Diagnostica dell'endometriosi di prossima generazione attraverso un'analisi multidimensionale completa (AdEnd)

Ricerche recenti indicano che l’analisi epigenetica del sangue potrebbe rivoluzionare la diagnosi di endometriosi, inoltre sono state riportate forti correlazioni tra endometrio e metilazione del sangue (Giacomini et al.,2021), suggerendo un potenziale diagnostico significativo. Anche i dati preliminari sui punteggi di rischio poligenico (PRS) si dimostrano promettenti nell'identificazione dei profili genetici associati alla gravità della malattia (Katz et al., 2003).

I progressi nell’intelligenza artificiale (AI) offrono previsioni diagnostiche precise basate su immagini, evidenziando il potenziale di trasformazione dell’integrazione dell’IA con le analisi genetiche. Inoltre, i nostri studi preliminari hanno dimostrato il potenziale dell'utilizzo dei dati di espressione genica provenienti dalle vescicole extracellulari del fluido uterino (UF-EV) per comprendere la ricettività endometriale, con implicazioni per il rilevamento sia dell'endometriosi che dell'adenomiosi (Vercellini et al., 2023).

Attraverso questo studio, ipotizziamo che i profili di metilazione differenziale, integrati con dati genetici, epigenetici e clinici, possano classificare accuratamente i casi di endometriosi e adenomiosi. Inoltre, ipotizziamo che i profili di espressione genica degli UF-EV differiscano significativamente tra endometriosi, adenomiosi e controlli fertili, fornendo informazioni critiche sulla ricettività endometriale e potenziali marcatori diagnostici per queste condizioni.

Obiettivo primario:

Identificare siti CpG specifici che presentano livelli di metilazione differenziali tra casi di endometriosi e controlli. Questi profili di metilazione, combinati con i punteggi di rischio poligenico (PRS) e i dati dei questionari clinici, verranno utilizzati per classificare casi e controlli attraverso l’analisi dell’apprendimento automatico. (Obiettivo 1) Oltre all'analisi differenziale della metilazione, verrà utilizzata la "genotipizzazione SNP ad alta risoluzione". Questa genotipizzazione regolerà l'analisi della metilazione e aiuterà a ricavare punteggi di rischio poligenico.

Obiettivi secondari:

Sviluppare e convalidare un modello diagnostico che integri l'imaging ecografico con dati genetici, epigenetici e clinici per identificare e differenziare accuratamente l'adenomiosi come estensione dell'endometriosi e per prevedere gli esiti della gravidanza nelle donne sottoposte a fecondazione in vitro. (Obiettivo 2)

Obiettivi terziari:

Per caratterizzare i profili di espressione genica delle vescicole extracellulari del fluido uterino (UF-EV) specifiche dell'endometriosi e dell'adenomiosi, analizzeremo i campioni in due punti temporali critici: LH+2 (non ricettivo) e LH+7 (recettivo). Confronteremo i dati di espressione genica ottenuti con i dati precedentemente raccolti da pazienti fertili e infertili. Confrontando questi profili, miriamo a identificare firme molecolari distinte associate a ciascuna condizione, migliorando la nostra comprensione del loro impatto sulla fertilità e sulla ricettività endometriale. Inoltre, questo confronto ci consentirà di affinare i marcatori diagnostici e potenzialmente di sviluppare interventi mirati per le donne colpite. (Obiettivo 3)

Questo studio è condotto come un progetto multicentrico, che coinvolge due centri di riproduzione assistita e includerà un gruppo diversificato di 800 donne. Lo studio coinvolge 530 partecipanti e tre gruppi distinti: donne con diagnosi di endometriosi, donne con diagnosi sia di endometriosi che di adenomiosi e un gruppo di controllo di donne infertili senza queste condizioni. Ogni gruppo parteciperà allo studio, la cui durata è prevista per 24 mesi dall'inizio del reclutamento all'analisi finale dei dati raccolti. Un ulteriore gruppo sarà composto da 300 campioni di DNA raccolti in biobanche di donne con diagnosi di endometriosi.