Transkriptomische Analyse von Fibroblasten und Blut bei Patienten mit seltenen Krankheiten (ARNseqFibroSan)

Begründung:

Die Mehrheit der Patienten mit geistiger Behinderung oder Neugeborenenhypotonie bleibt trotz umfassender Gentests nicht diagnostiziert. Tatsächlich ermöglichen Standardanalysen, Abnormalitäten in der DNA des Patienten nachzuweisen, nur eine Diagnose in einem Drittel der Fälle. Unsere Hypothese ist, dass eine bestimmte Anzahl dieser fehldiagnostizierten Patienten Anomalien (pathogene Varianten) tragen, die die RNA (Transkript) stören, die nicht durch DNA -Sequenzierung identifiziert wurden.

Diese Studie zielt darauf ab, eine Schlüsselfrage im Bereich seltener genetischer Erkrankungen zu beantworten, indem die Prävalenz von schädlichen Varianten auf RNA -Ebene bei nicht diagnostizierten Patienten mit geistiger Behinderung und/oder Neugeborenenhypotonie bestimmt wird. Diese Studie wird bei einer Reihe von Patienten ein Ende des diagnostischen Erratismus ein Ende setzen.

Schließlich ermöglichen die Ergebnisse dieser Studie es, die beiden für RNaseQ verwendeten Gewebearten zu vergleichen, um die Implementierung dieser Analysemethode in der diagnostischen Umgebung zu erleichtern.

Ziele:

Bestimmen Sie die Prävalenz von Varianten mit einer schädlichen Wirkung auf RNA -Ebene, die durch transkriptomische Analyse (RNaseQ) bei diagnostisch fehlerhaften Patienten mit Neugeborenenhypotonie und/oder geistiger Behinderung identifiziert wird. Diese Analyse wird parallel zur Blut- und Fibroblastenkultur (Hautbiopsie) durchgeführt.

Vergleichen Sie die Anzahl der durch RNaseq im Blutgewebe identifizierten pathogenen Varianten mit der Anzahl der durch RNaseq identifizierten pathogenen Varianten zur Fibroblastenkultur. Das Ergebnis wird dazu beitragen, zu entscheiden, ob eine einzelne Stichprobe ausreicht, um bei Patienten in diagnostischer Schwebe eine Diagnose zu erhalten.

Studienendpunkte:

Die Anzahl der Patienten anfänglich in diagnostischer Irrtum, bei denen eine schädliche Variante auf RNA -Ebene durch transkriptomische Analyse (RNaseq) identifiziert wurde.

Die Anzahl der schädlichen RNA -Varianten, die bei Patienten mit diagnostischen Errang unter Verwendung von ARNSEQ auf Fibroblasten und den schädlichen RNA -Varianten, die unter Verwendung von ARNSEQ auf Blutproben identifiziert wurden, identifiziert wurden.

Studiendesign:

Multizentrische beschreibende Prävalenzstudie

Studienverfahren:

Patienten (oder ihre Eltern im Fall von Minderjährigen) werden im Rahmen ihrer üblichen Versorgung über die Möglichkeit einer Teilnahme an der Studie während einer Follow-up-Konsultation informiert. Die Patienten erhalten auch eine Broschüre, in der die Studie erklärt wird. Nach einer Zeit der Reflexion werden die Patienten in einem von drei Zentren (Marseille, Toulon, Nice) gesehen, um ein Einverständnisformular zu unterzeichnen und Proben zu entnehmen.

Im Rahmen der Studie ist nur ein Besuch geplant. Dies ist der Einschlussbesuch, bei dem Haut- und Blutproben entnommen werden.

Wenn eine pathogene Variante, die den Phänotyp erklärt, bei einem Patienten identifiziert wird, beantragt der Arzt des Patienten die Variante durch gezielte Analyse (Sanger -Sequenzierung) durch das Labor (Laboratoire de Génétique Moléculaire, APHM) als Teil der Diagnose. Dieses Ergebnis wird vom Arzt des Patienten als Teil der üblichen Versorgung des Patienten bereitgestellt.

Themen Nummer: 62

Studienzeitpläne:

Einschlusszeit: 36 Monate Dauer der Follow-up: In dieser Studie gibt es keine Nachuntersuchung für den Patienten-ein einziger Einschlussbesuch ist geplant. Die Ergebnisse werden im Rahmen der üblichen Versorgung des Patienten gemeldet.

Dauer der Analysen: 6 Monate Gesamtdauer (Dauer der Einbeziehung und Analysedauer): 42 Monate