Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Tyypin 2 diabeteksen genetiikka länsiafrikkalaisissa

keskiviikko 17. huhtikuuta 2024 päivittänyt: National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Tyypin 2 diabeteksen genetiikka erilaisissa populaatioissa

Tausta:

  • Tyypin 2 diabetes (T2D) ja siihen liittyvät komplikaatiot ovat merkittäviä maailmanlaajuisia sairauksia lisääviä tekijöitä. T2D on jo nyt suuri terveysuhka kehittyneiden maiden väestölle, ja se leviää nopeasti kehitysmaihin.
  • Uskotaan, että geneettisten ja elämäntapaominaisuuksien monimutkaisen vuorovaikutuksen ymmärtäminen T2D:n ja siihen liittyvien komplikaatioiden etiologiassa johtaa parempien ehkäisevien ja terapeuttisten strategioiden kehittämiseen. Lisäksi tämän projektin tulokset auttavat ymmärtämään diabeteksen syitä afroamerikkalaisissa, muissa Yhdysvaltojen ja maailman väestössä.

Tavoitteet:

  • Suorittaa genominlaajuinen assosiaatiotutkimus (GWAS) diabeteksen herkkyyden geneettisten varianttien tunnistamiseksi jorubalaisten keskuudessa Ibadanissa, Nigeriassa.
  • Ilmoittautua ja tutkia 300 toisiinsa liittymätöntä T2D-tapausta ja 300 etnistä alkuperää vastaavaa jorubakontrollia.
  • Suorittaa paikkakandidaattigeenin/-lokusten uudelleensekvensointi todennäköisten toiminnallisten varianttien tunnistamiseksi kohortin osajoukossa.
  • Suorittaa 100 parhaan pisteytysmuunnelman replikaatiotutkimuksia kolmessa riippumattomassa afrikkalaisessa ja eurooppalaisessa esi-isänäytteessä.
  • Tutkia, lisäävätkö eurooppalaisista populaatioista löydetyt diabetekseen liittyvät muunnelmat diabeteksen riskiä länsiafrikkalaisissa.

Kelpoisuus:

  • 18-vuotiaat potilaat, joilla on vahvistettu T2D ja joilla on äskettäin diagnosoitu joruba-etninen tausta tai hoidossa Ibadanissa, Nigeriassa. Kontrollikohteet ovat ei-diabeetikoita, jotka ovat etnisesti rinnastettavissa potilaisiin.

Design:

  • Sekä potilaiden että kontrollien tutkimussuunnitelma koostuu seuraavista vaiheista:
  • Keskustele tietoisen suostumuksen prosessista ja hanki allekirjoitettu tietoon perustuva suostumuslomake. Tietoisen suostumuksen antaa koulutettu klinikan henkilökunta.
  • Määritä tutkimustunnus (viivakoodi)
  • Hallitse kyselylomakkeita
  • Ota pistevirtsanäyte
  • Mittaa verenpaine
  • Hanki antropometriset mittaukset, mukaan lukien kehon koostumus
  • Suorita sormenpistos verensokeritason mittaamiseksi
  • Ota laskimoverinäytteet
  • Suorita silmätutkimus
  • Suorita seuraavana päivänä vahvistava verensokeri pienelle osajoukolle osallistujia, jotka vaativat edellisen testituloksen vahvistusta. Tallennettujen näytteiden DNA-erotus tehdään joko National Institutes of Healthissa tai Nigerian laboratoriossa.
  • GWAS toteutetaan käyttämällä julkisesti saatavilla olevia ohjelmistopaketteja.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Yksityiskohtainen kuvaus

Tämä tutkimusprotokolla on suunniteltu tutkimaan tyypin 2 diabeteksen (T2D) ja siihen liittyvien sairauksien geneettistä perustaa Afrikassa. Tätä projektia, Africa America Diabetes Mellitus (AADM) -tutkimusta, ovat jatkuvasti rahoittaneet useat NIH:n instituutit yli vuosikymmenen ajan, mukaan lukien R01-apuraha NIDDK:lta tohtori Rotimille hänen ollessaan professori Howardin yliopistossa. Tämän seurauksena AADM-tutkimuksella on vakiintunut kansainvälinen infrastruktuuri pitkäaikaisten yhteistyökumppaneiden kanssa. Vaikka tämän tutkimuksen aikaisempiin vaiheisiin on sisältynyt toisiinsa liittyviä henkilöitä, rekisteröimme tällä hetkellä vain toisiinsa liittymättömiä T2D-tapauksia ja -kontrolleja helpottaaksemme genominlaajuisia assosiaatiotutkimuksia (GWAS) tai samantyyppisiä geneettisiä analyysejä, joille riippumattomat tietojoukot ovat optimaalisia. Odotamme rekisteröivämme yhteensä 10 000 tapausta ja valvontaa viidestä Länsi-Afrikan keskustasta (Nigerian Enugu, Ibadan ja Lagos; Ghana Accra ja Kumasi). Ottamalla näytteitä näiltä alueilta rekisteröimme henkilöitä, jotka edustavat pääasiassa neljää suurta etnistä ryhmää (jorubat, ibo, akan ja ga), sekä vähän henkilöitä useista muista etnisistä ryhmistä. Tähän mennessä olemme ilmoittaneet 6 486 henkilöä. Näitä tietoja käytetään erilaisiin geneettisiin analyyseihin, mukaan lukien assosiaatiotutkimukset, jotka perustuvat genominlaajuisiin matriisitietoihin, exome chip -matriisi- ja ehdokasgeeni-/loci-tietosarjoihin, linkage disequilibrium (LD) -kartoitus ja toiminnalliset tutkimukset erilaisissa etnisesti määritellyissä populaatioissa. Jokaisessa paikassa pyritään rekisteröimään etnisesti tasapainoisia tapauksia ja kontrolleja tavoitteena helpottaa GWAS- ja ehdokasgeeni-/lokustutkimusten suorittamista useissa eri populaatioissa. T2D:n monimutkaisen metabolisen taustan ja sen seurausten ymmärtämiseksi paremmin näitä tietoja tarkastellaan myös useiden T2D:hen liittyvien ominaisuuksien suhteen, mukaan lukien liikalihavuus, verenpainetauti, seerumin lipidit, tulehdus, nefropatia ja neuropatia. Lisäksi näitä näytteitä käytetään tutkimaan geneettistä vaihtelua siinä kontekstissa, kuinka eri syntyperäiset osallistujat reagoivat huumeisiin ja muihin ympäristötekijöihin ja miten tämä vaihtelu on saattanut vaikuttaa populaatiohistoriaan. Kaiken kaikkiaan näiden tutkimusten tarkoituksena on edistää ymmärrystämme T2D:n geneettisestä perustasta afrikkalaisilla yksilöillä. Aiempien toimintojen perusteella on myös odotettavissa, että tämä resurssi muodostaa perustan useille yhteistyölle tohtori Rotimin laboratorion, useiden NIH:n sisäisten tutkijoiden ja muiden kuin NIH:n tutkijoiden välillä. Toivotaan, että ajan mittaan tähän tutkimukseen voidaan lisätä uusia populaatioita Afrikasta ja muualta, jotta voidaan laajentaa keskittymistä erilaisista esi-isien taustoista tuleviin yksilöihin. jokainen myöhempi väestö käyttää samoja menettelyjä kuin meneillään olevassa työssä afrikkalaisten parissa.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Arvioitu)

10000

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

Opiskelupaikat

      • Accra, Ghana
        • Valmis
        • University of Ghana
      • Kumasi, Ghana
        • Valmis
        • University of Science and Tech
      • Enugu, Nigeria
        • Valmis
        • University of Nigeria
      • Ibadan, Nigeria
        • Rekrytointi
        • University of Ibadan
        • Ottaa yhteyttä:
      • Lagos, Nigeria
        • Valmis
        • University of Lagos

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Joo

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Potilaat, joilla on vahvistettu T2D ja jotka ovat äskettäin diagnosoituja tai jotka ovat hoidossa, ja potilaat, joilla ei ole T2D-tautia (etnisesti yhteensopivat) Ibadanissa, Nigeriassa

Kuvaus

  • SISÄLLYTTÄMISKRITEERIT:

Tapaukset – Miehet ja naiset, joilla on vahvistettu tyypin 2 diabetes mellitus ja jotka ovat joko diabeteksen hoidossa tai joilla on äskettäin diagnosoitu verensokeri, joka on useammin kuin kerran yli tai yhtä suuri kuin 126 mg/dl. Näiden henkilöiden on oltava yli 118-vuotiaita. Tältä osin kaikkien äskettäin diagnosoitujen osallistujien on vieraileva klinikalla seuraavana päivänä suorittamassa paastoverensokeritesti aiempien tulosten vahvistamiseksi.

Kontrollit Miehet ja naiset, joiden paastoplasman glukoosi (FPG) on alle 100 mg/dl (5,6 mmol/l). Kontrollien on oltava yli 18-vuotiaita, ja niiden tulee olla etnisesti vastaavia tapauksiin. Rekisteröityjen tapausten ja kontrollien on oltava erillisiä. Siksi kustakin perheestä voidaan ilmoittaa vain yksi henkilö, elleivät he ole aviomies ja vaimo.

Miehiä ja naisia ​​pyritään saamaan mukaan yhtä paljon. Varmistaaksemme, että etninen jakautuminen säilyy jokaisessa tutkimuksessa, ehdotamme, että kuhunkin tutkimukseen otetaan mukaan etnisesti toisiaan vastaavia osallistujia.

POISTAMISKRITEERIT:

Ihmiset, jotka eivät täytä yllä olevia kriteerejä (esim. alle 18-vuotiaat, ilman verensokerivaatimuksia jne.). Enintään yksi muu kuin puoliso kustakin perheestä. Tähän tutkimukseen ei oteta mukaan vankeja, raskaana olevia naisia ​​tai sikiöitä.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Case-Control
  • Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Ohjaus
Kontrollikohteet ovat ei-diabeetikoita, jotka ovat etnisesti rinnastettavissa potilaisiin
T2D
Potilaat, joilla on vahvistettu T2D ja jotka on äskettäin diagnosoitu tai jotka ovat hoidossa Ibadanissa, Nigeriassa

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Minä
Aikaikkuna: jatkuva
Osallistujien osajoukossa tutkia ruokavalion, suoliston mikrobiotan ja T2D:hen liittyvien piirteiden välistä suhdetta.
jatkuva
H
Aikaikkuna: jatkuva
Sen tutkimiseksi, onko hemoglobiini A1c (HbA1c) luotettava verensokerin hallinnan indikaattorina, kun läsnä on sirppisoluominaisuus (HbS), joka on yleinen hemoglobinopatia Länsi-Afrikassa. Toistuvien HbA1c-mittausten ja T2D:hen liittyvien ominaisuuksien muutosten välinen yhteys arvioidaan ajan myötä. Arvioimme myös, onko A1c:n arvioinnissa systemaattista eroa (harha) sirppiominaisuuden kantajilla ja ei-kantajilla potilailla, joilla on ja ei diabetesta.
jatkuva
G
Aikaikkuna: jatkuva
g- Osallistujien alajoukossa T2D:n patofysiologian avainkudosten tutkimiseksi tutkimme eroja luurankolihasten ja rasvakudoksen geeniekspressiossa laihoilla ja liikalihavilla yksilöillä, joilla on ja ei ole T2D:tä (n=100, biopsia-alatutkimus).
jatkuva
F
Aikaikkuna: jatkuva
f- Suorittaa populaatiogeneettisiä analyyseja populaatiohistorian kuvaamiseksi ja kehittää tilastollisia tekniikoita, jotka soveltuvat afrikkalaisten syntyperäisten yksilöiden geneettiseen analysointiin.
jatkuva
E
Aikaikkuna: jatkuva
e-Kuvailla näitä yksilöitä epidemiologisesti aineenvaihdunnan ominaisuuksien ja asiaankuuluvien sairauksien esiintyvyyden suhteen, koska joidenkin ominaisuuksien osalta tämä saattaa olla ensimmäinen laajamittainen epidemiologinen populaatiopohjainen tutkimus afrikkalaisista, jolla on asianmukaiset tiedot tällaiseen kuvaukseen.
jatkuva
D
Aikaikkuna: jatkuva
d- Suorittaa transetninen hieno kartoitus sen määrittämiseksi, voiko afrikkalaisten syntyperäisten yksilöiden genomin vähentynyt LD tarkentaa kiinnostavaa aluetta geneettisten assosiaatioiden ympärillä, jotka on löydetty ei-afrikkalaisista syntyperäisistä populaatioista. Suorittaa ehdokasgeenin uudelleensekvensointi, koko genomisekvenssi (WGS) tai koko eksomesekvensointi (WES), rahoituksen salliessa osallistujille, joilla on kiinnostavia metabolisia profiileja. Esimerkiksi valitaan yksilöt, joilla on äärimmäiset seerumin lipidien arvot WES:lle. Tällä uudelleensekvensoinnilla tunnistetut variantit genotyypitetään suuremmassa tutkimuspopulaatiossa assosiaatioanalyysiä varten.
jatkuva
C
Aikaikkuna: jatkuva
c- Kehittää laajamittainen geneettinen epidemiologinen resurssi muiden tutkimusten löydösten replikoimiseksi afrikkalaisten ja ei-afrikkalaisten esi-isien ominaisuuksista.
jatkuva
B
Aikaikkuna: jatkuva
b- Tutkia geeni x -ympäristövuorovaikutusten osuutta T2D-riskissä ja siihen liittyviin ominaisuuksiin vaikuttamisessa. Nämä tutkimukset voidaan suorittaa joko hypoteesilähtöisesti, lokuskohtaisesti tai agnostisesti, eli genominlaajuisesti. Huomioitaviin ympäristömuunnelmiin kuuluvat elämäntapatekijät (esim. ruokavalio, joka mitataan ruokatiheyskyselyillä (FFQ), sosioekonomisilla mittareilla ja käytetyillä lääkkeillä.
jatkuva
A
Aikaikkuna: jatkuva
a- Suorittaa geneettisiä assosiaatiotutkimuksia T2D:stä ja siihen liittyvistä piirteistä (mukaan lukien verenpaine, seerumin lipidit, verensokeri, rasvaisuus) eri etnisiin ryhmiin kuuluvilla länsiafrikkalaisilla. Lähestymistapaan kuuluvat genominlaajuiset assosiaatiotutkimukset (mukaan lukien eksomisirutiedot) ja ehdokasgeenien/lokusten assosiaatioanalyysit.
jatkuva

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Tutkijat

  • Päätutkija: Charles N Rotimi, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Tiistai 3. helmikuuta 2009

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Keskiviikko 4. helmikuuta 2009

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Keskiviikko 4. helmikuuta 2009

Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)

Torstai 5. helmikuuta 2009

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Torstai 18. huhtikuuta 2024

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Keskiviikko 17. huhtikuuta 2024

Viimeksi vahvistettu

Keskiviikko 21. helmikuuta 2024

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 999909070
  • 09-HG-N070

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

EI

IPD-suunnitelman kuvaus

NHGRI:n IRB suoritti tähän pöytäkirjaan liittyvien suostumusten laajan tarkastelun ja todettiin, että koska alkuperäinen suostumusprosessi ei käsitellyt osallistujien tietojen jakamista ja siihen liittyviä riskejä eikä huolellisesti luotua suhdetta ja luottamusta afrikkalaisten väestöjen ja yhteistyökumppaneiden kanssa. , ei olisi asianmukaista jakaa osallistujan tietoja. Tästä voidaan tarvittaessa laatia muistio. Olemme jatkossakin avoimia tietojen asettamiselle saataville yhteistyön kautta, käyttämällä alustavissa suostumuslomakkeissa kuvailtuja tietoja.

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Hypertensio

3
Tilaa