Le microbiome des expectorations, de l'urine et des matières fécales chez les personnes en bonne santé et les patients atteints de maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) (COPD)
26 novembre 2018 mis à jour par: Sei Won Lee, Asan Medical Center
Des études approfondies suggèrent que la composition du microbiome des échantillons respiratoires ou des tissus pulmonaires chez les patients atteints de MPOC est différente de la composition des fumeurs en bonne santé.
Le but de cette étude est d'analyser la composition du microbiome de divers échantillons (par ex.
excréments, crachats et urine) et pour décrire la différence de composition entre les patients atteints de MPOC et les fumeurs en bonne santé.
Aperçu de l'étude
Statut
Inconnue
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Après l'introduction de la théorie de l'axe Gut-Lung, des études approfondies ont révélé la diversité des microbiomes parmi les fumeurs en bonne santé et les patients atteints de MPOC à partir des échantillons respiratoires ou des tissus pulmonaires.
Dans l'étude précédente, une différence distincte dans la composition du microbiome dans le tissu pulmonaire entre les fumeurs en bonne santé et les patients atteints de MPOC a été signalée.
Il s'agit d'une étude transversale pour analyser la composition du microbiome de divers échantillons (par ex.
excréments, crachats et urine) et pour comparer la différence de composition entre les patients atteints de MPOC et les fumeurs en bonne santé.
Cette étude aiderait à établir un modèle d'axe intestin-poumon chez l'homme.
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Anticipé)
60
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Corée, République de, 05505
- Recrutement
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Contact:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Numéro de téléphone: +82-2-3010-3990
- E-mail: iseiwon@gmail.com
-
-
Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Tout
Méthode d'échantillonnage
Échantillon non probabiliste
Population étudiée
Groupe MPOC
- Comme ci-dessus
Fumeurs en bonne santé
- Participants ayant des antécédents de tabagisme
- Participants avec des résultats de spirométrie normaux
La description
Critère d'intégration:
- Patients ayant des antécédents de tabagisme d'au moins 10 paquets-année
- Les patients présentant une limitation persistante du débit d'air qui n'était pas entièrement réversible (par ex. volume expiratoire forcé post-bronchodilatateur en 1 seconde/capacité vitale forcée (FEV1/FVC) <0,7)
Critère d'exclusion:
- Patients atteints d'une maladie concomitante susceptible d'interférer avec les résultats de l'étude (par exemple, tumeur maligne, insuffisance cardiaque congestive, troubles cérébrovasculaires, insuffisance rénale chronique, diabète avec complications graves ou hypertension non contrôlée)
- Patients atteints d'une maladie respiratoire autre qu'une maladie pulmonaire obstructive (par exemple, une résection pulmonaire antérieure, un poumon détruit par la tuberculose et une bronchectasie)
- Patients présentant une exacerbation récente (8 semaines avant le dépistage) ou une autre maladie respiratoire
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Autre
- Perspectives temporelles: Transversale
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
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Fumeur en bonne santé
Fumeur en bonne santé avec une valeur de spirométrie normale
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Des échantillons sont obtenus auprès des participants.
Aucune autre intervention n'est nécessaire.
Les échantillons obtenus seront ensuite analysés.
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MPOC
Patients ayant des antécédents de tabagisme d'au moins 10 paquets-année Patients présentant une limitation persistante du débit d'air qui n'était pas entièrement réversible (par ex.
volume expiratoire forcé post-bronchodilatateur en 1 seconde/capacité vitale forcée (FEV1/FVC) <0,7)
|
Des échantillons sont obtenus auprès des participants.
Aucune autre intervention n'est nécessaire.
Les échantillons obtenus seront ensuite analysés.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Diversité alpha mesurée par analyse quantitative de l'unité taxonomique opérationnelle (OTU)
Délai: 1 mois en moyenne
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L'ADN est extrait de chaque échantillon de chaque patient à l'aide d'un kit d'isolement d'ADN.
Les amorces universelles 16S sont utilisées pour l'amplification des gènes d'acide ribonucléique ribosomal (ARNr) 16S avec un système de réaction en chaîne par polymérase (PCR).
Après l'amplification, le séquençage est effectué à l'aide de la base de données GREENGENES, après quoi une analyse métagénomique a été réalisée par la société MD Healthcare à l'aide du logiciel MDx-Pro (Ver.1,
Séoul, Corée du Sud).
L'attribution taxonomique de ces séquences est effectuée avec un seuil d'unité taxonomique opérationnelle (OTU) de 3 %.
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1 mois en moyenne
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Composition du microbiome par analyse métagénomique
Délai: 1 mois en moyenne
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La composition du microbiome est présentée sous forme de graphique à barres.
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1 mois en moyenne
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Biodiversité décrite par l'indice de diversité de Shannon et l'indice de Simpson
Délai: 1 mois en moyenne
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L'indice de Shannon et l'indice de Simpson sont calculés en utilisant des données métagénomiques.
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1 mois en moyenne
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Biodiversité décrite par Analyse en Composantes Principales (ACP)
Délai: 1 mois en moyenne
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L'ACP est réalisée pour toutes les lectures de gènes d'ARNr 16S regroupées à une similarité de 97 %.
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1 mois en moyenne
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Publications et liens utiles
La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.
Publications générales
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Anticipé)
1 décembre 2018
Achèvement primaire (Anticipé)
31 mars 2019
Achèvement de l'étude (Anticipé)
30 septembre 2019
Dates d'inscription aux études
Première soumission
20 novembre 2018
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
26 novembre 2018
Première publication (Réel)
28 novembre 2018
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
28 novembre 2018
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
26 novembre 2018
Dernière vérification
1 novembre 2018
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 2018-0980 (Autre identifiant: M D Anderson Cancer Center)
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Non
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
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