Transcriptomische analyse van fibroblasten en bloed bij patiënten met zeldzame ziekten (ARNseqFibroSan)

Rationale:

De meerderheid van de patiënten met intellectuele handicap of neonatale hypotonie blijft niet gediagnosticeerd, ondanks uitgebreide genetische tests. Standaardanalyses gericht op het detecteren van afwijkingen in het DNA van de patiënt maken zelfs mogelijk dat een diagnose in een derde van de gevallen kan worden gesteld. Onze hypothese is dat een bepaald aantal van deze verkeerd gediagnosticeerde patiënten afwijkingen (pathogene varianten) vervoeren die het RNA (transcript) verstoren, die niet werden geïdentificeerd door DNA -sequencing.

Deze studie beoogt een belangrijke vraag te beantwoorden op het gebied van zeldzame genetische ziekten door de prevalentie van schadelijke varianten op RNA -niveau te bepalen bij niet -gediagnosticeerde patiënten met intellectuele handicap en/of neonatale hypotonie. Deze studie zal een einde maken aan diagnostisch grillistiek bij een aantal patiënten.

Ten slotte zullen de resultaten van deze studie het mogelijk maken om de twee soorten weefsel te vergelijken die voor RNASEQ worden gebruikt, met het oog op het faciliteren van de implementatie van deze analysemethode in de diagnostische setting.

Doelstellingen:

Bepaal de prevalentie van varianten met een schadelijk effect op RNA -niveau, geïdentificeerd door transcriptomische analyse (RNASEQ) bij diagnostisch dwalende patiënten met neonatale hypotonie en/of intellectuele handicap. Deze analyse zal parallel worden uitgevoerd op bloed- en fibroblastcultuur (huidbiopsie).

Vergelijk het aantal pathogene varianten geïdentificeerd door RNaseq op bloedweefsel met het aantal pathogene varianten geïdentificeerd door RNaseq op fibroblastcultuur. Het resultaat zal helpen om te beslissen of een enkel monster voldoende is om een diagnose te krijgen bij patiënten in diagnostische limbo.

Studie eindpunten:

Het aantal patiënten aanvankelijk in diagnostische fout bij wie een schadelijke variant op RNA -niveau werd geïdentificeerd door transcriptomische analyse (RNASEQ).

Het aantal schadelijke RNA -varianten geïdentificeerd bij patiënten in diagnostische fout met behulp van arnseq op fibroblasten en de schadelijke RNA -varianten geïdentificeerd met ARNSEQ op bloedmonsters.

Studieontwerp:

Multicentrische beschrijvende prevalentiestudie

Studieprocedures:

Patiënten (of hun ouders in het geval van minderjarigen) worden geïnformeerd over de mogelijkheid om deel te nemen aan het onderzoek tijdens een vervolgconsult als onderdeel van hun gebruikelijke zorg. Patiënten krijgen ook een folder waarin de studie wordt uitgelegd. Na een periode van reflectie zullen patiënten worden gezien in een van de drie centra (Marseille, Toulon, Nice) om een toestemmingsformulier te ondertekenen en monsters aan te nemen.

Slechts één bezoek is gepland als onderdeel van het onderzoek. Dit is het inclusiebezoek, waarin huid- en bloedmonsters worden genomen.

Als een pathogene variant die het fenotype uitlegt, wordt geïdentificeerd bij een patiënt, zal de arts van de patiënt door het laboratorium (Laboratoire de Génétique Moléculaire, APHM) om de diagnose (Sanger Sequencing) van de variant (Sanger Sequencing) om de variant (Sanger -sequencing) vragen. Dit resultaat zal door de arts van de patiënt worden verstrekt als onderdeel van de gebruikelijke zorg van de patiënt.

Onderwerpen Nummer: 62

Studie tijdlijnen:

Inclusieperiode: 36 maanden duur van de follow-up: er is geen follow-up voor de patiënt in deze studie-een enkel inclusiebezoek is gepland. Resultaten zullen worden gerapporteerd als onderdeel van de gebruikelijke zorg van de patiënt.

Duur van analyses: 6 maanden totale duur (duur van inclusie en analyse duur): 42 maanden