Fibroblastien ja veren transkriptinen analyysi potilailla, joilla on harvinaisia sairauksia (ARNseqFibroSan)
Veren ja fibroblastien transkriptillinen analyysi (RNASEQ) diagnoosin luomiseksi potilailla, joilla on harvinaisia sairauksia
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on vastata avainkysymykseen harvinaisten geneettisten sairauksien alalla määrittämällä haitallisten varianttien esiintyvyys RNA -tasolla diagnosoimattomilla potilailla, joilla on kehitysvammaisuus ja/tai vastasyntyneen hypotonia. Tämä tutkimus lopettaa diagnostisen epämääräisyyden useilla potilailla.
Lopuksi tämän tutkimuksen tulokset mahdollistavat RNASEQ: n kahta kudostyyppiä vertailua tämän analyysimenetelmän toteuttamisen helpottamiseksi diagnostisessa ympäristössä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Perusteet:
Suurin osa potilaista, joilla on kehitysvammainen tai vastasyntyneen hypotonia, on diagnosoimattomana laajasta geenitestauksesta huolimatta. Itse asiassa vakioanalyysit, joiden tavoitteena on havaita poikkeavuudet potilaan DNA: ssa, mahdollistavat diagnoosin vain kolmannessa tapauksissa. Hypoteesimme on, että tietty määrä näistä väärin diagnosoiduista potilaista on poikkeavuuksia (patogeenisiä variantteja), jotka häiritsevät RNA: ta (transkripti), joita ei tunnistettu DNA -sekvensoinnilla.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on vastata avainkysymykseen harvinaisten geneettisten sairauksien alalla määrittämällä haitallisten varianttien esiintyvyys RNA -tasolla diagnosoimattomilla potilailla, joilla on kehitysvammaisuus ja/tai vastasyntyneen hypotonia. Tämä tutkimus lopettaa diagnostisen epämääräisyyden useilla potilailla.
Lopuksi tämän tutkimuksen tulokset mahdollistavat RNASEQ: n kahta kudostyyppiä vertailua tämän analyysimenetelmän toteuttamisen helpottamiseksi diagnostisessa ympäristössä.
Tavoitteet:
Määritä muunnelmien esiintyvyys, jolla on haitallinen vaikutus RNA -tasolla, joka tunnistetaan transkriptillisellä analyysillä (RNASEQ) diagnostisesti virheellisillä potilailla, joilla on vastasyntyneen hypotonia ja/tai kehitysvammaisuus. Tämä analyysi suoritetaan samanaikaisesti veren ja fibroblastien viljelmässä (ihon biopsia).
Vertaa RNASEQ: n tunnistamien patogeenisten varianttien lukumäärää verikudoksella RNASEQ: n tunnistamien patogeenisten varianttien lukumäärään fibroblastviljelmässä. Tulos auttaa päättämään, riittääkö yksi näyte diagnoosin saamiseksi potilailla diagnostisella limbolla.
Opiskelua päätepisteet:
Potilaiden lukumäärä alun perin diagnostisessa erehdyksessä, joissa haitallinen variantti RNA -tasolla tunnistettiin transkriptillisellä analyysillä (RNASEQ).
Diagnostisessa erehtymässä potilailla tunnistettujen haitallisten RNA -varianttien lukumäärä ARNSEQ: n fibroblastien ja ARNSEQ: n käyttämällä verenäytteissä tunnistetut haitalliset RNA -variantit.
Opintojen suunnittelu:
Monikentrinen kuvaava esiintyvyystutkimus
Opintomenettelyt:
Potilaille (tai heidän alaikäisten vanhemmille) ilmoitetaan mahdollisuudesta osallistua tutkimukseen seurannan aikana osana heidän tavanomaista hoitoa. Potilaille annetaan myös esite, joka selittää tutkimusta. Pohjauksen jälkeen potilaat nähdään yhdessä kolmesta keskuksesta (Marseille, Toulon, mukava) allekirjoittaa suostumuslomakkeet ja ottaa näytteitä.
Vain yksi vierailu on suunniteltu osana tutkimusta. Tämä on sisällyttämisvierailu, jonka aikana ihon ja verinäytteet otetaan.
Jos potilaalla tunnistetaan fenotyyppiä selittävä patogeeninen variantti, potilaan lääkäri pyytää variantin vahvistusta kohdennetulla analyysillä (Sanger -sekvensointi) laboratoriolla (Laboratoire de Génétique Moléculaire, APHM) osana diagnoosia. Potilaan lääkäri tarjoaa tämän tuloksen osana potilaan tavanomaista hoitoa.
Aiheet Numero: 62
Opinto -aikataulut:
Sisällyttämisaika: 36 kuukauden seurannan kesto: Potilaalla ei ole seurantaa tässä tutkimuksessa-suunnitellaan yksi osallisuusvierailu. Tulokset ilmoitetaan osana potilaan tavanomaista hoitoa.
Analyysien kesto: 6 kuukauden kokonaiskesto (sisällyttämisen kesto ja analyysin kesto): 42 kuukautta
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Svetlana GOROKHOVA, MD
- Puhelinnumero: 33491388499
- Sähköposti: svetlana.gorokhova@ap-hm.fr
Opiskelupaikat
-
-
Provence-Alpes-Côt-d'Azue
-
Marseille, Provence-Alpes-Côt-d'Azue, Ranska, 13354
- Rekrytointi
- assistance publique - hôpitaux de Marseille
-
Ottaa yhteyttä:
- Svetlana GOROKHOVA, MD
- Puhelinnumero: 33491388499
- Sähköposti: svetlana.gorokhova@ap-hm.fr
-
Päätutkija:
- Svetlana GOROKHOVA, MD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Mies tai nainen, ikäinen 0–99 vuotta
- Potilas, jolla on vastasyntyneen henkinen vamma ja/tai hypotonia, seurasi yhtä kolmesta osallisuuskeskuksesta
- Potilaalle tai vanhemmalle on ilmoitettu tutkimuksesta ja se on allekirjoittanut tietoisen suostumuslomakkeen
- Geneettinen analyysi korkean suorituskyvyn DNA-sekvensoinnilla (geenipaneeli, eksome, genomi) ei tunnistanut mitään epänormaalisuutta, joka selittää potilaan fenotyyppiä.
- Jos potilaan fenotyyppi viittaa Prader-Willin oireyhtymään tai Angelmanin oireyhtymään: kromosomin 15 metylaatiopoikkeamakoe oli negatiivinen.
- Jos potilaan fenotyyppi viittaa herkän X -oireyhtymään: FMR1 -geenin toistuva laajennusanalyysi oli negatiivinen.
- Jos potilaan fenotyyppi viittaa tyypin I myotoniseen dystrofiaan, DM1: DMPK -geenin toistuva laajennusanalyysi oli negatiivinen.
- Potilaalla on oikeus sosiaaliturvajärjestelmään tai edunsaajalle
Poissulkemiskriteerit:
- Potilas puuttuu vapaudesta
- Raskaana tai imettävä nainen,
- Henkilö, joka vaaditaan allekirjoittavan suostumuslomakkeen, ei ymmärrä ranskaa
- Henkilö huoltajuuden ja/tai kuraattorin alla
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: ARNsekvenssi
Koehenkilöryhmään osallistuvat potilaat tapaavat konsultoivan lääkärin allekirjoittaakseen suostumuslomakkeen ja antamaan näytteitä yhdessä osallistuvista tutkimuspaikoista. Tutkimuksen osana suunnitellaan vain yksi käynti. Tämä on sisällytyskäynti, jonka aikana otetaan ihon ja veren näytteitä. Jos potilaassa tunnistetaan patogeeninen variantti, joka selittää fenotyypin, potilasta seuraava lääkäri pyytää variantin vahvistamista kohdennetulla analyysillä (Sanger-sekvensointi) osana diagnoosia. Tämän tuloksen palauttaa potilasta seuraava lääkäri osana hänen tavanomaista hoitoaan. |
Veri kerätään transkriptisen sekvensoinnin suorittamiseksi verestä
Ihon biopsia suoritetaan transkriptisen sekvensoinnin suorittamiseksi biopsiasta saatuihin fibroblasteihin
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Potilaat, joilla on havaittu haitallinen variantti RNA-tasolla
Aikaikkuna: Tutkimuksen loppuun asti, keskimäärin 42 kuukautta.
|
Potilaiden lukumäärä, joilla oli aluksi diagnoosivirhe, ja joilta haitallinen variantti RNA-tasolla tunnistettiin transkriptomianalyysin (RNAseq) avulla.
|
Tutkimuksen loppuun asti, keskimäärin 42 kuukautta.
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Veren ja fibroblastien saatujen varianttien lukumäärän vertailu
Aikaikkuna: Tutkimuksen loppuun saakka, keskimäärin 42 kuukautta.
|
Potilaissa diagnoosivirheen yhteydessä fibroblasteista ARNsekvensoinnilla tunnistettujen haitallisten RNA-varianttien määrä ja verinäytteistä ARNsekvensoinnilla tunnistetut haitalliset RNA-variantit
|
Tutkimuksen loppuun saakka, keskimäärin 42 kuukautta.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Neurologiset ilmenemismuodot
- Hermoston sairaudet
- Mielenterveyshäiriöt
- Patologiset prosessit
- Sairauden ominaisuudet
- Neurokäyttäytymisoireet
- Neurokehityshäiriöt
- Patologiset tilat, merkit ja oireet
- Merkit ja oireet
- Harvinaiset sairaudet
- Henkinen vamma
- Tutkintatekniikat
- Näytteenkäsittely
- Kliiniset laboratoriotekniikat
- Diagnostiikkatekniikat ja menettelyt
- Diagnoosi
- Puhkaisut
- Kirurgiset toimenpiteet, operatiivinen
- Verinäytteen kokoelma
Muut tutkimustunnusnumerot
- RCAPHM23_0469
- ID-RCB (Muu tunniste: 2025-A00414-45)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .