Épidémiologie microbienne et sensibilité à la chlorhexidine de la colonisation oropharyngée et intestinale (OroColi)

Dans cette étude prospective multicentrique observationnelle, nous visons à déterminer la prévalence de la colonisation oropharyngée et rectale par des bacilles à Gram négatif dans 4 populations de sujets hospitalisés, et leur sensibilité à la chlorehexidine. Nous prévoyons de recruter 300 sujets dans les services de chirurgie (100 en orthopédie, 100 en chirurgie thoracique et vasculaire, 100 en chirurgie abdominale) et 100 en réanimation. Chaque participant subira un prélèvement oropharyngé au jour 0, au jour 5 et au jour 10 (ou à la sortie), et un prélèvement rectal au jour 0 et au jour 10 ou à la sortie de l'hôpital. La colonisation par les bacilles à Gram négatif sera identifiée, les isolats d'E. coli seront étudiés en termes de phylogénie, de sensibilité aux antimicrobiens et à la chlorhexidine. Le critère principal est de déterminer la prévalence de la colonisation oropharyngée et rectale par des bacilles à Gram négatif. Les critères d'évaluation secondaires sont de déterminer l'incidence de l'acquisition d'une telle colonisation dans un délai de 10 jours ; déterminer les caractéristiques phylogénétiques des isolats d'E. coli ; comparer les caractéristiques phylogénétiques des isolats oropharyngés et rectaux d'E. coli ; comparer les caractéristiques phylogénétiques de la colonisation et des isolats d'infection potentielle à E. coli ; comparer la composition de la colonisation rectale et oropharyngée ; description du microbiote oropharyngé.