Genetica van diabetes type 2 bij West-Afrikanen
17 april 2024 bijgewerkt door: National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Genetica van diabetes type 2 in diverse populaties
Achtergrond:
- Diabetes type 2 (T2D) en de daarmee samenhangende complicaties dragen in belangrijke mate bij aan de wereldwijde ziektelast. T2D vormt al een grote bedreiging voor de gezondheid van de bevolking in ontwikkelde landen en neemt snel toe in de derde wereld.
- Er wordt aangenomen dat het begrijpen van de complexe wisselwerking tussen genetische en levensstijlkenmerken in de etiologie van T2D en gerelateerde complicaties zal leiden tot de ontwikkeling van betere preventieve en therapeutische strategieën. Bovendien zullen de resultaten van dit project ons begrip van de oorzaken van diabetes bij Afro-Amerikanen, andere Amerikaanse en wereldbevolkingen vergemakkelijken.
Doelstellingen:
- Een genoombrede associatiestudie (GWAS) uitvoeren om genetische varianten van vatbaarheid voor diabetes te identificeren bij de Yoruba-bevolking in Ibadan, Nigeria.
- Om 300 niet-gerelateerde gevallen van T2D en 300 etniciteit-gematchte Yoruba-controles in te schrijven en te onderzoeken.
- Om positionele kandidaatgenen/-loci opnieuw te rangschikken om waarschijnlijke functionele varianten in een subset van het cohort te identificeren.
- Om replicatiestudies uit te voeren van de top-100 scorende varianten in drie onafhankelijke Afrikaanse en Europese voorouders.
- Om te onderzoeken of diabetes-geassocieerde varianten ontdekt in Europese populaties het diabetesrisico verhogen bij West-Afrikanen.
Geschiktheid:
- Patiënten van 18 jaar met bevestigde T2D die nieuw zijn gediagnosticeerd of die worden behandeld voor Yoruba-etniciteit in Ibadan, Nigeria. Controlepersonen zijn niet-diabetici die etnisch overeenkomen met patiënten.
Ontwerp:
- Het onderzoeksontwerp voor zowel patiënten als controles bestaat uit de volgende stappen:
- Bespreek het geïnformeerde toestemmingsproces en verkrijg een ondertekend geïnformeerd toestemmingsformulier. Geïnformeerde toestemming zal worden toegediend door getraind personeel van de kliniek.
- Onderzoeks-ID toewijzen (streepjescode)
- Vragenlijsten afnemen
- Neem een urinemonster ter plekke
- Meet de bloeddruk
- Verkrijg antropometrische metingen inclusief lichaamssamenstelling
- Voer vingerprik uit voor bloedglucosespiegel
- Veneuze bloedmonsters verkrijgen
- Oogonderzoek uitvoeren
- Voer de volgende dag een bevestigende bloedglucose uit voor de kleine subgroep deelnemers die bevestiging van eerdere testresultaten nodig hebben. DNA-extractie van opgeslagen monsters zal worden gedaan bij de National Institutes of Health of het laboratorium in Nigeria.
- GWAS zal worden uitgevoerd met behulp van openbaar beschikbare softwarepakketten.
Studie Overzicht
Toestand
Werving
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Dit onderzoeksprotocol is ontworpen om de genetische basis van diabetes type 2 (T2D) en aanverwante aandoeningen in Afrika te bestuderen.
Dit project, de Africa America Diabetes Mellitus (AADM) Study, wordt al meer dan tien jaar continu gefinancierd door meerdere instituten van de NIH, waaronder een R01-subsidie van de NIDDK aan Dr. Rotimi toen hij professor was aan Howard University.
Als gevolg hiervan heeft de AADM-studie een gevestigde internationale infrastructuur met langdurige medewerkers.
Terwijl eerdere fasen van deze studie verwante individuen omvatten, schrijven we momenteel alleen niet-gerelateerde T2D-gevallen en controles in om genoombrede associatiestudies (GWAS) of vergelijkbare soorten genetische analyses waarvoor niet-gerelateerde datasets optimaal zijn te vergemakkelijken.
In totaal verwachten we 10.000 gevallen en controles te registreren vanuit 5 centra in West-Afrika (Enugu, Ibadan en Lagos in Nigeria; Accra en Kumasi in Ghana).
Door steekproeven uit deze regio's te nemen, zullen we individuen inschrijven die voornamelijk 4 grote etnische groepen vertegenwoordigen (de Yoruba, Ibo, Akan en Ga), evenals een klein aantal individuen uit verschillende andere etnische groepen.
Tot op heden hebben we 6.486 personen ingeschreven.
Deze gegevens zullen worden gebruikt voor een verscheidenheid aan genetische analyses, waaronder associatiestudies op basis van genoombrede array-gegevens, exome-chiparray en kandidaat-gen/loci-datasets, linkage disequilibrium (LD) mapping en functionele studies in verschillende etnisch gedefinieerde populaties.
Op elke locatie zullen inspanningen worden geleverd om etnisch evenwichtige gevallen en controles in te schrijven met als doel de uitvoering van GWAS en kandidaat-gen/loci-onderzoeken in een breed scala van populaties te vergemakkelijken.
Om de complexe metabole achtergrond van T2D en de gevolgen ervan verder te begrijpen, zullen deze gegevens ook worden onderzocht met betrekking tot een verscheidenheid aan T2D-gerelateerde kenmerken, waaronder obesitas, hypertensie, serumlipiden, ontsteking, nefropathie en neuropathie.
Bovendien zullen deze monsters worden gebruikt om genetische variatie te bestuderen in de context van hoe deelnemers van verschillende afkomst reageren op medicijnen en andere omgevingsfactoren en hoe deze variatie de geschiedenis van de bevolking kan hebben gevormd.
Over het algemeen hebben deze onderzoeken tot doel ons begrip van de genetische basis van T2D bij Afrikaanse individuen te vergroten.
Gezien eerdere activiteiten wordt ook verwacht dat deze bron de basis zal vormen van meerdere samenwerkingen tussen het laboratorium van Dr. Rotimi, verschillende intramurale onderzoekers van de NIH en niet-NIH-wetenschappers.
Het is te hopen dat in de loop van de tijd extra populaties uit Afrika en daarbuiten aan deze studie kunnen worden toegevoegd om de focus op individuen met verschillende voorouderlijke achtergronden uit te breiden; elke volgende populatie zal dezelfde procedures gebruiken als in het lopende werk onder Afrikanen.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Geschat)
10000
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studiecontact
- Naam: Shirley Freeman
- Telefoonnummer: (301) 451-2302
- E-mail: freemansh@mail.nih.gov
Studie Contact Back-up
- Naam: Charles N Rotimi, M.D.
- Telefoonnummer: (301) 451-2303
- E-mail: rotimic@mail.nih.gov
Studie Locaties
-
-
-
Accra, Ghana
- Voltooid
- University of Ghana
-
Kumasi, Ghana
- Voltooid
- University of Science and Tech
-
-
-
-
-
Enugu, Niger
- Voltooid
- University of Nigeria
-
Ibadan, Niger
- Werving
- University of Ibadan
-
Contact:
- Clement Adebamowo, M.D.
- Telefoonnummer: (410) 706-6116
- E-mail: cadebamo@yahoo.com
-
Lagos, Niger
- Voltooid
- University of Lagos
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Ja
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Patiënten met bevestigde T2D die nieuw zijn gediagnosticeerd of in behandeling zijn en patiënten zonder T2D (etnisch gematcht) in Ibadan, Nigeria
Beschrijving
- INSLUITINGSCRITERIA:
Gevallen - Mannen en vrouwen met bevestigde diabetes mellitus type 2 die behandeld worden voor diabetes of pas gediagnosticeerd zijn met een bloedsuikerwaarde die bij meer dan één gelegenheid hoger of gelijk is aan 126 mg/dl. Deze personen moeten ouder zijn dan 118 jaar. In dit opzicht zullen alle nieuw gediagnosticeerde deelnemers de volgende dag de kliniek moeten bezoeken om een nuchtere bloedglucosetest uit te voeren om eerdere resultaten te bevestigen.
Controles Mannen en vrouwen met nuchtere plasmaglucose (FPG) van minder dan 100 mg/dl (5,6 mmol/l). Controles moeten ouder zijn dan 18 jaar en moeten etnisch overeenkomen met de gevallen. Geregistreerde cases en controles mogen niet aan elkaar gerelateerd zijn. Daarom mag er slechts één persoon uit elk gezin worden ingeschreven, tenzij ze man en vrouw zijn.
Er wordt getracht om een gelijk aantal mannen en vrouwen in te schrijven. Om ervoor te zorgen dat de etnische spreiding in elk onderzoek behouden blijft, stellen we voor om etnisch gematchte deelnemers in te schrijven die relevant zijn voor elk onderzoek.
UITSLUITINGSCRITERIA:
Mensen die niet aan de bovenstaande criteria voldoen (bijv. jonger dan 18 jaar, zonder de bloedsuikervereisten, enz.). Niet meer dan één niet-echtgenoot van elk gezin. Er zullen geen gevangenen, zwangere vrouwen of foetussen in deze studie worden opgenomen.
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
|---|
|
Controle
Controlepersonen zijn niet-diabetici die etnisch overeenkomen met patiënten
|
|
T2D
Patiënten met bevestigde T2D die nieuw zijn gediagnosticeerd of in behandeling zijn in Ibadan, Nigeria
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
L
Tijdsspanne: voortdurende
|
In een subgroep van deelnemers, om de relatie tussen diëten, darmmicrobiota en T2D/gerelateerde eigenschappen te onderzoeken.
|
voortdurende
|
|
H
Tijdsspanne: voortdurende
|
Onderzoeken of hemoglobine A1c (HbA1c) als indicator van bloedglucoseregulatie in de loop van de tijd betrouwbaar is in aanwezigheid van de sikkelcelziekte (HbS), een veel voorkomende hemoglobinopathie in West-Afrika.
De associatie tussen herhaalde HbA1c-metingen en veranderingen in T2D-gerelateerde kenmerken in de loop van de tijd zal worden geëvalueerd.
We zullen ook evalueren of er een systematisch verschil (bias) is in de schatting van A1c bij dragers van de sikkeleigenschap en niet-dragers bij personen met en zonder diabetes.
|
voortdurende
|
|
G
Tijdsspanne: voortdurende
|
g- Om sleutelweefsels in de pathofysiologie van T2D te onderzoeken, zullen we in een subgroep van deelnemers verschillen bestuderen in de genexpressie van skeletspieren en vetweefsel bij magere en zwaarlijvige personen met en zonder T2D (n=100, biopsie-subonderzoek).
|
voortdurende
|
|
F
Tijdsspanne: voortdurende
|
f- Genetische populatieanalyses uitvoeren om de geschiedenis van de populatie te beschrijven en statistische technieken te ontwikkelen die geschikt zijn voor genetische analyse van individuen van Afrikaanse afkomst.
|
voortdurende
|
|
E
Tijdsspanne: voortdurende
|
e-Om deze individuen epidemiologisch te beschrijven in termen van metabole kenmerken en de prevalentie van relevante aandoeningen, aangezien dit voor sommige kenmerken de eerste grootschalige epidemiologische, populatiegebaseerde studie van Afrikanen kan zijn met de juiste gegevens voor een dergelijke beschrijving.
|
voortdurende
|
|
D
Tijdsspanne: voortdurende
|
d- Om trans-etnische fine mapping uit te voeren om te bepalen of de verminderde LD over het genoom bij individuen van Afrikaanse afkomst het interessegebied kan verfijnen rond genetische associaties die zijn ontdekt in populaties van niet-Afrikaanse afkomst.
Om kandidaat-gen-resequencing, Whole Genome Sequencing (WGS) of Whole Exome Sequencing (WES) uit te voeren, voor zover financiering dit toelaat, bij deelnemers met interessante metabole profielen.
Er zullen bijvoorbeeld individuen worden geselecteerd die extreme waarden hebben voor serumlipiden voor WES.
Varianten die door deze herschikking worden geïdentificeerd, zullen worden gegenotypeerd in de grotere studiepopulatie voor associatieanalyse.
|
voortdurende
|
|
C
Tijdsspanne: voortdurende
|
c- Het ontwikkelen van een grootschalige genetische epidemiologische bron voor de replicatie van bevindingen in andere studies van verwante kenmerken bij individuen van Afrikaanse en niet-Afrikaanse afkomst.
|
voortdurende
|
|
B
Tijdsspanne: voortdurende
|
b- De bijdrage onderzoeken van gen x omgevingsinteracties in T2D-risico en in het beïnvloeden van gerelateerde eigenschappen.
Deze onderzoeken kunnen worden uitgevoerd op een hypothesegestuurde, locusspecifieke manier of agnostisch, d.w.z. genoombreed.
Omgevingsvarianten die in overweging moeten worden genomen, zijn onder meer leefstijlfactoren (bijv.
dieet, gemeten aan de hand van vragenlijsten over voedselfrequentie (FFQ), sociaaleconomische maatregelen en ingenomen medicijnen.
|
voortdurende
|
|
EEN
Tijdsspanne: voortdurende
|
a- Het uitvoeren van genetische associatiestudies van T2D en verwante kenmerken (waaronder bloeddruk, serumlipiden, bloedglucose, adipositas) bij West-Afrikanen van diverse etnische groepen.
Benaderingen omvatten genoombrede associatiestudies (inclusief exome-chipgegevens) en kandidaat-gen/loci-associatieanalyses.
|
voortdurende
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Charles N Rotimi, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
3 februari 2009
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
4 februari 2009
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
4 februari 2009
Eerst geplaatst (Geschat)
5 februari 2009
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
18 april 2024
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
17 april 2024
Laatst geverifieerd
21 februari 2024
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 999909070
- 09-HG-N070
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
NEE
Beschrijving IPD-plan
Uitgebreide beoordeling van de toestemmingen met betrekking tot dit protocol door de NHGRI IRB werd uitgevoerd en er werd vastgesteld dat, omdat het initiële toestemmingsproces geen betrekking had op het delen van gegevens van deelnemers en de gerelateerde risico's en de zorgvuldig opgebouwde verstandhouding en vertrouwen met Afrikaanse bevolkingsgroepen en medewerkers , zou het niet gepast zijn om de gegevens van deelnemers te delen.
Indien nodig kan een memorandum ter zake worden verstrekt.
We blijven openstaan voor het beschikbaar stellen van de gegevens door middel van samenwerking, een gebruik van de gegevens die werden beschreven in de initiële toestemmingsformulieren.
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .