy i adenomyózy (Vercellini et al., 2023).

Prostřednictvím této studie předpokládáme, že diferenciální metylační profily, integrované s genetickými, epigenetickými a klinickými daty, mohou přesně klasifikovat případy endometriózy a adenomyózy. Kromě toho předpokládáme, že profily genové exprese UF-EV se významně liší mezi endometriózou, adenomyózou a fertilními kontrolami, což poskytuje kritický pohled na vnímavost endometria a potenciální diagnostické markery pro tyto stavy.

Primární cíl:

Identifikovat specifická místa CpG, která vykazují rozdílné úrovně methylace mezi případy endometriózy a kontrolami. Tyto metylační profily v kombinaci se skóre polygenního rizika (PRS) a údaji z klinických dotazníků budou použity ke klasifikaci případů a kontrol pomocí analýzy strojového učení. (Cíl 1) Kromě diferenciální methylační analýzy bude využito „genotypování SNP s vysokým rozlišením“. Toto genotypování upraví methylační analýzu a pomůže při odvozování skóre polygenního rizika.

Sekundární cíle:

Vyvinout a ověřit diagnostický model integrující ultrazvukové zobrazování s genetickými, epigenetickými a klinickými daty pro přesnou identifikaci a odlišení adenomyózy jako rozšíření endometriózy a pro predikci výsledků těhotenství u žen podstupujících IVF. (cíl 2)

Terciární cíle:

Abychom charakterizovali profily genové exprese extracelulárních váčků děložní tekutiny (UF-EVs) specifických pro endometriózu a adenomyózu, budeme analyzovat vzorky ve dvou kritických časových bodech: LH+2 (nereceptivní) a LH+7 (receptivní). Získaná data genové exprese porovnáme s dříve shromážděnými daty od fertilních a neplodných pacientek. Porovnáním těchto profilů se snažíme identifikovat odlišné molekulární signatury spojené s každým stavem, což zlepšuje naše chápání jejich vlivu na plodnost a vnímavost endometria. Toto srovnání nám také umožní upřesnit diagnostické markery a potenciálně vyvinout cílené intervence pro postižené ženy. (cíl 3)

Tato studie je vedena jako multicentrický projekt zahrnující dvě centra asistované reprodukce, bude zahrnovat různorodou kohortu 800 žen. Studie zahrnuje 530 účastníků a tři odlišné skupiny: ženy s diagnostikovanou endometriózou, ženy s diagnostikovanou endometriózou i adenomyózou a kontrolní skupinu neplodných žen bez těchto onemocnění. Studie se zúčastní každá skupina, plánovaná doba trvání je 24 měsíců od zahájení náboru až po konečnou analýzu shromážděných dat. Další skupinu bude tvořit 300 vzorků DNA uložených v biobankách od žen s diagnózou endometriózy.