Sykehusutslipp: et helseovervåkingsverktøy i en tid med multiresistens (ROSEAU)

Bakteriell antimikrobiell resistens (AMR) er en stor trussel for folkehelsen, og overvåkning er et nøkkel element i kampen mot AMR. Av særlig bekymring er fremveksten og spredningen av multi- og høyt antibiotikaresistente bakterier (MDRO), spesielt utvidet spektrum beta-laktamase (ESBL-E) og/eller karbapenemase-produserende enterobakterier (EPC). Disse sistnevnte utgjør faktisk i dag en stor terapeutisk utfordring på grunn av ineffektiviteten til nesten alle førstevalgs antibiotika og behovet for, ved infeksjon, å bruke andrevalgs molekyler. E-BLSE og EPC er enterobakterier som naturlig koloniserer tarmmikrobiotaen til mennesker og dyr, og hvis mengde i mikrobiotaen øker takket være antibiotikabehandlinger. Disse bakteriene slippes ut i avløpsvann via avføring, noe som bidrar til deres spredning i miljøet. Det er nå anerkjent at det er overføringer av resistens mellom menneskelige og dyriske kompartimenter og miljøet, som er opphavet til "One Health"-konseptet.

For å vurdere menneskelig kolonisering av MDRO, er det nødvendig å utføre individuelle skjerminger enten i subjektenes avføring eller ved rektal avstryk. Disse prøvene er vanskelige å samle inn eller kan oppleves som ukomfortable av subjektene og reiser etiske spørsmål. I tillegg er implementeringen kostbar og tidkrevende for både helseteam og laboratorier, noe som begrenser implementeringen til visse sykehusavdelinger. Overvåking av MDRO i avløpsvann fra ulike kilder, som hjem eller sykehus, har derfor blitt foreslått som en mellomliggende (eller proxy) markør for pasientkolonisering som gir et enkelt å implementere, etisk akseptabelt og billig alternativ for overvåking av disse stammene i et gitt miljø. Denne metoden har blitt mye brukt under COVID-19-pandemien og er opphavet til nasjonale nettverk som Obépine-nettverket. Imidlertid utføres nåværende studier for det meste på byskala eller hele sykehus og sliter med å etablere direkte koblinger mellom menneskelig kolonisering og miljøforurensning. I tillegg kan horisontal genoverføring, lokal bakteriemultiplikasjon og tilstedeværelsen av bakterielle biofilmer i rør endre den miljømessige sammensetningen av bakterier og resistensgener, og potensielt skape en bias i estimeringen av menneskelig kolonisering. Likevel forblir avløpsvannovervåking et interessant verktøy for overvåking av spredningen av bakteriell resistens mot antibiotika, hjelper til med å identifisere fremveksten av nye resistenser og til og med evaluere effektiviteten av intervensjoner fra sykehusets hygieneavdelinger.

SMIT-bygningen har et uavhengig avløpsvannnett, arvet fra historien til Claude Bernard-sykehuset, som spesialiserer seg på behandling av infeksjonssykdommer. I tillegg tar denne avdelingen imot pasienter hvor forekomsten av MDRO-bæring er mye høyere enn gjennomsnittet i den franske befolkningen, noe som forsterker den epidemiologiske interessen for denne strukturen. Denne unike konfigurasjonen gir en ideell ramme for å studere fremveksten og vedvaren av bakteriell resistens, støttet av tilstedeværelsen av antibiotika og biocider, som er mye brukt i denne avdelingen. Analyse av utslippene fra denne bygningen (miljøkompartiment) ville ikke bare gjøre det mulig å kvantifisere og karakterisere bakteriene og deres resistensgener som slippes ut i avløpsvannet, men også å etablere en direkte kobling med koloniseringen av pasienter innlagt i denne paviljongen.

Den studerte menneskepopulasjonen (menneskelig kompartiment) vil bestå av voksne pasienter innlagt på infeksjons- og tropesykdomsavdelingen (SMIT) på Bichat - Claude-Bernard-sykehuset på tidspunktet for en avløpsvannprøvetakingskampanje fra bygningen.