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Génétique du diabète de type 2 chez les Africains de l'Ouest

Génétique du diabète de type 2 dans diverses populations

Arrière plan:

  • Le diabète de type 2 (DT2) et les complications associées sont des contributeurs majeurs à la charge mondiale de morbidité. Le DT2 est déjà une menace majeure pour la santé des populations des pays développés et s'installe rapidement dans les pays en développement.
  • On pense que la compréhension de l'interaction complexe entre les caractéristiques génétiques et le mode de vie dans l'étiologie du DT2 et des complications associées conduira au développement de meilleures stratégies préventives et thérapeutiques. De plus, les résultats de ce projet faciliteront notre compréhension des causes du diabète chez les Afro-Américains, d'autres populations américaines et mondiales.

Objectifs:

  • Mener une étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) pour identifier les variantes génétiques de susceptibilité au diabète chez les Yoruba à Ibadan, au Nigeria.
  • Inscrire et examiner 300 cas non apparentés de DT2 et 300 témoins Yoruba appariés selon l'ethnie.
  • Procéder au reséquençage du gène/loci candidat positionnel pour identifier les variantes fonctionnelles probables dans un sous-ensemble de la cohorte.
  • Mener des études de réplication des 100 meilleures variantes de score dans trois échantillons indépendants d'ascendance africaine et européenne.
  • Déterminer si les variants associés au diabète découverts dans les populations européennes augmentent le risque de diabète chez les Africains de l'Ouest.

Admissibilité:

  • Patients de 18 ans atteints de DT2 confirmé nouvellement diagnostiqués ou sous traitement de l'ethnie Yoruba à Ibadan, au Nigeria. Les sujets témoins sont des non diabétiques appariés ethniquement aux patients.

Concevoir:

  • La conception de l'étude pour les patients et les témoins comprend les étapes suivantes :
  • Discutez du processus de consentement éclairé et obtenez le formulaire de consentement éclairé signé. Le consentement éclairé sera administré par le personnel formé de la clinique.
  • Attribuer un ID d'étude (code-barres)
  • Administrer les questionnaires
  • Obtenir un échantillon d'urine ponctuel
  • Mesurer la tension artérielle
  • Obtenir des mesures anthropométriques, y compris la composition corporelle
  • Effectuer une piqûre au doigt pour le niveau de glucose dans le sang
  • Obtenir des échantillons de sang veineux
  • Effectuer un examen de la vue
  • Le jour suivant, effectuez une glycémie de confirmation pour le petit sous-ensemble de participants nécessitant une confirmation du résultat du test précédent. L'extraction d'ADN des échantillons stockés sera effectuée soit aux National Institutes of Health, soit au laboratoire au Nigeria.
  • Le GWAS sera mené à l'aide de progiciels accessibles au public.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Description détaillée

Ce protocole de recherche est conçu pour étudier la base génétique du diabète de type 2 (DT2) et des conditions connexes en Afrique. Ce projet, l'étude Africa America Diabetes Mellitus (AADM), a été continuellement financé pendant plus d'une décennie par plusieurs instituts du NIH, y compris une subvention R01 du NIDDK au Dr Rotimi lorsqu'il était professeur à l'Université Howard. En conséquence, l'étude AADM dispose d'une infrastructure internationale bien établie avec des collaborateurs de longue date. Alors que les phases précédentes de cette étude incluaient des individus apparentés, nous ne recrutons actuellement que des cas et des témoins de DT2 non apparentés afin de faciliter les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) ou des types similaires d'analyses génétiques pour lesquelles des ensembles de données non apparentés sont optimaux. Au total, nous prévoyons de recruter 10 000 cas et témoins à partir de 5 centres en Afrique de l'Ouest (Enugu, Ibadan et Lagos au Nigeria ; Accra et Kumasi au Ghana). En échantillonnant dans ces régions, nous recruterons des individus représentant principalement 4 grands groupes ethniques (les Yoruba, les Ibo, les Akan et les Ga), ainsi qu'un petit nombre d'individus de divers autres groupes ethniques. À ce jour, nous avons inscrit 6 486 personnes. Ces données seront utilisées pour une variété d'analyses génétiques, y compris des études d'association basées sur des données pangénomiques, des puces d'exome et des ensembles de données de gènes/loci candidats, la cartographie du déséquilibre de liaison (LD) et des études fonctionnelles dans différentes populations ethniquement définies. Sur chaque site, des efforts seront déployés pour recruter des cas et des témoins ethniquement équilibrés dans le but de faciliter la conduite d'études GWAS et de gènes/locus candidats dans un large éventail de populations. Pour mieux comprendre le contexte métabolique complexe du DT2 et ses conséquences, ces données seront également explorées en ce qui concerne une variété de traits liés au DT2, notamment l'obésité, l'hypertension, les lipides sériques, l'inflammation, la néphropathie et la neuropathie. De plus, ces échantillons seront utilisés pour étudier la variation génétique dans le contexte de la façon dont les participants d'ascendance différente réagissent aux médicaments et à d'autres facteurs environnementaux et comment cette variation peut avoir façonné l'histoire de la population. Dans l'ensemble, ces études visent à approfondir notre compréhension de la base génétique du DT2 chez les individus africains. Compte tenu des activités passées, il est également prévu que cette ressource constituera la base de multiples collaborations entre le laboratoire du Dr Rotimi, plusieurs chercheurs intra-muros des NIH et des scientifiques non-NIH. On espère qu'au fil du temps, d'autres populations d'Afrique et d'ailleurs pourront être ajoutées à cette étude pour élargir l'attention sur des individus d'origines ancestrales variées ; chaque population suivante utilisera les mêmes procédures que dans le travail en cours parmi les Africains.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

7418

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Accra, Ghana
        • University of Ghana
      • Kumasi, Ghana
        • University of Science and Tech
      • Enugu, Nigeria
        • University of Nigeria
      • Ibadan, Nigeria
        • University of Ibadan
      • Lagos, Nigeria
        • University of Lagos

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients avec DT2 confirmé nouvellement diagnostiqués ou sous traitement et ceux sans DT2 (appariement ethnique) à Ibadan, Nigeria

La description

  • CRITÈRE D'INTÉGRATION:

Cas - Hommes et femmes atteints de diabète sucré de type 2 confirmé qui sont soit sous traitement pour le diabète, soit nouvellement diagnostiqués avec une glycémie supérieure ou égale à 126 mg/dl à plusieurs reprises. Ces personnes doivent être âgées de plus de 118 ans. À cet égard, tous les participants nouvellement diagnostiqués devront se rendre à la clinique le jour suivant pour effectuer un test de glycémie à jeun afin de confirmer les résultats précédents.

Témoins Hommes et femmes avec une glycémie à jeun (FPG) inférieure à 100 mg/dl (5,6 mmol/l). Les témoins doivent être âgés de plus de 18 ans et doivent être appariés ethniquement aux cas. Les cas inscrits et les témoins doivent être indépendants. Par conséquent, une seule personne peut être inscrite dans chaque famille, à moins qu'ils ne soient mari et femme.

Des tentatives seront faites pour inscrire un nombre égal d'hommes et de femmes. Pour garantir que la distribution ethnique est maintenue dans chaque étude, nous proposons de recruter des participants ethniquement appariés pertinents pour chaque étude.

CRITÈRE D'EXCLUSION:

Les personnes qui ne répondent pas aux critères ci-dessus (par exemple, moins de 18 ans, sans les exigences en matière de glycémie, etc.). Pas plus d'un membre non conjoint de chaque famille. Aucun prisonnier, femme enceinte ou fœtus ne sera inclus dans cette étude.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cas-témoins
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Contrôle
Les sujets témoins sont des non-diabétiques ethniquement appariés aux patients
DT2
Patients atteints de DT2 confirmé nouvellement diagnostiqués ou sous traitement à Ibadan, Nigeria

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Je
Délai: en cours
Dans un sous-ensemble de participants, pour étudier la relation entre les régimes alimentaires, le microbiote intestinal et le DT2/les traits associés.
en cours
H
Délai: en cours
Étudier si l'hémoglobine A1c (HbA1c) en tant qu'indicateur du contrôle de la glycémie au fil du temps est fiable en présence du trait drépanocytaire (HbS), une hémoglobinopathie courante en Afrique de l'Ouest. L'association entre les mesures répétées d'HbA1c et les modifications des traits liés au DT2 au fil du temps sera évaluée. Nous évaluerons également s'il existe une différence systématique (biais) dans l'estimation de l'A1c chez les porteurs du trait drépanocytaire et les non-porteurs chez les personnes avec et sans diabète.
en cours
G
Délai: en cours
g- Dans un sous-ensemble de participants, pour étudier les tissus clés de la physiopathologie du DT2, nous étudierons les différences dans l'expression génique du muscle squelettique et du tissu adipeux chez les personnes maigres et obèses avec et sans DT2 (n = 100, sous-étude de biopsie).
en cours
F
Délai: en cours
f- Mener des analyses génétiques des populations pour décrire l'histoire des populations et développer des techniques statistiques appropriées pour l'analyse génétique des individus d'ascendance africaine.
en cours
E
Délai: en cours
e-Décrire épidémiologiquement ces individus en termes de traits métaboliques et de prévalence des conditions pertinentes, car, pour certains traits, il peut s'agir de la première étude épidémiologique à grande échelle basée sur la population d'Africains avec les données appropriées pour une telle description.
en cours
Ré
Délai: en cours
d- Réaliser une cartographie fine transethnique pour déterminer si la LD réduite à travers le génome chez les individus d'ascendance africaine peut affiner la région d'intérêt autour des associations génétiques découvertes dans les populations d'ascendance non africaine. Effectuer le reséquençage des gènes candidats, le séquençage du génome entier (WGS) ou le séquençage de l'exome entier (WES), dans la mesure où le financement le permet, chez les participants présentant des profils métaboliques d'intérêt. Par exemple, les individus seront sélectionnés qui ont des valeurs extrêmes pour les lipides sériques pour WES. Les variants identifiés par ce reséquençage seront génotypés dans la population d'étude plus large pour une analyse d'association.
en cours
C
Délai: en cours
c- Développer une ressource épidémiologique génétique à grande échelle pour la réplication des résultats d'autres études de traits apparentés chez des individus d'ascendance africaine et non africaine.
en cours
B
Délai: en cours
b- Étudier la contribution des interactions gène x environnement dans le risque de DT2 et dans l'influence des traits associés. Ces investigations peuvent être menées soit de manière hypothétique, spécifique au locus, soit de manière agnostique, c'est-à-dire à l'échelle du génome. Les variantes environnementales à prendre en compte incluent les facteurs liés au mode de vie (par ex. régime alimentaire, mesuré par des questionnaires de fréquence alimentaire (FFQ), des mesures socio-économiques et des médicaments pris.
en cours
UNE
Délai: en cours
a- Mener des études d'association génétique du DT2 et des traits apparentés (y compris la pression artérielle, les lipides sériques, la glycémie, l'adiposité) chez les Africains de l'Ouest de divers groupes ethniques. Les approches comprendront des études d'association à l'échelle du génome (y compris des données de puces d'exome) et des analyses d'association gène candidat/loci.
en cours

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Charles N Rotimi, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

3 février 2009

Dates d'inscription aux études

Première soumission

4 février 2009

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

4 février 2009

Première publication (Estimé)

5 février 2009

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

1 septembre 2026

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

29 août 2026

Dernière vérification

8 juin 2026

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Description du régime IPD

.Un examen approfondi des consentements liés à ce protocole par le NHGRI IRB a été mené et il a été déterminé que parce que le processus de consentement initial ne traitait pas du partage des données des participants et des risques connexes et du rapport et de la confiance soigneusement établis avec les populations et les collaborateurs africains , il ne serait pas approprié de partager les données des participants. Une note de service à cet effet peut être fournie, si nécessaire. Nous continuerons d'être ouverts à la mise à disposition des données par le biais de la collaboration, une utilisation des données qui a été décrite dans les formulaires de consentement initiaux.

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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