Äidinmaidon miRNA:iden vaikutus vauvan suolen mikrobiotaan (MiMilk)

Ensimmäiset 1000 elämänpäivää ovat kriittinen ajanjakso, joka vaikuttaa merkittävästi yksilön terveyden ohjelmointiin. On yhä ilmeisempää, että terveen suoliston mikrobiston (GM) muodostamisella on tärkeä rooli sekä lyhyen että pitkän aikavälin terveysongelmien ehkäisyssä.

Lapsen suoliston mikrobiotan muodostumiseen vaikuttavista tekijöistä äidinmaidolla (BM) on keskeinen rooli. Toisin kuin korvike, rintamaito sisältää miRNA:ita, jotka ovat mahdollisia välittäjiä isännän ja mikrobiston välisissä vuorovaikutuksissa. Siten oletamme, että rintamaidosta peräisin olevat miRNA:t voivat olla läsnä vauvan luminaalisessa sisällössä ja olla vuorovaikutuksessa heidän mikrobiotansa kanssa, mikä siten moduloi sitä.

Päätavoite: Tutki rintamaidon vaikutusta ulosteen miRNA:iden koostumukseen imeväisillä.

Ensisijainen arviointikriteeri: miRNA:iden profiilit ja määrät eri ajankohtina (D10, D30, D60, M6 ja M12) yksinomaan rintaruokittujen imeväisten ulosteessa verrattuna maidolla ruokittujen lasten ulosteessa.

Toissijaiset tavoitteet:

Tutki rintamaidosta peräisin olevien miRNA:iden vaikutusta vauvan ulosteen mikrobiotan koostumukseen ottaen huomioon ympäristöön vaikuttavat tekijät, mukaan lukien äidin mikrobiston koostumus.

Tutki rintamaidon mikrobiotan vaikutusta maidon miRNA-profiileihin.

Tutki rintamaidon mikrobiotan vaikutusta imeväisten suoliston mikrobiotaan. Tutki rintamaidon miRNA:iden, vauvan suoliston mikrobiotan ja imeväisten suoliston tulehduksen välisiä yhteyksiä.

Toissijaiset arviointikriteerit:

Korrelaatiot rintamaidon miRNA-profiilien välillä D1-D60 ja rintaruokittujen imeväisten suolistomikrobiston välillä D1-M12.

Rintamaidon mikrobiotan ja rintamaidon miRNA-profiilien väliset korrelaatiot D1:stä D60:een.

Korrelaatiot rintamaidon mikrobiotan välillä D1-D60 ja vauvan ulosteen mikrobiot välillä D1-M12.

Suorat korrelaatiot (1) äidinmaidon miRNA:iden ja ulosteen kalprotektiinin mittauksen välillä pikkulapsilla D1-D60 ja (2) vauvan suoliston mikrobiotan ja ulosteen kalprotektiinin välillä pikkulapsilla D1-D60.

Tutkimuskysymykseen vastaamiseksi aiomme ottaa mukaan 200 äiti-vauva-dyadia. Tavoitteenamme on saada 30 dyadia yksinomaisella imetyksellä vähintään kahden kuukauden ajan ja 30 dyadia, joissa vauva ei ole saanut rintamaitoa. Jokainen dyadi osallistuu tutkimukseen 12 kuukauden ajan ja rekrytointivaihe kestää 18 kuukautta.

Vauvan syntyessä otamme ulostenäytteet sekä äidiltä että vauvalta sekä rintamaitonäytteen äidiltä.

10, 30 ja 60 päivän kuluttua vauvan syntymästä pyydämme äidiltä sekä rintamaitonäytteen että lapselta ulostenäytteen.

6 ja 12 kuukauden iässä lapselta otetaan vain ulostenäyte. Jokaisen käynnin aikana kliinisen tutkimuksen koordinaattori ottaa yhteyttä äideihin kerätäkseen tietoa heidän terveydestä ja ruokavaliosta sekä vauvan terveydestä ja ruokavaliosta.

MiRNA:iden analyysi rintamaidossa ja ulostenäytteissä: miRNA:t uutetaan pikkulasten ulostenäytteistä ja rintamaidosta seuraavan sukupolven Illumina-sekvensointia (NGS) käyttäen. Kymmenen yleisintä miRNA:ta validoidaan sitten qPCR:llä. Yleiset miRNA-profiilit analysoidaan käyttämällä pääkoordinaattianalyysiä (PCoA).

Suoliston ja rintamaidon mikrobiotan analyysi: Uloste- ja rintamaitonäytteitä käytetään 16S-rRNA-geenin sekvensointiin mikrobikoostumuksen analysoimiseksi. Mikrobiootan profiileja tutkitaan myös pääkoordinaattianalyysillä (PCoA).