Ścieki szpitalne: narzędzie monitorowania zdrowia w erze wielolekooporności (ROSEAU)

Oporność drobnoustrojów na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR) stanowi poważne zagrożenie dla zdrowia publicznego, a nadzór jest kluczowym elementem w walce z AMR. Szczególnie niepokojące jest pojawianie się i rozprzestrzenianie wielolekoopornych i wysoko opornych na antybiotyki bakterii (MDRO), w szczególności Enterobacteriaceae wytwarzających β-laktamazy o rozszerzonym spektrum (ESBL-E) i/lub karbapenemazy (EPC). Rzeczywiście, te ostatnie stanowią obecnie poważne wyzwanie terapeutyczne z powodu nieskuteczności prawie wszystkich antybiotyków pierwszego rzutu oraz konieczności, w przypadku zakażenia, stosowania cząsteczek drugiego rzutu. E-BLSE i EPC to Enterobacteriaceae, które naturalnie kolonizują mikrobiotę jelitową ludzi i zwierząt, a których obfitość w mikrobiotie wzrasta dzięki leczeniu antybiotykami. Bakterie te są uwalniane do ścieków poprzez wydalanie kału, przyczyniając się do ich rozprzestrzeniania w środowisku. Obecnie uznaje się, że istnieją transfery oporności między komponentami ludzkimi i zwierzęcymi a środowiskiem, co stanowi źródło koncepcji "Jedno Zdrowie".

Aby ocenić kolonizację ludzi przez MDRO, konieczne jest przeprowadzenie indywidualnych badań przesiewowych, czy to w kale osób badanych, czy poprzez wymaz z odbytu. Próbki te są trudne do pobrania lub mogą być postrzegane jako niekomfortowe przez osoby badane i rodzą pytania natury etycznej. Ponadto ich realizacja jest kosztowna i czasochłonna zarówno dla zespołów opieki zdrowotnej, jak i laboratoriów, co ogranicza ich wdrożenie do niektórych oddziałów szpitalnych. Dlatego monitorowanie MDRO w ściekach z różnych źródeł, takich jak domy lub szpitale, zostało zaproponowane jako pośredni (lub zastępczy) marker kolonizacji pacjentów, który zapewnia prostą w realizacji, etycznie akceptowalną i niedrogą alternatywę dla monitorowania tych szczepów w danym środowisku. Metoda ta była szeroko stosowana podczas pandemii COVID-19 i stanowi źródło krajowych sieci, takich jak sieć Obépine. Jednak obecne badania są przeprowadzane głównie w skali miast lub całych szpitali i mają trudności z ustaleniem bezpośrednich powiązań między kolonizacją ludzi a skażeniem środowiska. Ponadto horyzontalny transfer genów, miejscowe namnażanie się bakterii oraz obecność biofilmów bakteryjnych w rurach mogą modyfikować środowiskowy skład bakterii i genów oporności, potencjalnie tworząc błąd w szacowaniu kolonizacji ludzi. Niemniej jednak nadzór nad ściekami pozostaje interesującym narzędziem do monitorowania rozprzestrzeniania się oporności bakterii na antybiotyki, pomagając w identyfikacji pojawiania się nowych oporności, a nawet oceniając skuteczność interwencji zespołów higieny szpitalnej.

Budynek SMIT posiada niezależną sieć kanalizacyjną, odziedziczoną z historii Szpitala Claude'a Bernarda, który specjalizuje się w zarządzaniu chorobami zakaźnymi. Ponadto oddział ten przyjmuje pacjentów, u których częstość nosicielstwa MDRO jest znacznie wyższa niż średnia dla ogólnej populacji francuskiej, co dodatkowo wzmacnia zainteresowanie epidemiologiczne tą strukturą. Ta unikalna konfiguracja zapewnia idealne ramy do badania pojawiania się i utrzymywania się oporności bakteryjnej, wspieranej obecnością antybiotyków i biocydów, które są szeroko stosowane w tym oddziale. Analiza ścieków z tego budynku (komponent środowiskowy) pozwoliłaby nie tylko na ilościowe i jakościowe scharakteryzowanie bakterii i ich genów oporności uwalnianych do ścieków, ale także na ustalenie bezpośredniego związku z kolonizacją pacjentów hospitalizowanych w tym pawilonie.

Badana populacja ludzka (komponent ludzki) będzie składać się z dorosłych pacjentów hospitalizowanych w oddziale chorób zakaźnych i tropikalnych (SMIT) szpitala Bichat - Claude-Bernard w czasie kampanii pobierania próbek ścieków z budynku.