Genética de la diabetes tipo 2 en africanos occidentales
17 de abril de 2024 actualizado por: National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Genética de la diabetes tipo 2 en diversas poblaciones
Antecedentes:
- La diabetes tipo 2 (T2D) y las complicaciones asociadas son los principales contribuyentes a la carga mundial de morbilidad. La DT2 ya es una gran amenaza para la salud en las poblaciones de los países desarrollados y se está afianzando rápidamente en el mundo en desarrollo.
- Se cree que la comprensión de la compleja interacción entre las características genéticas y del estilo de vida en la etiología de la DT2 y las complicaciones relacionadas conducirá al desarrollo de mejores estrategias preventivas y terapéuticas. Además, los resultados de este proyecto facilitarán nuestra comprensión de las causas de la diabetes en los afroamericanos, otras poblaciones de EE. UU. y del mundo.
Objetivos:
- Realizar un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para identificar variantes genéticas de susceptibilidad a la diabetes entre el pueblo yoruba en Ibadan, Nigeria.
- Inscribir y examinar 300 casos no relacionados de DT2 y 300 controles yoruba de etnia coincidente.
- Para llevar a cabo la resecuenciación del gen/loci candidato posicional para identificar variantes funcionales probables en un subconjunto de la cohorte.
- Realizar estudios de replicación de las 100 mejores variantes de puntuación en tres muestras independientes de ascendencia africana y europea.
- Investigar si las variantes asociadas a la diabetes descubiertas en las poblaciones europeas aumentan el riesgo de diabetes en los africanos occidentales.
Elegibilidad:
- Pacientes de 18 años de edad con DT2 confirmada recién diagnosticados o en tratamiento de etnia yoruba en Ibadan, Nigeria. Los sujetos de control son personas no diabéticas étnicamente emparejadas con los pacientes.
Diseño:
- El diseño del estudio, tanto para pacientes como para controles, consta de los siguientes pasos:
- Discutir el proceso de consentimiento informado y obtener un formulario de consentimiento informado firmado. El consentimiento informado será administrado por personal clínico capacitado.
- Asignar ID de estudio (código de barras)
- Administrar cuestionarios
- Obtener muestra de orina puntual
- Medir la presión arterial
- Obtener medidas antropométricas, incluida la composición corporal.
- Realizar pinchazo en el dedo para el nivel de glucosa en sangre
- Obtener muestras de sangre venosa
- Realizar examen ocular
- Al día siguiente, realice la confirmación de glucosa en sangre para el pequeño subconjunto de participantes que requieren confirmación del resultado de la prueba anterior. La extracción de ADN de las muestras almacenadas se realizará en los Institutos Nacionales de Salud o en el laboratorio de Nigeria.
- GWAS se llevará a cabo utilizando paquetes de software disponibles públicamente.
Descripción general del estudio
Estado
Reclutamiento
Condiciones
Descripción detallada
Este protocolo de investigación está diseñado para estudiar la base genética de la diabetes tipo 2 (T2D) y las condiciones relacionadas en África.
Este proyecto, el Estudio de Diabetes Mellitus de África América (AADM), ha sido financiado continuamente durante más de una década por múltiples institutos de los NIH, incluida una subvención R01 del NIDDK al Dr. Rotimi cuando era profesor en la Universidad de Howard.
Como resultado, el estudio de la AADM cuenta con una infraestructura internacional bien establecida con colaboradores de larga data.
Si bien las fases anteriores de este estudio han incluido personas relacionadas, actualmente solo estamos inscribiendo casos y controles de DT2 no relacionados para facilitar los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) o tipos similares de análisis genéticos para los cuales los conjuntos de datos no relacionados son óptimos.
En total, anticipamos inscribir 10 000 casos y controles de 5 centros en África Occidental (Enugu, Ibadan y Lagos en Nigeria; Accra y Kumasi en Ghana).
Al tomar muestras de estas regiones, inscribiremos a personas que representen principalmente a 4 grupos étnicos principales (yoruba, ibo, akan y ga), así como a un número reducido de personas de una variedad de otros grupos étnicos.
Hasta la fecha, hemos inscrito a 6.486 personas.
Estos datos se utilizarán para una variedad de análisis genéticos, incluidos estudios de asociación basados en datos de matriz de todo el genoma, matriz de chips de exoma y conjuntos de datos de genes/loci candidatos, mapeo de desequilibrio de ligamiento (LD) y estudios funcionales en diferentes poblaciones étnicamente definidas.
En cada sitio, se harán esfuerzos para inscribir casos y controles étnicamente equilibrados con el objetivo de facilitar la realización de GWAS y estudios de genes/loci candidatos en una amplia gama de poblaciones.
Para comprender mejor el trasfondo metabólico complejo de la DT2 y sus consecuencias, estos datos también se explorarán con respecto a una variedad de rasgos relacionados con la DT2, que incluyen obesidad, hipertensión, lípidos séricos, inflamación, nefropatía y neuropatía.
Además, estas muestras se utilizarán para estudiar la variación genética en el contexto de cómo los participantes de diferente ascendencia responden a las drogas y otros factores ambientales y cómo esta variación puede haber dado forma a la historia de la población.
En general, estos estudios tienen como objetivo mejorar nuestra comprensión de la base genética de la DT2 en individuos africanos.
Dadas las actividades pasadas, también se anticipa que este recurso formará la base de múltiples colaboraciones entre el laboratorio del Dr. Rotimi, varios investigadores internos de los NIH y científicos que no pertenecen a los NIH.
Se espera que, con el tiempo, se puedan agregar a este estudio poblaciones adicionales de África y más allá para expandir el enfoque en individuos de diferentes orígenes ancestrales; cada población subsiguiente utilizará los mismos procedimientos que en el trabajo en curso entre los africanos.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
10000
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Estudio Contacto
- Nombre: Shirley Freeman
- Número de teléfono: (301) 451-2302
- Correo electrónico: freemansh@mail.nih.gov
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Charles N Rotimi, M.D.
- Número de teléfono: (301) 451-2303
- Correo electrónico: rotimic@mail.nih.gov
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Accra, Ghana
- Terminado
- University of Ghana
-
Kumasi, Ghana
- Terminado
- University of Science and Tech
-
-
-
-
-
Enugu, Nigeria
- Terminado
- University of Nigeria
-
Ibadan, Nigeria
- Reclutamiento
- University of Ibadan
-
Contacto:
- Clement Adebamowo, M.D.
- Número de teléfono: (410) 706-6116
- Correo electrónico: cadebamo@yahoo.com
-
Lagos, Nigeria
- Terminado
- University of Lagos
-
-
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
Sí
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Pacientes con diabetes tipo 2 confirmada recién diagnosticados o en tratamiento y pacientes sin diabetes tipo 2 (emparejados étnicamente) en Ibadan, Nigeria
Descripción
- CRITERIOS DE INCLUSIÓN:
Casos: hombres y mujeres con diabetes mellitus tipo 2 confirmada que están en tratamiento para la diabetes o recién diagnosticados con lectura de azúcar en sangre en más de una ocasión superior o igual a 126 mg/dl. Estas personas deben ser mayores de 118 años. En este sentido, todos los participantes recién diagnosticados deberán visitar la clínica al día siguiente para realizar una prueba de glucosa en sangre en ayunas para confirmar los resultados anteriores.
Controles Hombres y mujeres con glucosa plasmática en ayunas (FPG) inferior a 100 mg/dl (5,6 mmol/l). Los controles deben ser mayores de 18 años y deben coincidir étnicamente con los casos. Los casos y controles inscritos tienen que no estar relacionados. Por lo tanto, solo se puede inscribir una persona de cada familia a menos que sean marido y mujer.
Se intentará inscribir a un número igual de hombres y mujeres. Para garantizar que la distribución étnica se mantenga en cada estudio, proponemos inscribir a participantes étnicamente coincidentes relevantes para cada estudio.
CRITERIO DE EXCLUSIÓN:
Personas que no cumplan con los criterios anteriores (por ejemplo, menores de 18 años, sin los requisitos de azúcar en la sangre, etc.). No más de un miembro no cónyuge de cada familia. No se incluirán en este estudio prisioneros, mujeres embarazadas o fetos.
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Control de caso
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
|---|
|
Control
Los sujetos de control son no diabéticos étnicamente emparejados con los pacientes
|
|
DT2
Pacientes con diabetes tipo 2 confirmada recién diagnosticados o en tratamiento en Ibadan, Nigeria
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Yo
Periodo de tiempo: en marcha
|
En un subconjunto de participantes, para investigar la relación entre las dietas, la microbiota intestinal y los rasgos relacionados con la DT2.
|
en marcha
|
|
H
Periodo de tiempo: en marcha
|
Investigar si la hemoglobina A1c (HbA1c) como indicador del control de la glucosa en sangre a lo largo del tiempo es confiable en presencia del rasgo de células falciformes (HbS), una hemoglobinopatía común en África Occidental.
Se evaluará la asociación entre las medidas repetidas de HbA1c y los cambios en los rasgos relacionados con la DT2 a lo largo del tiempo.
También evaluaremos si existe una diferencia sistemática (sesgo) en la estimación de A1c en portadores del rasgo drepanocítico y no portadores en personas con y sin diabetes.
|
en marcha
|
|
GRAMO
Periodo de tiempo: en marcha
|
g- En un subconjunto de participantes, para investigar tejidos clave en la fisiopatología de la DT2, estudiaremos las diferencias en la expresión génica del músculo esquelético y el tejido adiposo en individuos delgados y obesos con y sin DT2 (n=100, subestudio de biopsia).
|
en marcha
|
|
F
Periodo de tiempo: en marcha
|
f- Realizar análisis genéticos de población para describir la historia de la población y desarrollar técnicas estadísticas apropiadas para el análisis genético de individuos de ascendencia africana.
|
en marcha
|
|
Mi
Periodo de tiempo: en marcha
|
e-Describir estos individuos epidemiológicamente en términos de rasgos metabólicos y la prevalencia de condiciones relevantes, ya que, para algunos rasgos, este puede ser el primer estudio epidemiológico a gran escala basado en la población de africanos con los datos apropiados para tal descripción.
|
en marcha
|
|
D
Periodo de tiempo: en marcha
|
d- Realizar un mapeo fino transétnico para determinar si la LD reducida en el genoma en individuos de ascendencia africana puede refinar la región de interés alrededor de las asociaciones genéticas descubiertas en poblaciones de ascendencia no africana.
Para realizar la resecuenciación de genes candidatos, la secuenciación del genoma completo (WGS) o la secuenciación del exoma completo (WES), según lo permita la financiación, en participantes con perfiles metabólicos de interés.
Por ejemplo, se seleccionarán individuos que tengan valores extremos de lípidos séricos para WES.
Las variantes identificadas por esta resecuenciación serán genotipadas en la población de estudio más grande para el análisis de asociación.
|
en marcha
|
|
C
Periodo de tiempo: en marcha
|
c- Desarrollar un recurso epidemiológico genético a gran escala para la replicación de hallazgos en otros estudios de rasgos relacionados en individuos de ascendencia africana y no africana.
|
en marcha
|
|
B
Periodo de tiempo: en marcha
|
b- Investigar la contribución de las interacciones gen x medio ambiente en el riesgo de T2D y en la influencia de los rasgos relacionados.
Estas investigaciones pueden llevarse a cabo de manera específica de locus impulsada por hipótesis o de manera agnóstica, es decir, en todo el genoma.
Las variantes ambientales a considerar incluyen factores de estilo de vida (p.
dieta, medida por cuestionarios de frecuencia de alimentos (FFQ), medidas socioeconómicas y medicamentos tomados.
|
en marcha
|
|
A
Periodo de tiempo: en marcha
|
a- Realizar estudios de asociación genética de DT2 y rasgos relacionados (incluyendo presión arterial, lípidos séricos, glucosa en sangre, adiposidad) en africanos occidentales de diversos grupos étnicos.
Los enfoques incluirán estudios de asociación de todo el genoma (incluidos datos de chips de exoma) y análisis de asociación de genes candidatos/loci.
|
en marcha
|
Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Charles N Rotimi, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
3 de febrero de 2009
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
4 de febrero de 2009
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
4 de febrero de 2009
Publicado por primera vez (Estimado)
5 de febrero de 2009
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
18 de abril de 2024
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
17 de abril de 2024
Última verificación
21 de febrero de 2024
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 999909070
- 09-HG-N070
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
NO
Descripción del plan IPD
Se llevó a cabo una revisión exhaustiva de los consentimientos relacionados con este protocolo por parte del NHGRI IRB y se determinó que debido a que el proceso de consentimiento inicial no abordó el intercambio de datos de los participantes y los riesgos relacionados y la relación y confianza cuidadosamente establecidas con las poblaciones africanas y los colaboradores , no sería apropiado compartir los datos del participante.
Se puede proporcionar un memorando a tal efecto, si es necesario.
Continuaremos estando abiertos a hacer que los datos estén disponibles a través de la colaboración, un uso de los datos que se describió en los formularios de consentimiento iniciales.
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .