Sairaalajätevedet: terveyden seurantatyökalu moniresistenssin aikakaudella (ROSEAU)

Bakteerinen antimikrobiaalinen resistenssi (AMR) on merkittävä kansanterveydellinen uhka, ja seuranta on keskeinen elementti taistelussa AMR:ää vastaan. Erityisen huolestuttavaa on moni- ja erittäin antibioottiresistenttien bakteerien (MDRO) ilmaantuminen ja leviäminen, erityisesti laajakirjoisia beetalaktamaaseja (ESBL-E) ja/tai karbapenemaaseja tuottavia Enterobacteriaceae-suvun bakteereita (EPC). Nämä viimeksi mainitut todellakin aiheuttavat tällä hetkellä suuren terapeuttisen haasteen lähes kaikkien ensilinjan antibioottien tehottomuuden ja tartunnan sattuessa toisen linjan molekyylien käytön tarpeen vuoksi. E-BLSE ja EPC ovat Enterobacteriaceae-suvun bakteereita, jotka luontaisesti kolonisoivat ihmisten ja eläinten suoliston mikrobiota, ja joiden runsaus mikrobiotassa kasvaa antibioottihoidon ansiosta. Nämä bakteerit päätyvät jätevesiin ulosteiden mukana, mikä edesauttaa niiden leviämistä ympäristöön. Nykyään tunnustetaan, että resistenssiä siirtyy ihmis- ja eläinkompartmenteista ympäristöön, mikä on synnyttänyt "Yksi terveys" -konseptin.

MDRO-bakteerien ihmiskolonisaation arvioimiseksi on suoritettava yksilöllisiä seulontoja joko potilaiden ulosteista tai peräsuolen nuotilla. Näytteiden kerääminen on vaikeaa tai se voi tuntua potilaille epämukavalta ja herättää eettisiä kysymyksiä. Lisäksi niiden toteuttaminen on kalliita ja aikaa vievää sekä terveydenhuoltojoukoille että laboratorioille, mikä rajoittaa niiden käyttöönottoa tiettyihin sairaalayksiköihin. MDRO-bakteerien seuranta eri lähteistä, kuten kodeista tai sairaaloista, tulevissa jätevesissä on siksi ehdotettu välilliseksi (tai proxy) merkiksi potilaiden kolonisaatiolle, joka tarjoaa yksinkertaisesti toteutettavan, eettisesti hyväksyttävän ja edullisen vaihtoehdon näiden kantojen seurantaan tietyllä ympäristöllä. Tätä menetelmää on laajalti käytetty COVID-19-pandemian aikana, ja se on synnyttänyt kansallisia verkostoja, kuten Obépine-verkoston. Nykyiset tutkimukset suoritetaan kuitenkin enimmäkseen kaupunkien tai kokonaisten sairaaloiden tasolla, ja niissä on vaikeuksia luoda suoria yhteyksiä ihmiskolonisaation ja ympäristön saastumisen välille. Lisäksi horisontaalinen geeninsiirto, paikallinen bakteerien moninkertaistuminen ja bakteeribiofilmien esiintyminen putkistoissa voivat muuttaa bakteerien ja resistenssigeenien ympäristökoostumusta ja mahdollisesti aiheuttaa harhaa ihmiskolonisaation arvioinnissa. Jätevesiseuranta on kuitenkin mielenkiintoinen työkalu bakteeriresistenssin leviämisen seurantaan, auttaa tunnistamaan uusien resistenssien ilmaantumista ja jopa arvioimaan interventioiden tehokkuutta sairaalan hygieniaryhmien toimesta.

SMIT-rakennuksella on itsenäinen jätevesiverkosto, joka on peräisin Claude Bernard -sairaalan historiasta, joka erikoistuu tartuntatautien hoitoon. Lisäksi tämä osasto ottaa vastaan potilaita, joilla MDRO-kantajuuden esiintyvyys on paljon korkeampi kuin Ranskan väestön keskiarvo, mikä vahvistaa tämän rakenteen epidemiologista merkitystä. Tämä ainutlaatuinen kokoonpano tarjoaa ihanteellisen viitekehyksen bakteeriresistenssin ilmaantumisen ja pysyvyyden tutkimiseen, jota tukee antibioottien ja biocideiden läsnäolo, joita tässä osastossa käytetään laajalti. Tämän rakennuksen jätevesien (ympäristökompartti) analysointi ei vain mahdollistaisi jätevesiin päätyvien bakteerien ja niiden resistenssigeenien määrällistä ja laadullista arviointia, vaan myös suoran yhteyden muodostamista tässä paviljongissa sairaalahoidossa olevien potilaiden kolonisaatioon.

Tutkittava ihmisväestö (ihmiskompartti) koostuu aikuisista potilaista, jotka ovat sairaalahoidossa Bichat - Claude-Bernard -sairaalan tartunta- ja trooppisten tautien osastolla (SMIT) rakennuksen jätevesinäytteenottokampanjan aikana.