Análise transcriptômica de fibroblastos e sangue em pacientes com doenças raras (ARNseqFibroSan)
Análise transcriptômica (RNaseq) de sangue e fibroblastos para estabelecer um diagnóstico em pacientes com doenças raras
Este estudo tem como objetivo responder a uma pergunta -chave no campo de doenças genéticas raras, determinando a prevalência de variantes deletérios no nível do RNA em pacientes não diagnosticados com deficiência intelectual e/ou hipotonia neonatal. Este estudo acabará com o diagnóstico de irregularismo em vários pacientes.
Finalmente, os resultados deste estudo possibilitarão a comparação dos dois tipos de tecido usados para o RNASEQ, com o objetivo de facilitar a implementação desse método de análise na configuração de diagnóstico.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Justificativa:
A maioria dos pacientes com deficiência intelectual ou hipotonia neonatal permanece não diagnosticada, apesar dos extensos testes genéticos. De fato, análises padrão destinadas a detectar anormalidades no DNA do paciente apenas permitem que um diagnóstico seja feito em um terço dos casos. Nossa hipótese é que um certo número desses pacientes diagnosticados incorretamente transmite anomalias (variantes patogênicas) que interrompem o RNA (transcrição), que não foram identificadas pelo sequenciamento de DNA.
Este estudo tem como objetivo responder a uma pergunta -chave no campo de doenças genéticas raras, determinando a prevalência de variantes deletérios no nível do RNA em pacientes não diagnosticados com deficiência intelectual e/ou hipotonia neonatal. Este estudo acabará com o diagnóstico de irregularismo em vários pacientes.
Finalmente, os resultados deste estudo possibilitarão a comparação dos dois tipos de tecido usados para o RNASEQ, com o objetivo de facilitar a implementação desse método de análise na configuração de diagnóstico.
Objetivos:
Determine a prevalência de variantes com um efeito deletério no nível do RNA, identificado por análise transcriptômica (RNaseQ) em pacientes diagnóstico errantes com hipotonia neonatal e/ou incapacidade intelectual. Esta análise será realizada em paralelo na cultura de sangue e fibroblastos (biópsia da pele).
Compare o número de variantes patogênicas identificadas pelo RNASEQ no tecido sanguíneo com o número de variantes patogênicas identificadas pelo RNASEQ na cultura de fibroblastos. O resultado ajudará a decidir se uma única amostra é suficiente para obter um diagnóstico em pacientes no limbo diagnóstico.
Estudo terminais:
O número de pacientes inicialmente na erro de diagnóstico na qual uma variante deletéria no nível do RNA foi identificada por análise transcriptômica (RNASEQ).
O número de variantes deletérias de RNA identificadas em pacientes na erro de diagnóstico usando Arnseq em fibroblastos e as variantes deletérios de RNA identificadas usando Arnseq em amostras de sangue.
Desenho do estudo:
Estudo multicêntrico de prevalência descritiva
Procedimentos de estudo:
Os pacientes (ou seus pais no caso de menores) serão informados da possibilidade de participar do estudo durante uma consulta de acompanhamento como parte de seus cuidados usuais. Os pacientes também receberão um folheto explicando o estudo. Após um período de reflexão, os pacientes serão atendidos em um dos três centros (Marselha, Toulon, Nice) para assinar um formulário de consentimento e colher amostras.
Apenas uma visita é planejada como parte do estudo. Esta é a visita de inclusão, durante a qual são coletadas amostras de pele e sangue.
Se uma variante patogênica que explica o fenótipo for identificada em um paciente, o médico do paciente solicitará confirmação da variante por análise direcionada (sequenciamento de Sanger) pelo laboratório (Laboratoire de Génétique Moléculaire, APHM) como parte do diagnóstico. Este resultado será fornecido pelo médico do paciente como parte dos cuidados usuais do paciente.
Número dos sujeitos: 62
Estude os prazos:
Período de inclusão: Duração de 36 meses de acompanhamento: Não há acompanhamento para o paciente neste estudo-uma única visita de inclusão está planejada. Os resultados serão relatados como parte dos cuidados usuais do paciente.
Duração das análises: 6 meses de duração (duração da inclusão e duração da análise): 42 meses
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Svetlana GOROKHOVA, MD
- Número de telefone: 33491388499
- E-mail: svetlana.gorokhova@ap-hm.fr
Locais de estudo
-
-
Provence-Alpes-Côt-d'Azue
-
Marseille, Provence-Alpes-Côt-d'Azue, França, 13354
- Recrutamento
- assistance publique - hôpitaux de Marseille
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Contato:
- Svetlana GOROKHOVA, MD
- Número de telefone: 33491388499
- E-mail: svetlana.gorokhova@ap-hm.fr
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Investigador principal:
- Svetlana GOROKHOVA, MD
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critérios de inclusão:
- Masculino ou feminino, de 0 a 99 anos
- Paciente com deficiência intelectual neonatal e/ou hipotonia seguida em um dos três centros de inclusão
- Paciente ou pai foi informado sobre o estudo e assinou um formulário de consentimento informado
- A análise genética por sequenciamento de DNA de alto rendimento (painel de genes, exoma, genoma) não identificou nenhuma anormalidade explicando o fenótipo do paciente.
- Se o fenótipo do paciente for sugestivo da síndrome de Prader-Willi ou da síndrome de Angelman: um teste de anomalia de metilação no cromossomo 15 foi negativo.
- Se o fenótipo do paciente for sugestivo da síndrome de X frágil: uma análise de expansão repetida do gene FMR1 foi negativa.
- Se o fenótipo do paciente for sugestivo de distrofia miotônica tipo I, DM1: uma análise de expansão repetida do gene DMPK foi negativa.
- Paciente com direito ou beneficiário de um esquema de seguridade social
Critérios de exclusão:
- Paciente privado de liberdade
- Mulher grávida ou amamentando,
- A pessoa necessária para assinar o formulário de consentimento não entende francês
- Pessoa sob tutela e/ou curadoria
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
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Experimental: ARNseq
Os doentes inscritos no braço experimental serão vistos em consulta para assinar o formulário de consentimento e recolher amostras num dos locais de investigação participantes. Está planeada apenas uma visita como parte do estudo. Esta é a visita de inclusão, durante a qual são recolhidas amostras de pele e sangue. Se for identificada uma variante patogénica que explique o fenótipo num doente, o clínico que segue o doente solicitará a confirmação da variante por análise direcionada (sequenciação Sanger) como parte do diagnóstico. Este resultado será devolvido pelo clínico que segue o doente como parte do seu acompanhamento habitual. |
O sangue é coletado para realizar sequenciação transcriptômica do sangue
Uma biópsia de pele é realizada para realizar sequenciação transcriptômica em fibroblastos obtidos da biópsia
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Pacientes com variante deletéria identificada ao nível do ARN
Prazo: Até à conclusão do estudo, uma média de 42 meses.
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O número de doentes inicialmente em erro diagnóstico em quem foi identificada uma variante deletéria a nível de ARN através da análise transcriptómica (RNAseq).
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Até à conclusão do estudo, uma média de 42 meses.
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Comparação do número de variantes obtidas a partir do sangue e a partir de fibroblastos
Prazo: Até à conclusão do estudo, uma média de 42 meses.
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Número de variantes de ARN deletérias identificadas em pacientes com erro de diagnóstico usando ARNseq em fibroblastos e variantes de ARN deletérias identificadas usando ARNseq em amostras de sangue
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Até à conclusão do estudo, uma média de 42 meses.
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
- Manifestações Neurológicas
- Doenças do Sistema Nervoso
- Transtornos Mentais, Desordem Mental
- Processos Patológicos
- Atributos da doença
- Manifestações Neurocomportamentais
- Distúrbios do Neurodesenvolvimento
- Condições Patológicas, Sinais e Sintomas
- Sinais e sintomas
- Doenças raras
- Deficiência Intelectual
- Técnicas de investigação
- Manipulação de amostras
- Técnicas de laboratório clínico
- Técnicas e procedimentos de diagnóstico
- Diagnóstico
- Perfurações
- Procedimentos cirúrgicos, operatórios
- Coleção de amostras de sangue
Outros números de identificação do estudo
- RCAPHM23_0469
- ID-RCB (Outro identificador: 2025-A00414-45)
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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